Compte-rendus PoiHL 2018

25/6/2018

Compte rendu du poihl du 25/6/2018

Durée: 1h

Retour sur les Journées LMDZ
------------------------------------------

Ehouarn: CLIMAF est toujours en développement ou non?
Jean-Baptiste: a peur de la non pérénité de la doc. Qui va mettre à jour LMDZpedia?
Ehouarn: manque des choses à la doc "Formation", des HowTos ?
 

Tour de table :
===========

Thibault:
---------

Chantier refonte des traceurs (idée d'Olivier), partir sur un truc plus modulaire pour utiliser différents types de traceurs (LMDZ, INCA, Reprobus, Carbone, ...) en même temps.
Changement de la variable type_trac en tableau de booléen. Voir avec A. Cozic comment elle a fait pour différencier traceurs INCA/Reprobus. Continuer à en discuter.

Adriana:
--------
RAS

Laurent: 
--------
Soucis curie toute la semaine et le week-end
Bouche les trous dans les simus

JB:
---
simulation de brume de glace à Dôme C. MMarche suffisamment bien pour améliorer la physique, bonnes températures, travail en cours

Ehouarn:
--------
Bien noté les Nan de Yann à mettre en option par défaut. A mettre dans la trunk avant le merge.

Lidia:
------
e-contrib
-LMDZ6
Mise à jour de la page Wiki LMDZ6 en cours, avec les simulations Amip Contrôle-Guidage des dernières versions LMDZ6-CM6.

-LMDZ6-Configuration CAUSES
Modifications des fichiers xml month, day et hf = replacement des variables résultats 3D-Modifications nécessaires pour la définition des sous-domaines XIOS. Commit dans LMDZ avec Laurent.

-CMIP6-Amip historiques GMMIP
Définition des éléments de configuration des simulations Amip historiques de GMMIP/Tier1, avec Laurent Li, et Laurent.

Pour les Amip historiques, 3 simulations 1870-2014 du protocole CMIP6 :
une simulation de contrôle,
une simulation avec des SST interannuelles et climatiques,
une simulation avec variation de l'orographie.

Les forçages sont ceux des couplés historiques.
La Data Request est celle des Amip historiques CMIP6.
Les Restarts = restarts homogènes pour les 3 simulations, à partir du couplé historique pour l'année 1870.
 


Le reste est inchangé

---------------------------- POIHL du 4/6/2018
Consolidation LMDZ6 :
=====================
(inchangé)

Plantage/1+1=2/reproductibulité :

1) la simu abrupt4xCO2 est passée en faisant la manip teta comme toi. Est-ce que on accepte cela? Sébastien et Frédéric ont commenté ça déjà. Elle en est en 2099 et le plantage (contourné donc) était en 2059.

2) je pensais avoir envoyé un message mais je le retrouve pas.
En comparant les sorties CMIP6 des simus historical il y a des soucis bizarres sur 6 variables (sur 1000!)
Il y a un pilotage particulier dans LMDZ pour ces sorties genre cllcalipso.
Est-ce qu\u2019il pourrait y avoir un souci OpenMP sur ce pilotage? Pourrait-on le vérifier?
Cela se manifeste ainsi : de temps en temps, pour une période ie une année, les variables ne sont pas sorties. Du coup, l\u2019année suivante, un nouveau fichier apparait. Quand on regarde la continuité il manque une anne ie une
période.

Suivi/lancement des simultions CMIP6 :
======================================
(inchangé)
les monitoring pi/pd/historical
http://webservices2017.ipsl.fr/interMonitoring/tmp/interMonitoring_plot01_H32Jmc_prod/
(en tappant prio dans le rectangle vide après "forcing") sont rassurants :
* des pi et pdCtrl stables en température de surface.
* Une banquise nord estivale qui se rabougrit un peu tôt.
  Mais on est encore à la valeur cible (10^13) en 1980.
  Il en manque 20% en 2000.
* La nadw reste dans une phase haute sur la fin de la simulation.
  Avec un max en 1980.
* La stratégie pi+historical rejoint pd marche une fois de plus !
  Y'a plus qu'à la publier et à en faire une base d'intercomparaison de modèles couplés en pd !

Le modèle chauffe de 0.5-0.6 K en SST entre 1850 et 2000 de 1K en T2m
C'est un peu trop sans doute, mais rien d'insuportable.

La forte sensibilité est confirmée par le 1%CO2 qui chauffe de 6K en T2m sur 150 ans.
C'est en grois la sensibilité (très forte) qu'on avait dans la version 5A.

Configurations / réalisation de simulations :
---------------------------------------------

Préparation des simulations aquaplanètes et amip4K (Ionela)
   Manque l'ozone stratosphérique symmétrique et désaisonalisé.
   Problème des SSTs sur maille mixtes en amip4K.
   Besoin de spécifier le rayon effectif pour des simulations idéalisés (Ionela, en cours)
   Avec toutes les sorties AMIP le temps de calcul est mutiplié par 3!!!

(inchangé ci-dessous)
CFMIP : couplés abrupts (Laurent) DONE (au plantage près); validation scientifique, publication prochaine
        Amip du Deck (Ionela) en attente de discussions en cours sur la banquise
        Lidia (Ensemble amip + une guidée), en attente de la ref
        Aquaplanètes n'co (Ionela)
        cookies, CRELW off (Abderrahmane)

Scenarios (Laurent)
        En attente des forçages ?

Validation scientifique :
   C'est le chair du MIP doit valider.
   Sandrine pour les simulations CFMIP.

Préparation des simulations MR pour le Deck CMIP6 :
---------------------------------------------------

Grand challenge + dynamico :
----------------------------

(inchangé)
HiresMIP (Amip, SST forcées, aerosols plume, LAI forcé)
   Problème identifié sur la lecture des plumes. Corrigé.
   Tests en cours de validation avec Olivier Boucher.
   Tourne pour le moment avec les sources 6.0.15. A passer en 6.1
   Modification de taugl.

Les atlas moulinent trop. Remettre à jour le cache.

Problèmes avec irene.
   Temps de retour ératique.
   Accélération moindre qu'attendu (30% au lieu de x2)

Faire une liste de diffusion sur les niveaux de sortie.

Résolution 25km
   start et limit créés (avec l'aide d'Ehouarn et Laurent)
   Réussi en remplacant nf90_clobber par nf90_hdf5 !!!
   Tester si ca ne change rien et commettre.

Dynamico avance pas mal (Laurent et Abdoul Khadre)
   Parti pour intégrer dans le tunk LMDZ ce qu'il faut et qu'Ehouarn avait rajouter pour tourner avec dynamico
   Branche créé il y a 7 mois.
   Toute les modifs ont été réintégrées.
   Tourne avec dynamique lon lat en 6.1
   Tourne aussi avec dynamico en mode aqua AP/NP,
   en mode Amip/bucket avec AP.
   Dernière étape : faire un merge de la trunk et de cette branche.
   Problèmes de xml pour dynamico

Data request (responsable Laurent et Sandrine)
==============================================
(inchangé)
Evolue toujours au niveau international.
Mais on reste sur la 22.
Le CNRM a mis en place une DR maison avec les sorties qu'on veut absolument voir.


Contrôle Qualité / trunk / scripts
=================================

(inchangé)

Problème de reproductibilité identifié sur la trunk avec install en cours de test (F&F)
   Problème de reproductibilité du forcé dans les configurations install_lmdz.
   Reproductible au premier mois mais pas au second. Même sans orchidee ni lecture d'aérosols (FrédériKs travaillent dessus).

Problèmes identifiés dans tutorial_ada.tar
    Ne marche pas en compilo 2017 -> Retour en arrière à 2013.
    Sans doute le fait qu'il faut passer à mpi_run au lieu de poe
    (à conserver)

install.sh et svn :
    depuis qu'on est sur carey, la version de svn utilisée pour faire le checkout pour
    les sources est très récente. Davantage que celle des SentOS du réseau.
    On ne peut plus utiliser svn sur les versions téléchargées.
    Deux solutions : downgrader carey pour svn faire un svn via ssh sur une machine avec une svn plus ancienne
    A faire

Passer au nouvel orchidee par défaut.
    A faire

install_lmdz.sh marche sous mac !!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!


Articulation convection profonde / convection peu profonde
==========================================================
(inchangé)
* Jean-Yves : toutes les équations sont simples et claires
              en cours de publi.
(inchangé ci dessous)
* Modèle pronostic de densité de poches : en test
* Splitting des poches : en test
* Entrainement convectif / nouvel épluchage (à tester)
* Tube dentifrice (à tester)

Evolution physique/versions futures :
=====================================
(inchangés ci-dessous)
* Jean-Yves, Jean-Philippe et Catherine pensent qu'il faut éliminer une
   partie des précipitations dans les ascendances adiabatiques.
* Eau avec source méthane
* sursaturation
* grille plus groissère en bas pour la convection

Tuning automatique :
====================
Ionela s'y met

(inchangé ci-dessous)
250 simulations sur 19 paramètres en cours d'éxecution
   pour explorer la variabilité de la convection combinée au réglage radiatif.
Les premièers analyses on fait appraître un petit bug dans la gestion des
log/lineaire.

Convergence 1D std / Dephy :
============================
MP travaille dessus en préparation de la réunion HighTune du 14 juin
(inchangé ci-dessous)
Fleur veut qu'on ajoute les profils initiaux dans les sorties standard.
Discussion sur la standardisation des noms des cas :
   majuscules/minuscules
   avec des sous cas par défaut.
   Marie-Pierre étend la discussion.
A quand le 1D couplé, issu de COCOA ou non ? (Marie-Alice)

Publications :
==============
(inchangé ci-dessous)
- Stratocumulus (Arnaud Jam). Finalisation de la partie 3D
- Thermiques / stratocumulus / bords Est (Frédéric). En cours d'écriture
(ci dessous inchangé)
- Couplage / Flux de surface / rafales (Traore)
- Splitting (Jean-Yves)
- Tuning (Ionela/Frédéric)
- Articulation convection peu profonde / profonde ?



Labélisation :
==============
Présentation de LMDZ à la CSOA le 13 juin.
Réponse à un questionaire en ligne du CNRS.
Organiser une réunion d'une demi journée avec les acteurs de LMDZ
    Après les journées utilisateurs. Debrief.
    Par exemple lundi 25 juin. avec une intro en réunion climat.
    Faire un doodle.

tickets trac :
==============

#9      Modifications pour une dynamique commune (terre \u2013 planete)
#11     Menage sur les prints
-> ??? #21     "day_ini" dans "create_etat0_limit" et "gcm"
-> ??? #28     Initialisation problems in cloudth ?
-> Faire test snan et fermer. #30     Pb valeurs nulles/non définies sur configs linux
#32     Concervation de la masse des traceurs dans la dynamique
#34     Calving faux en zoome
Lionel confirme qu'on laisse ouvert le #44     getin_dump et name
-> mail Olivier (B) et on ferme #52     readchlorophyll en OpenMP?
#54     Erreur sur la vorticité en mode zoomé
#55     Constantes non uniformes dans le modèle
#56     Vérifier le calcul des nombres de jours de pluie
#61     Calendrier     Consolidation
#66     Sensibilité au pas de temps de la fermeture stochastique
#67     Traceurs et isotopes.
#70     Conservation de l'énergie avec l'eau
#71     Filtrage de la vorticité
#75     ppm3d non fonctionnel
#76     Sortie epmax
#82     Nouveau calcul de wind10m
#84     Use getin_p instead of getin
--> faire evoluer sur la nécessité de définir les focages en
    surface en absence de chauffage radiatif de l'atmosphère
#85     Rayonnement dans le 1D
#86     Get rid of stop commands
#87     cycle_diurne et iflag_cycle_diurne => Fait. A fermer.
#88     routines cldrag
#89     Problèmes grille zoomée

18/6/2018

Compte rendu du poihl du 18/6/2018

Durée: 1h15mn

Journées LMDZ: quelques éléments de la discussion du mardi après-midi
---------------------

+ comment pérenniser l'outil Climaf ?
+ peut-on utiliser les tracés produits dans un papier ?
+ problème de personnel côté Météo-France avec le départ de Stéphane Sénesi

+ Documentation du modèle:
+ en fait, c'est dans les présentations de la formation qui sont revues tous les ans que se trouve la meilleure doc à jour
+ ajouter aussi LMDZpédia dans lequel on note dans le détail un point particulier sur le modèle
+ un point sur les normes de codage mais j'ai oublié ce que Lionel a dit sur ce point

A quand la prochaine réunion: dans 2 ans ?

Plantages:
--------------
Quelques-unes des simulations CMIP6 se sont plantées sur des hgardfou mais sont reparties en perturbant légèrement l'état de redémarrage du coupleur (AddNoise: effet papillon sur les SST que le coupleur envoie à l'atmosphère au démarrage). Les points de plantages ont été extraits ou en cours de l'être; analyse à suivre.

Reproductibilité:
---------------------
problème de reproductibilité dans le modèle couplé: 2 simulations identiques peuvent diverger au bout d'un temps aléatoire. LMDZ est en cause, on reproduit ce comportement avec LMDZ en bucket sur des enchaînements de simulations de 1 jour. En cours d'analyse.


Trous:
--------
Dans des simulations utilisant le workflow CMIP6, certaines variables calipso peuvent ne pas être écrites pendant une période d'intégration, entraînant des trous dans les séries temporelles de ces variables sorties par XIOS. Là encore le comportement est aléatoire et difficile à analyser. Le groupe plateforme propose donc de lancer les simulations quand même et de publier une procédure pour "boucher les trous" en attendant de trouver la cause de ce dysfonctionnement .


Grand Challenge & Dynamico (Traoré)
---------------------------------------

+ Irène ouvre bientôt "au grand public"
+ il y a un nouveau compilateur qui améliore les performances
+ Irène est fermée du 19 au 21/6
+ il reste une semaine pour le Grand Challenge. Traoré va demander une rallonge de 15 jours
+ Anne analyse les différences de résultats entre Irène et Curie (différences sur les précip entre autres)
+ Dynamico à 50km ancienne physique a tourné 6 mois !

Tour de table :
===============

Marie-Alice:
----------------

1) d’accord avec le retour de Laurent Fairhead sur les trous/plantages/reproductibilité de IPSLCM6.1.4-LR
2) Irene : Echanger les informations sur les performances obtenues sur des cas typiques en vue des demandes d’heures A5 à faire avant le 17 juillet.  Sur Irene, sur ada/successeur et sur occigen.

Jean-Yves: Va commettre le splitting. Le papier avance.
-------------

Laurent: RAS
----------

Marie-Pierre:  RAS
----------------

Lidia:
-------

+ prépare les simus AMIP historiques. Forçages 1870-2014
+ SST existent à l'état brut

Ionela:
-------
- prepare les simus "Amip" CFMIP-3/CMIP6.
- prepare les SSTs Amip pour la periode 1870-2017.
- problème avec les variables cl*calipso dans les simus CMIP6:   faut-il lancer les Amip mois par mois ou années par année - pour pouvoir  boucher/relancer plus facilement ?
  Laurent suggère plutôt année par année.


Adriana:
--------

+ soucis de reproductibilité irène vs curie, identifiés avec Anne pour une config LMDZORINCA, physique standard, 144x142x39, zoom facteur 2 centré sur Europe. Anne a trouvé ensuite la même chose dans d'autres simulations de Arnaud (avec la NP ?), et du "grand challenge" de Abdoul.  A creuser.
+ avait implémenté dans ses configs la possibilité de sortir via XIOS un fichier HF dédié au forçage de Orchidee offline.
Plus rigoureux par rapport à la définition des variables "inst" vs "ave", et utilisable tel quel, sans passer comme d'habitude par une "moulinette".
A informé (à part le poihl) pour l'instant juste les principaux intéressés potentiels coté paléo et Orchidee. Discussions entamées avec Patricia et Josefine.
 



---------------------------- POIHL du 4/6/2018
Consolidation LMDZ6 :
=====================
(inchangé)

Plantage/1+1=2/reproductibulité :

1) la simu abrupt4xCO2 est passée en faisant la manip teta comme toi. Est-ce que on accepte cela? Sébastien et Frédéric ont commenté ça déjà. Elle en est en 2099 et le plantage (contourné donc) était en 2059.

2) je pensais avoir envoyé un message mais je le retrouve pas.
En comparant les sorties CMIP6 des simus historical il y a des soucis bizarres sur 6 variables (sur 1000!)
Il y a un pilotage particulier dans LMDZ pour ces sorties genre cllcalipso.
Est-ce qu\u2019il pourrait y avoir un souci OpenMP sur ce pilotage? Pourrait-on le vérifier?
Cela se manifeste ainsi : de temps en temps, pour une période ie une année, les variables ne sont pas sorties. Du coup, l\u2019année suivante, un nouveau fichier apparait. Quand on regarde la continuité il manque une anne ie une
période.

Suivi/lancement des simultions CMIP6 :
======================================
(inchangé)
les monitoring pi/pd/historical
http://webservices2017.ipsl.fr/interMonitoring/tmp/interMonitoring_plot01_H32Jmc_prod/
(en tappant prio dans le rectangle vide après "forcing") sont rassurants :
* des pi et pdCtrl stables en température de surface.
* Une banquise nord estivale qui se rabougrit un peu tôt.
  Mais on est encore à la valeur cible (10^13) en 1980.
  Il en manque 20% en 2000.
* La nadw reste dans une phase haute sur la fin de la simulation.
  Avec un max en 1980.
* La stratégie pi+historical rejoint pd marche une fois de plus !
  Y'a plus qu'à la publier et à en faire une base d'intercomparaison de modèles couplés en pd !

Le modèle chauffe de 0.5-0.6 K en SST entre 1850 et 2000 de 1K en T2m
C'est un peu trop sans doute, mais rien d'insuportable.

La forte sensibilité est confirmée par le 1%CO2 qui chauffe de 6K en T2m sur 150 ans.
C'est en grois la sensibilité (très forte) qu'on avait dans la version 5A.

Configurations / réalisation de simulations :
---------------------------------------------

Préparation des simulations aquaplanètes et amip4K (Ionela)
   Manque l'ozone stratosphérique symmétrique et désaisonalisé.
   Problème des SSTs sur maille mixtes en amip4K.
   Besoin de spécifier le rayon effectif pour des simulations idéalisés (Ionela, en cours)
   Avec toutes les sorties AMIP le temps de calcul est mutiplié par 3!!!

(inchangé ci-dessous)
CFMIP : couplés abrupts (Laurent) DONE (au plantage près); validation scientifique, publication prochaine
        Amip du Deck (Ionela) en attente de discussions en cours sur la banquise
        Lidia (Ensemble amip + une guidée), en attente de la ref
        Aquaplanètes n'co (Ionela)
        cookies, CRELW off (Abderrahmane)

Scenarios (Laurent)
        En attente des forçages ?

Validation scientifique :
   C'est le chair du MIP doit valider.
   Sandrine pour les simulations CFMIP.

Préparation des simulations MR pour le Deck CMIP6 :
---------------------------------------------------

Grand challenge + dynamico :
----------------------------

(inchangé)
HiresMIP (Amip, SST forcées, aerosols plume, LAI forcé)
   Problème identifié sur la lecture des plumes. Corrigé.
   Tests en cours de validation avec Olivier Boucher.
   Tourne pour le moment avec les sources 6.0.15. A passer en 6.1
   Modification de taugl.

Les atlas moulinent trop. Remettre à jour le cache.

Problèmes avec irene.
   Temps de retour ératique.
   Accélération moindre qu'attendu (30% au lieu de x2)

Faire une liste de diffusion sur les niveaux de sortie.

Résolution 25km
   start et limit créés (avec l'aide d'Ehouarn et Laurent)
   Réussi en remplacant nf90_clobber par nf90_hdf5 !!!
   Tester si ca ne change rien et commettre.

Dynamico avance pas mal (Laurent et Abdoul Khadre)
   Parti pour intégrer dans le tunk LMDZ ce qu'il faut et qu'Ehouarn avait rajouter pour tourner avec dynamico
   Branche créé il y a 7 mois.
   Toute les modifs ont été réintégrées.
   Tourne avec dynamique lon lat en 6.1
   Tourne aussi avec dynamico en mode aqua AP/NP,
   en mode Amip/bucket avec AP.
   Dernière étape : faire un merge de la trunk et de cette branche.
   Problèmes de xml pour dynamico

Data request (responsable Laurent et Sandrine)
==============================================
(inchangé)
Evolue toujours au niveau international.
Mais on reste sur la 22.
Le CNRM a mis en place une DR maison avec les sorties qu'on veut absolument voir.


Contrôle Qualité / trunk / scripts
=================================

(inchangé)

Problème de reproductibilité identifié sur la trunk avec install en cours de test (F&F)
   Problème de reproductibilité du forcé dans les configurations install_lmdz.
   Reproductible au premier mois mais pas au second. Même sans orchidee ni lecture d'aérosols (FrédériKs travaillent dessus).

Problèmes identifiés dans tutorial_ada.tar
    Ne marche pas en compilo 2017 -> Retour en arrière à 2013.
    Sans doute le fait qu'il faut passer à mpi_run au lieu de poe
    (à conserver)

install.sh et svn :
    depuis qu'on est sur carey, la version de svn utilisée pour faire le checkout pour
    les sources est très récente. Davantage que celle des SentOS du réseau.
    On ne peut plus utiliser svn sur les versions téléchargées.
    Deux solutions : downgrader carey pour svn faire un svn via ssh sur une machine avec une svn plus ancienne
    A faire

Passer au nouvel orchidee par défaut.
    A faire

install_lmdz.sh marche sous mac !!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!


Articulation convection profonde / convection peu profonde
==========================================================
(inchangé)
* Jean-Yves : toutes les équations sont simples et claires
              en cours de publi.
(inchangé ci dessous)
* Modèle pronostic de densité de poches : en test
* Splitting des poches : en test
* Entrainement convectif / nouvel épluchage (à tester)
* Tube dentifrice (à tester)

Evolution physique/versions futures :
=====================================
(inchangés ci-dessous)
* Jean-Yves, Jean-Philippe et Catherine pensent qu'il faut éliminer une
   partie des précipitations dans les ascendances adiabatiques.
* Eau avec source méthane
* sursaturation
* grille plus groissère en bas pour la convection

Tuning automatique :
====================
Ionela s'y met

(inchangé ci-dessous)
250 simulations sur 19 paramètres en cours d'éxecution
   pour explorer la variabilité de la convection combinée au réglage radiatif.
Les premièers analyses on fait appraître un petit bug dans la gestion des
log/lineaire.

Convergence 1D std / Dephy :
============================
MP travaille dessus en préparation de la réunion HighTune du 14 juin
(inchangé ci-dessous)
Fleur veut qu'on ajoute les profils initiaux dans les sorties standard.
Discussion sur la standardisation des noms des cas :
   majuscules/minuscules
   avec des sous cas par défaut.
   Marie-Pierre étend la discussion.
A quand le 1D couplé, issu de COCOA ou non ? (Marie-Alice)

Publications :
==============
(inchangé ci-dessous)
- Stratocumulus (Arnaud Jam). Finalisation de la partie 3D
- Thermiques / stratocumulus / bords Est (Frédéric). En cours d'écriture
(ci dessous inchangé)
- Couplage / Flux de surface / rafales (Traore)
- Splitting (Jean-Yves)
- Tuning (Ionela/Frédéric)
- Articulation convection peu profonde / profonde ?



Labélisation :
==============
Présentation de LMDZ à la CSOA le 13 juin.
Réponse à un questionaire en ligne du CNRS.
Organiser une réunion d'une demi journée avec les acteurs de LMDZ
    Après les journées utilisateurs. Debrief.
    Par exemple lundi 25 juin. avec une intro en réunion climat.
    Faire un doodle.

tickets trac :
==============

#9      Modifications pour une dynamique commune (terre \u2013 planete)
#11     Menage sur les prints
-> ??? #21     "day_ini" dans "create_etat0_limit" et "gcm"
-> ??? #28     Initialisation problems in cloudth ?
-> Faire test snan et fermer. #30     Pb valeurs nulles/non définies sur configs linux
#32     Concervation de la masse des traceurs dans la dynamique
#34     Calving faux en zoome
Lionel confirme qu'on laisse ouvert le #44     getin_dump et name
-> mail Olivier (B) et on ferme #52     readchlorophyll en OpenMP?
#54     Erreur sur la vorticité en mode zoomé
#55     Constantes non uniformes dans le modèle
#56     Vérifier le calcul des nombres de jours de pluie
#61     Calendrier     Consolidation
#66     Sensibilité au pas de temps de la fermeture stochastique
#67     Traceurs et isotopes.
#70     Conservation de l'énergie avec l'eau
#71     Filtrage de la vorticité
#75     ppm3d non fonctionnel
#76     Sortie epmax
#82     Nouveau calcul de wind10m
#84     Use getin_p instead of getin
--> faire evoluer sur la nécessité de définir les focages en
    surface en absence de chauffage radiatif de l'atmosphère
#85     Rayonnement dans le 1D
#86     Get rid of stop commands
#87     cycle_diurne et iflag_cycle_diurne => Fait. A fermer.
#88     routines cldrag
#89     Problèmes grille zoomée

11/6/2018

Pas de poihl mais les Journées LMDZ (11-12/6/2018).

4/6/2018

Compte rendu du poihl du 4/6/2018

Durée: 35mn

Consolidation LMDZ6 :
=====================
(inchangé)

Plantage/1+1=2/reproductibulité :

1) la simu abrupt4xCO2 est passée en faisant la manip teta comme toi. Est-ce que on accepte cela? Sébastien et Frédéric ont commenté ça déjà. Elle en est en 2099 et le plantage (contourné donc) était en 2059.

2) je pensais avoir envoyé un message mais je le retrouve pas.
En comparant les sorties CMIP6 des simus historical il y a des soucis bizarres sur 6 variables (sur 1000!)
Il y a un pilotage particulier dans LMDZ pour ces sorties genre cllcalipso.
Est-ce qu\u2019il pourrait y avoir un souci OpenMP sur ce pilotage? Pourrait-on le vérifier?
Cela se manifeste ainsi : de temps en temps, pour une période ie une année, les variables ne sont pas sorties. Du coup, l\u2019année suivante, un nouveau fichier apparait. Quand on regarde la continuité il manque une anne ie une
période.

Suivi/lancement des simultions CMIP6 :
======================================
(inchangé)
les monitoring pi/pd/historical
http://webservices2017.ipsl.fr/interMonitoring/tmp/interMonitoring_plot01_H32Jmc_prod/
(en tappant prio dans le rectangle vide après "forcing") sont rassurants :
* des pi et pdCtrl stables en température de surface.
* Une banquise nord estivale qui se rabougrit un peu tôt.
  Mais on est encore à la valeur cible (10^13) en 1980.
  Il en manque 20% en 2000.
* La nadw reste dans une phase haute sur la fin de la simulation.
  Avec un max en 1980.
* La stratégie pi+historical rejoint pd marche une fois de plus !
  Y'a plus qu'à la publier et à en faire une base d'intercomparaison de modèles couplés en pd !

Le modèle chauffe de 0.5-0.6 K en SST entre 1850 et 2000 de 1K en T2m
C'est un peu trop sans doute, mais rien d'insuportable.

La forte sensibilité est confirmée par le 1%CO2 qui chauffe de 6K en T2m sur 150 ans.
C'est en grois la sensibilité (très forte) qu'on avait dans la version 5A.

Configurations / réalisation de simulations :
---------------------------------------------

Préparation des simulations aquaplanètes et amip4K (Ionela)
   Manque l'ozone stratosphérique symmétrique et désaisonalisé.
   Problème des SSTs sur maille mixtes en amip4K.
   Besoin de spécifier le rayon effectif pour des simulations idéalisés (Ionela, en cours)
   Avec toutes les sorties AMIP le temps de calcul est mutiplié par 3!!!

(inchangé ci-dessous)
CFMIP : couplés abrupts (Laurent) DONE (au plantage près); validation scientifique, publication prochaine
        Amip du Deck (Ionela) en attente de discussions en cours sur la banquise
        Lidia (Ensemble amip + une guidée), en attente de la ref
        Aquaplanètes n'co (Ionela)
        cookies, CRELW off (Abderrahmane)

Scenarios (Laurent)
        En attente des forçages ?

Validation scientifique :
   C'est le chair du MIP doit valider.
   Sandrine pour les simulations CFMIP.

Préparation des simulations MR pour le Deck CMIP6 :
---------------------------------------------------

Grand challenge + dynamico :
----------------------------

(inchangé)
HiresMIP (Amip, SST forcées, aerosols plume, LAI forcé)
   Problème identifié sur la lecture des plumes. Corrigé.
   Tests en cours de validation avec Olivier Boucher.
   Tourne pour le moment avec les sources 6.0.15. A passer en 6.1
   Modification de taugl.

Les atlas moulinent trop. Remettre à jour le cache.

Problèmes avec irene.
   Temps de retour ératique.
   Accélération moindre qu'attendu (30% au lieu de x2)

Faire une liste de diffusion sur les niveaux de sortie.

Résolution 25km
   start et limit créés (avec l'aide d'Ehouarn et Laurent)
   Réussi en remplacant nf90_clobber par nf90_hdf5 !!!
   Tester si ca ne change rien et commettre.

Dynamico avance pas mal (Laurent et Abdoul Khadre)
   Parti pour intégrer dans le tunk LMDZ ce qu'il faut et qu'Ehouarn avait rajouter pour tourner avec dynamico
   Branche créé il y a 7 mois.
   Toute les modifs ont été réintégrées.
   Tourne avec dynamique lon lat en 6.1
   Tourne aussi avec dynamico en mode aqua AP/NP,
   en mode Amip/bucket avec AP.
   Dernière étape : faire un merge de la trunk et de cette branche.
   Problèmes de xml pour dynamico

Data request (responsable Laurent et Sandrine)
==============================================
(inchangé)
Evolue toujours au niveau international.
Mais on reste sur la 22.
Le CNRM a mis en place une DR maison avec les sorties qu'on veut absolument voir.


Contrôle Qualité / trunk / scripts
=================================

(inchangé)

Problème de reproductibilité identifié sur la trunk avec install en cours de test (F&F)
   Problème de reproductibilité du forcé dans les configurations install_lmdz.
   Reproductible au premier mois mais pas au second. Même sans orchidee ni lecture d'aérosols (FrédériKs travaillent dessus).

Problèmes identifiés dans tutorial_ada.tar
    Ne marche pas en compilo 2017 -> Retour en arrière à 2013.
    Sans doute le fait qu'il faut passer à mpi_run au lieu de poe
    (à conserver)

install.sh et svn :
    depuis qu'on est sur carey, la version de svn utilisée pour faire le checkout pour
    les sources est très récente. Davantage que celle des SentOS du réseau.
    On ne peut plus utiliser svn sur les versions téléchargées.
    Deux solutions : downgrader carey pour svn faire un svn via ssh sur une machine avec une svn plus ancienne
    A faire

Passer au nouvel orchidee par défaut.
    A faire

install_lmdz.sh marche sous mac !!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!


Articulation convection profonde / convection peu profonde
==========================================================
(inchangé)
* Jean-Yves : toutes les équations sont simples et claires
              en cours de publi.
(inchangé ci dessous)
* Modèle pronostic de densité de poches : en test
* Splitting des poches : en test
* Entrainement convectif / nouvel épluchage (à tester)
* Tube dentifrice (à tester)

Evolution physique/versions futures :
=====================================
(inchangés ci-dessous)
* Jean-Yves, Jean-Philippe et Catherine pensent qu'il faut éliminer une
   partie des précipitations dans les ascendances adiabatiques.
* Eau avec source méthane
* sursaturation
* grille plus groissère en bas pour la convection

Tuning automatique :
====================
Ionela s'y met

(inchangé ci-dessous)
250 simulations sur 19 paramètres en cours d'éxecution
   pour explorer la variabilité de la convection combinée au réglage radiatif.
Les premièers analyses on fait appraître un petit bug dans la gestion des
log/lineaire.

Convergence 1D std / Dephy :
============================
MP travaille dessus en préparation de la réunion HighTune du 14 juin
(inchangé ci-dessous)
Fleur veut qu'on ajoute les profils initiaux dans les sorties standard.
Discussion sur la standardisation des noms des cas :
   majuscules/minuscules
   avec des sous cas par défaut.
   Marie-Pierre étend la discussion.
A quand le 1D couplé, issu de COCOA ou non ? (Marie-Alice)

Publications :
==============
(inchangé ci-dessous)
- Stratocumulus (Arnaud Jam). Finalisation de la partie 3D
- Thermiques / stratocumulus / bords Est (Frédéric). En cours d'écriture
(ci dessous inchangé)
- Couplage / Flux de surface / rafales (Traore)
- Splitting (Jean-Yves)
- Tuning (Ionela/Frédéric)
- Articulation convection peu profonde / profonde ?

Prochaine réunion des utilisateurs :
====================================
Réunion LMDZ les 11-12 juin. (11 l'après midi et 12 toute la journée)
Reste à voir pour la contribution de Thibaut.
Le discussion du mardi après-midi en visio n'est pas possible.
Derniers mails de rappel envoyé (avec exemple de slide pro/cons)
Et la réunion du comité scientifique?

(inchangé ci-dessous)
Amphi Herpin + caves Esclangon pour les pauses.
14 inscrits pour le lundi
   12 pour le mardi
   5 propositions de présentations.
Doodle pour évaluer les attentes des participants. Très large.
Faire une relance aujourd'hui. Date butoir mercredi. Prog vendredi.

Envoyer un premier mail à lmdz et lmdz-users
* Présentation des versions CMIP6 (Frédéric)
* Présentation de l'évolution de l'outil informatique (IO, ...)
* Apports de XIOS ?
* Présentation des multi-atlas.
* Grand challenge / dynamico (Traore)
* Points sur les cas 1D existants / LES / highTune (Marie-Pierre)
* Présentation des utilisateurs.
* Faire remonter les problèmes.
* Présentation de faits marquants.
* Discussion sur la communication vers les utilisateurs.
Définir un petit comité (Marie-Pierre, Ehouarn, Frédéric + ?)

Faire le point sur la question de la doc d'ici là et pendant.
Est-ce qu'on met en avant LMDZpedia
Et comment on met à jour l'existant ?

Labélisation :
==============
Présentation de LMDZ à la CSOA le 13 juin.
Réponse à un questionaire en ligne du CNRS.
Organiser une réunion d'une demi journée avec les acteurs de LMDZ
    Après les journées utilisateurs. Debrief.
    Par exemple lundi 25 juin. avec une intro en réunion climat.
    Faire un doodle.

tickets trac :
==============

#9      Modifications pour une dynamique commune (terre \u2013 planete)
#11     Menage sur les prints
-> ??? #21     "day_ini" dans "create_etat0_limit" et "gcm"
-> ??? #28     Initialisation problems in cloudth ?
-> Faire test snan et fermer. #30     Pb valeurs nulles/non définies sur configs linux
#32     Concervation de la masse des traceurs dans la dynamique
#34     Calving faux en zoome
Lionel confirme qu'on laisse ouvert le #44     getin_dump et name
-> mail Olivier (B) et on ferme #52     readchlorophyll en OpenMP?
#54     Erreur sur la vorticité en mode zoomé
#55     Constantes non uniformes dans le modèle
#56     Vérifier le calcul des nombres de jours de pluie
#61     Calendrier     Consolidation
#66     Sensibilité au pas de temps de la fermeture stochastique
#67     Traceurs et isotopes.
#70     Conservation de l'énergie avec l'eau
#71     Filtrage de la vorticité
#75     ppm3d non fonctionnel
#76     Sortie epmax
#82     Nouveau calcul de wind10m
#84     Use getin_p instead of getin
--> faire evoluer sur la nécessité de définir les focages en
    surface en absence de chauffage radiatif de l'atmosphère
#85     Rayonnement dans le 1D
#86     Get rid of stop commands
#87     cycle_diurne et iflag_cycle_diurne => Fait. A fermer.
#88     routines cldrag
#89     Problèmes grille zoomée

Tour de table :
===============

Marie-Pierre:
-------------
- Tests des install des 3335 et 3337, 3338 OK.
- Aide Hugo sur les forcages Cindy-Dynamo.

Ionela:
-------
- Simulations tests pour évaluer les runs aqua (rayon des gouttes
et CFC) sur Ada
- Tests sur le tau_gl=2 pour metter la bonne glace de mer par rapport
au run couplé (préconisé par Guillaume)
- Aide Traoré pour les atlas de simu highresMIP

Adriana:
--------
RAS

Laurent:
--------
- A étendu la simu 2xCO2 (avec effet papillon sur la SST du restart du coupleur)
jusqu'à la fin (5 ans restaient)
- Convergence physique-Dynamico: a fait un merge avec la head de la trunk et
travaille à mettre les modifs qu'il faut dans la trunk.

Ehouarn:
--------
- A testé la 3338 sur Ada. OK.
- Rappel: les demandes GENCI A5 (1er novembre 2018-1er novembre 2019)
sont à déposer pour le 5 juin au 5 juillet. Idem pour les demandes
complémentaire A4.

28/5/2018

Compte rendu du poihl du 28/5/2018

Durée : 1h30min


Consolidation LMDZ6 :
=====================

Plantage/1+1=2/reproductibulité :

1) la simu abrupt4xCO2 est passée en faisant la manip teta comme toi. Est-ce que on accepte cela? Sébastien et Frédéric ont commenté ça déjà. Elle en est en 2099 et le plantage (contourné donc) était en 2059.

2) je pensais avoir envoyé un message mais je le retrouve pas. 
En comparant les sorties CMIP6 des simus historical il y a des soucis bizarres sur 6 variables (sur 1000!)
Il y a un pilotage particulier dans LMDZ pour ces sorties genre cllcalipso.
Est-ce qu’il pourrait y avoir un souci OpenMP sur ce pilotage? Pourrait-on le vérifier?
Cela se manifeste ainsi : de temps en temps, pour une période ie une année, les variables ne sont pas sorties. Du coup, l’année suivante, un nouveau fichier apparait. Quand on regarde la continuité il manque une anne ie une
période.

Suivi/lancement des simultions CMIP6 :
======================================

les monitoring pi/pd/historical
http://webservices2017.ipsl.fr/interMonitoring/tmp/interMonitoring_plot01_H32Jmc_prod/
(en tappant prio dans le rectangle vide après "forcing") sont rassurants :
* des pi et pdCtrl stables en température de surface.
* Une banquise nord estivale qui se rabougrit un peu tôt.
  Mais on est encore à la valeur cible (10^13) en 1980.
  Il en manque 20% en 2000.
* La nadw reste dans une phase haute sur la fin de la simulation.
  Avec un max en 1980.
* La stratégie pi+historical rejoint pd marche une fois de plus !
  Y'a plus qu'à la publier et à en faire une base d'intercomparaison de modèles couplés en pd !

Le modèle chauffe de 0.5-0.6 K en SST entre 1850 et 2000 de 1K en T2m
C'est un peu trop sans doute, mais rien d'insuportable.

La forte sensibilité est confirmée par le 1%CO2 qui chauffe de 6K en T2m sur 150 ans.
C'est en grois la sensibilité (très forte) qu'on avait dans la version 5A.

Configurations / réalisation de simulations :
---------------------------------------------

Préparation des simulations aquaplanètes et amip4K (Ionela)
   Manque l'ozone stratosphérique symmétrique et désaisonalisé.
   Problème des SSTs sur maille mixtes en amip4K.
   Besoin de spécifier le rayon effectif pour des simulations idéalisés (Ionela, en cours)

CFMIP : couplés abrupts (Laurent) DONE (au plantage près);  validation scientifique, publication prochaine
        Amip du Deck (Ionela) en attente de discussions en cours sur la banquise
        Lidia (Ensemble amip + une guidée), en attente de la ref
        Aquaplanètes n'co (Ionela)
        cookies, CRELW off (Abderrahmane)

Scenarios (Laurent)
        En attente des forçages ?

Validation scientifique :
   C'est le chair du MIP doit valider.
   Sandrine pour les simulations CFMIP.

Préparation des simulations MR pour le Deck CMIP6 :
---------------------------------------------------

Grand challenge + dynamico :
----------------------------

HiresMIP (Amip, SST forcées, aerosols plume, LAI forcé)
   Problème identifié sur la lecture des plumes. Corrigé.
   Tests en cours de validation avec Olivier Boucher.
   Tourne pour le moment avec les sources 6.0.15. A passer en 6.1
   Modification de taugl.

Les atlas moulinent trop. Remettre à jour le cache.

Problèmes avec irene.
   Temps de retour ératique.
   Accélération moindre qu'attendu (30% au lieu de x2)

Faire une liste de diffusion sur les niveaux de sortie.

Résolution 25km
   start et limit créés (avec l'aide d'Ehouarn et Laurent)
   Réussi en remplacant nf90_clobber par nf90_hdf5 !!!
   Tester si ca ne change rien et commettre.

Dynamico avance pas mal (Laurent et Abdoul Khadre)
   Parti pour intégrer dans le tunk LMDZ ce qu'il faut et qu'Ehouarn avait rajouter pour tourner avec dynamico
   Branche créé il y a 7 mois.
   Toute les modifs ont été réintégrées.
   Tourne avec dynamique lon lat en 6.1
   Tourne aussi avec dynamico en mode aqua AP/NP,
   en mode Amip/bucket avec AP.
   Dernière étape : faire un merge de la trunk et de cette branche.
   Problèmes de xml pour dynamico

Data request (responsable Laurent et Sandrine)
==============================================
Evolue toujours au niveau international.
Mais on reste sur la 22.
Le CNRM a mis en place une DR maison avec les sorties qu'on veut absolument voir.


Contrôle Qualité / trunk / scripts
=================================

(inchangé)

Problème de reproductibilité identifié sur la trunk avec install en cours de test (F&F)
   Problème de reproductibilité du forcé dans les configurations install_lmdz.
   Reproductible au premier mois mais pas au second. Même sans orchidee ni lecture d'aérosols (FrédériKs travaillent dessus).

Problèmes identifiés dans tutorial_ada.tar
    Ne marche pas en compilo 2017 -> Retour en arrière à 2013.
    Sans doute le fait qu'il faut passer à mpi_run au lieu de poe
    (à conserver)

install.sh et svn :
    depuis qu'on est sur carey, la version de svn utilisée pour faire le checkout pour
    les sources est très récente. Davantage que celle des SentOS du réseau.
    On ne peut plus utiliser svn sur les versions téléchargées.
    Deux solutions : downgrader carey pour svn faire un svn via ssh sur une machine avec une svn plus ancienne
    A faire

Passer au nouvel orchidee par défaut.
    A faire

install_lmdz.sh marche sous mac !!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!


Articulation convection profonde / convection peu profonde
==========================================================
* Jean-Yves : toutes les équations sont simples et claires
              en cours de publi.
(inchangé ci dessous)
* Modèle pronostic de densité de poches : en test
* Splitting des poches : en test
* Entrainement convectif / nouvel épluchage (à tester)
* Tube dentifrice (à tester)

Evolution physique/versions futures :
=====================================
(inchangés ci-dessous)
* Jean-Yves, Jean-Philippe et Catherine pensent qu'il faut éliminer une
   partie des précipitations dans les ascendances adiabatiques.
* Eau avec source méthane
* sursaturation
* grille plus groissère en bas pour la convection

Tuning automatique :
====================
250 simulations sur 19 paramètres en cours d'éxecution
   pour explorer la variabilité de la convection combinée au réglage radiatif.
Les premièers analyses on fait appraître un petit bug dans la gestion des
log/lineaire.

Convergence 1D std / Dephy :
============================
Fleur veut qu'on ajoute les profils initiaux dans les sorties standard.
Discussion sur la standardisation des noms des cas :
   majuscules/minuscules
   avec des sous cas par défaut.
   Marie-Pierre étend la discussion.
A quand le 1D couplé, issu de COCOA ou non ? (Marie-Alice)

Publications :
==============
- Stratocumulus (Arnaud Jam). Finalisation de la partie 3D
- Thermiques / stratocumulus / bords Est (Frédéric). En cours d'écriture
(ci dessous inchangé)
- Couplage / Flux de surface / rafales (Traore)
- Splitting (Jean-Yves)
- Tuning (Ionela/Frédéric)
- Articulation convection peu profonde / profonde ?

Prochaine réunion des utilisateurs :
====================================
Réunion LMDZ les 11-12 juin.
Amphi Herpin + caves Esclangon pour les pauses.
14 inscrits pour le lundi
   12 pour le mardi
   5 propositions de présentations.
Doodle pour évaluer les attentes des participants. Très large.
Faire une relance aujourd'hui. Date butoir mercredi. Prog vendredi.

Envoyer un premier mail à lmdz et lmdz-users
* Présentation des versions CMIP6 (Frédéric)
* Présentation de l'évolution de l'outil informatique (IO, ...)
* Apports de XIOS ?
* Présentation des multi-atlas.
* Grand challenge / dynamico (Traore)
* Points sur les cas 1D existants / LES / highTune (Marie-Pierre)
* Présentation des utilisateurs.
* Faire remonter les problèmes.
* Présentation de faits marquants.
* Discussion sur la communication vers les utilisateurs.
Définir un petit comité (Marie-Pierre, Ehouarn, Frédéric + ?)

Faire le point sur la question de la doc d'ici là et pendant.
Est-ce qu'on met en avant LMDZpedia
Et comment on met à jour l'existant ?

Labélisation :
==============
Présentation de LMDZ à la CSOA le 13 juin.
Réponse à un questionaire en ligne du CNRS.
Organiser une réunion d'une demi journée avec les acteurs de LMDZ
    Après les journées utilisateurs. Debrief.
    Par exemple lundi 25 juin. avec une intro en réunion climat.
    Faire un doodle.

tickets trac :
==============
Ionela a regardé #87 sur le cycle diurne : va commettre.

#9      Modifications pour une dynamique commune (terre \u2013 planete)
#11     Menage sur les prints
-> ??? #21     "day_ini" dans "create_etat0_limit" et "gcm"
-> ??? #28     Initialisation problems in cloudth ?
-> Faire test snan et fermer. #30     Pb valeurs nulles/non définies sur configs linux
#32     Concervation de la masse des traceurs dans la dynamique
#34     Calving faux en zoome
Lionel confirme qu'on laisse ouvert le #44     getin_dump et name
-> mail Olivier (B) et on ferme #52     readchlorophyll en OpenMP?
#54     Erreur sur la vorticité en mode zoomé
#55     Constantes non uniformes dans le modèle
#56     Vérifier le calcul des nombres de jours de pluie
#61     Calendrier     Consolidation
#66     Sensibilité au pas de temps de la fermeture stochastique
#67     Traceurs et isotopes.
#70     Conservation de l'énergie avec l'eau
#71     Filtrage de la vorticité
#75     ppm3d non fonctionnel
#76     Sortie epmax
#82     Nouveau calcul de wind10m
#84     Use getin_p instead of getin
--> faire evoluer sur la nécessité de définir les focages en
    surface en absence de chauffage radiatif de l'atmosphère
#85     Rayonnement dans le 1D
#86     Get rid of stop commands
#87     cycle_diurne et iflag_cycle_diurne
#88     routines cldrag
#89     Problèmes grille zoomée

Tour de table :
===============

Traore :
--------
cf plus haut.
Mail de genci pour un prix HPC (10 keuros + 200000 heures de calcul)

Marie-Pierre :
--------------
Donne un coup de main à Hugo pour définir une variante de cindy-dynamico.
install OK

Laurent :
---------
cf+O

Frédérique :
------------
Va demain à Toulouse pour discuter de l'ANR de Fabienne sur
les sites instrumentés.
Vise à caractériser le rôle des hétéorgénéité sur les différents
    sites français.

Lidia :
-------
cf+O

Ionela :
--------
Pour amip, à partir des dernières SSTs PCMDI, a préparé les limit
sur ada. Soucis : le ce0l de libiGCM est compilé en séquentiel
   et executé en parallèle.

Jean-Yves :
-----------
cf+O

Ehouarn :
---------
Le comité utilisateurs a obtenu que l'idris ouvre une liste de
diffusion sur les soucis machine.
Dernières versions OK (3333)

Abderrahmane :
--------------
Passe

Adriana :
---------
Passe

Frédéric :
----------
Travaille sur le tuning et les papiers.

14/5/2018

Compte rendu du poihl du 14/5/2018

Durée : 30mn!


Consolidation LMDZ6 :
=====================
- Ajout des "implicit none" par JY (pas de surprises dans les déclarations)

(inchangé ci-dessous)
Plantage/1+1=2/reproductibulité :
   Perte de reproductibilité.
   Finalement, même avec options moins aggressives et ajout d'une barrière dans la lecture de l'ozone.

   Problème de restartabilité du couplé : résolu


Lancement des simulations :
===========================
- La piControl est partie, plusieurs historical aussi, l'abrupte CO2 et 1% CO2
  aussi.
- L'abrupte 0.5xCO2 et l'abrupte 2xCO2 (CFMIP) sont parties aussi.
- NB: L'historical est doublée pour palier le problème de reproductibilité.

(inchangé ci-dessous)
La série de simulation piControl-spinup, piControl, historical 61-01
   a été définitivement choisie
   Simulation piControl officielle en machine.
   Elle démarre à l'année 100 de la piControl-spinup et se superpose avec
   On va donc laisser tourner les deux par sécurité.

   Lancement historical à partir de l'année 20 aujourd'hui.
   + des spinup de simulations paléo.

Le modèle est donc en production (malgré encore quelques soucis avec les xml concernant les axes non géographiques).


Configurations / réalisation de simulations :
---------------------------------------------

(inchangé ci-dessous)
Amip : discussion sur la banquise relancée par mail
   Francis envoie des propositions de tests.

Besoin de spécifier le rayon effectif pour des simulations
   idéalisés (Ionela, en cours)

(inchangé)
Préparation des simulations aquaplanètes et amip4K (Ionela)
   Manque l'ozone stratosphérique symmétrique et désaisonalisé.
   Problème des SSTs sur maille mixtes en amip4K.

CFMIP : Laurent (couplés, abrupts), Abderrahmane (cookies, CRELW off)
        Lidia (Ensemble amip + guidé, sauf celle du Deck), Ionela (amip du deck
        et multi config, aqua n'co) Scenarios : Laurent ?


Préparation des simulations MR pour le Deck CMIP6 :
---------------------------------------------------

Contrôle des sources :
----------------------

Grand challenge + dynamico :
----------------------------
- Traoré a trouvé quelques routines qui violent la séparation
physique/dynamique:
 scaleheight dans regr_pr_time_av_m.F90 (mais même pas utilisé)
 omeg et rad dans slab_heat_transp_mod.F90
 anneeref dans regr_horiz_time_climoz.F90 (à remplacer par ennee_ref?)
... a nettoyer... (Ehouarn)

- Spin-up de HighresMIP en cours sur Irene. On boucle 5 fois deux ans sur
 les années 48-50.
- Pb avec HDF5 1.18 et 1.1 qui ne fonctionnent pas. Du coup on utilise la 1.20
- Perfomances sur Irene: travail en cours.
- La convergence avec la trunk est quasi-finie, mais il reste du boulot... On a
  une version qui en LMDZOR donne les mêmes résultats et en aquaplanète on doit
  réagencre les call pour bien initialiser XIOS and co.

Data request (responsable Laurent et Sandrine)
==============================================
(inchangé ci-dessous)
Vérification ?


Contrôle Qualité / trunk / scripts
==================================

(inchangé ci-dessous)
Problème de reproductibilité identifié sur la trunk avec install
    en cours de test (F&F)
   Problème de reproductibilité du forcé dans les configurations
   install_lmdz.
   Reproductible au premier mois mais pas au second. Même sans orchidee
   ni lecture d'aérosols (FrédériKs travaillent dessus).

Bug quand on veut enchainer les simulations avec lecture des aérosols annuels.
    iday==0 -> iday==1 dans aerosols_interp.sh. Commis (Frédéric)

Problèmes identifiés dans tutorial_ada.tar
    Ne marche pas en compilo 2017 -> Retour en arrière à 2013.
    Sans doute le fait qu'il faut passer à mpi_run au lieu de poe
    (à conserver)

install.sh et svn :
    depuis qu'on est sur carey, la version de svn utilisée pour faire
    le checkout pour
    les sources est très récente. Davantage que celle des SentOS du réseau.
    On ne peut plus utiliser svn sur les versions téléchargées.
    Deux solutions : downgrader carey pour svn
                     faire un svn via ssh sur une machine avec une svn
                     plus ancienne
    A faire

Passer au nouvel orchidee par défaut.
    A faire

install_lmdz.sh marche sous mac !!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!


Articulation convection profonde / convection peu profonde
==========================================================
(inchangé ci dessous)
* Modèle pronostic de densité de poches : en test
* Splitting des poches : en test
* Entrainement convectif / nouvel épluchage (à tester)
* Tube dentifrice (à tester)

Evolution physique/versions futures :
=====================================
(inchangés ci-dessous)
* Jean-Yves, Jean-Philippe et Catherine pensent qu'il faut éliminer une
   partie des précipitations dans les ascendances adiabatiques.
* Eau avec source méthane
* sursaturation
* grille plus groissère en bas pour la convection


Tuning automatique :
====================

Journée High-tune: c'est fait! C'est sous svn avec mot de passe.
Avancées sur les métriques (plusieures variable et sur tout le profil)
Reste à voir pour évaluer sur des moyennes temporelles et spatiales.


Convergence 1D std / Dephy :
============================
(inchangé ci-dessous)
Discussion sur la standardisation des noms des cas :
   majuscules/minuscules
   avec des sous cas par défaut.
   Marie-Pierre étend la discussion.
A quand le 1D couplé, issu de COCOA ou non ? (Marie-Alice)


Publications :
==============
(Inchangé)
- Stratocumulus (Arnaud Jam)
- Thermiques / stratocumulus / bords Est (Frédéric)
- Couplage / Flux de surface / rafales (Traore)
- Splitting (Jean-Yves)
- Tuning (Ionela/Frédéric)
- Articulation convection peu profonde / profonde ?

Prochaine réunion des utilisateurs :
====================================
L'annonce a été envoyée.
Comité d'organisation: Fred, Ehouarn, Marie-Pierre, Ionela, Adriana
Penser à soliciter des présentations

(inchangé ci-dessous)
Réunion LMDZ les 11-12 juin.
Amphi Herpin + caves Esclangon pour les pauses.
* Présentation des versions CMIP6
* Présentation de l'évolution de l'outil informatique (IO, atlas, ...)
* Présentation des utilisateurs.
* Faire remonter les problèmes.
* Présentation de faits marquants.
* Discussion sur la communication vers les utilisateurs.

Faire le point sur la question de la doc d'ici là et pendant.

Labélisation :
==============
(inchangé ci-dessous)
Présentation de LMDZ à la CSOA le 14 juin.
Réponse à un questionaire en ligne du CNRS.
Organiser une réunion d'une demi journée avec les acteurs de LMDZ
    Après les journées utilisateurs. Debrief.
    Par exemple lundi 25 juin. avec une intro en réunion climat.
    Faire un doodle.


tickets trac :
==============
Laurent a fait du ménage.

A regarder #87 sur le cycle diurne : va commettre.

#9      Modifications pour une dynamique commune (terre \u2013 planete)
#11     Menage sur les prints
-> ??? #21     "day_ini" dans "create_etat0_limit" et "gcm"
-> ??? #28     Initialisation problems in cloudth ?
-> Faire test snan et fermer. #30     Pb valeurs nulles/non définies sur configs linux
#32     Concervation de la masse des traceurs dans la dynamique
#34     Calving faux en zoome
Lionel confirme qu'on laisse ouvert le #44     getin_dump et name
-> mail Olivier (B) et on ferme #52     readchlorophyll en OpenMP?
#54     Erreur sur la vorticité en mode zoomé
#55     Constantes non uniformes dans le modèle
#56     Vérifier le calcul des nombres de jours de pluie
#61     Calendrier     Consolidation
#66     Sensibilité au pas de temps de la fermeture stochastique
#67     Traceurs et isotopes.
#70     Conservation de l'énergie avec l'eau
#71     Filtrage de la vorticité
#75     ppm3d non fonctionnel
#76     Sortie epmax
#82     Nouveau calcul de wind10m
#84     Use getin_p instead of getin
--> faire evoluer sur la nécessité de définir les focages en
    surface en absence de chauffage radiatif de l'atmosphère
#85     Rayonnement dans le 1D
#86     Get rid of stop commands
#87     cycle_diurne et iflag_cycle_diurne
#88     routines cldrag
#89     Problèmes grille zoomée


Tour de table :
===============

Traoré :
--------
A été avec Fred à la réunion de préparation de COCOA. Discussions sur les
simulations LES et comparaisons avec LMDZ-1D.

Jean-Yves:
----------
Continue de travailler sur le splitting. Doit commettre.

Laurent:
--------
RAS

Ehouarn:
--------
- Test du lundi sur la 3319 (avec les implicit none de J-Y) OK.
- CU Idris vendredi

7/5/2018

Pas de poihl

30/4/2018

Compte rendu du poihl du 30/4/2018

Durée : 1h35min


Consolidation LMDZ6 :
=====================

Plantage/1+1=2/reproductibulité :
   Perte de reproductibilité.
   Finalement, même avec options moins aggressives et ajout d'une barrière dans la lecture de l'ozone.

   Problème de restartabilité du couplé : résolu


Lancement des simulations :
===========================

La série de simulation piControl-spinup, piControl, historical 61-01 a été définitivement choisie
   Simulation piControl officielle en machine.
   Elle démarre à l'année 100 de la piControl-spinup et se superpose avec
   On va donc laisser tourner les deux par sécurité.

   Lancement historical à partir de l'année 20 aujourd'hui.
   + des spinup de simulations paléo.

Le modèle est donc en production (malgré encore quelques soucis avec les xml concernant les axes non géographiques).


Configurations / réalisation de simulations :
---------------------------------------------

Amip : discussion sur la banquise relancée par mail

Francis envoie des propositions de tests.

Besoin de spécifier le rayon effectif pour des simulations idéalisés (Ionela, en cours)

(inchangé)
Préparation des simulations aquaplanètes et amip4K (Ionela)
   Manque l'ozone stratosphérique symmétrique et désaisonalisé.
   Problème des SSTs sur maille mixtes en amip4K.

CFMIP : Laurent (couplés, abrupts), Abderrahmane (cookies, CRELW off)
        Lidia (Ensemble amip + guidé, sauf celle du Deck), Ionela (amip du deck
        et multi config, aqua n'co) Scenarios : Laurent ?


Préparation des simulations MR pour le Deck CMIP6 :
---------------------------------------------------

Contrôle des sources :
----------------------
Jean-Yves a trouvé des F90 sans implicit none.
   9 fichiers. A regarder.

Grand challenge + dynamico :
----------------------------
Comment baptise-t-on les simulations 512-360 (~50km) ?
    Réponse : IPSL-CM6A-HR

Data request (responsable Laurent et Sandrine)
==============================================
Vérification ?

Contrôle Qualité / trunk / scripts
==================================

Problème de reproductibilité identifié sur la trunk avec install en cours de test (F&F)
   Problème de reproductibilité du forcé dans les configurations install_lmdz.
   Reproductible au premier mois mais pas au second. Même sans orchidee ni lecture d'aérosols (FrédériKs travaillent dessus).

Bug quand on veut enchainer les simulations avec lecture des aérosols annuels.
    iday==0 -> iday==1 dans aerosols_interp.sh. Commis (Frédéric)

Problèmes identifiés dans tutorial_ada.tar
    Ne marche pas en compilo 2017 -> Retour en arrière à 2013.
    Sans doute le fait qu'il faut passer à mpi_run au lieu de poe
    (à conserver)

install.sh et svn :
    depuis qu'on est sur carey, la version de svn utilisée pour faire le checkout pour
    les sources est très récente. Davantage que celle des SentOS du réseau.
    On ne peut plus utiliser svn sur les versions téléchargées.
    Deux solutions : downgrader carey pour svn
                     faire un svn via ssh sur une machine avec une svn
                     plus ancienne
    A faire

Passer au nouvel orchidee par défaut.
    A faire

install_lmdz.sh marche sous mac !!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!


Articulation convection profonde / convection peu profonde
==========================================================
(inchangé ci dessous)
* Modèle pronostic de densité de poches : en test
* Splitting des poches : en test
* Entrainement convectif / nouvel épluchage (à tester)
* Tube dentifrice (à tester)

Evolution physique/versions futures :
=====================================
(inchangés ci-dessous)
* Jean-Yves, Jean-Philippe et Catherine pensent qu'il faut éliminer une
   partie des précipitations dans les ascendances adiabatiques.
* Eau avec source méthane
* sursaturation
* grille plus groissère en bas pour la convection


Tuning automatique :
====================

3 jours high-tune de mecredi à vendredi.
Version htuner_v0.11.tar à disposition.
Tout marche.

Passage sous svn

250 simulations sur 19 paramètres en cours d'éxecution
   pour explorer la variabilité de la convection combinée au réglage radiatif.


Convergence 1D std / Dephy :
============================
Discussion sur la standardisation des noms des cas :
   majuscules/minuscules
   avec des sous cas par défaut.
   Marie-Pierre étend la discussion.
A quand le 1D couplé, issu de COCOA ou non ? (Marie-Alice)


Publications :
==============
(Inchangé)
- Stratocumulus (Arnaud Jam)
- Thermiques / stratocumulus / bords Est (Frédéric)
- Couplage / Flux de surface / rafales (Traore)
- Splitting (Jean-Yves)
- Tuning (Ionela/Frédéric)
- Articulation convection peu profonde / profonde ?

Prochaine réunion des utilisateurs :
====================================
Réunion LMDZ les 11-12 juin.
Amphi Herpin + caves Esclangon pour les pauses.
Envoyer un premier mail à lmdz et lmdz-users
* Présentation des versions CMIP6
* Présentation de l'évolution de l'outil informatique (IO, atlas, ...)
* Présentation des utilisateurs.
* Faire remonter les problèmes.
* Présentation de faits marquants.
* Discussion sur la communication vers les utilisateurs.
Définir un petit comité (Marie-Pierre, Ehouarn, Frédéric + ?)
Marie-Pierre a envoyé un premier mail.

Faire le point sur la question de la doc d'ici là et pendant.

Labélisation :
==============
Présentation de LMDZ à la CSOA le 14 juin.
Réponse à un questionaire en ligne du CNRS.
Organiser une réunion d'une demi journée avec les acteurs de LMDZ
    Après les journées utilisateurs. Debrief.
    Par exemple lundi 25 juin. avec une intro en réunion climat.
    Faire un doodle.


tickets trac :
==============
A regardé #87 sur le cycle diurne : va commettre.

(inchangé)
#9      Modifications pour une dynamique commune (terre \u2013 planete)
#11     Menage sur les prints
-> ??? #21     "day_ini" dans "create_etat0_limit" et "gcm"
-> ??? #28     Initialisation problems in cloudth ?
-> Faire test snan et fermer. #30     Pb valeurs nulles/non définies sur configs linux
#32     Concervation de la masse des traceurs dans la dynamique
#34     Calving faux en zoome
-> mail Lionel et on ferme #44     getin_dump et name
-> mail Olivier (B) et on ferme #52     readchlorophyll en OpenMP?
#54     Erreur sur la vorticité en mode zoomé
#55     Constantes non uniformes dans le modèle
#56     Vérifier le calcul des nombres de jours de pluie
#61     Calendrier     Consolidation
-> mail à Frédéric et fermer #62     Problème avec les variables SAVE dans yamada4?
#66     Sensibilité au pas de temps de la fermeture stochastique
#67     Traceurs et isotopes.
#70     Conservation de l'énergie avec l'eau
#71     Filtrage de la vorticité
-> Réunir avec 89 #74     grossismx
#75     ppm3d non fonctionnel
#76     Sortie epmax
-> Fermer en retrouvant les numéros de révision svn 2523 #77     Fréquence des fichiers aérosols
#82     Nouveau calcul de wind10m
-> Corrigé par Jean-Yves, svn 3000 #83     Mais où est donc passée la prise en compte de la ALP conditionnelle?
#84     Use getin_p instead of getin
--> faire evoluer sur la nécessité de définir les focages en
    surface en absence de chauffage radiatif de l'atmosphère
         #85     Rayonnement dans le 1D
#87     cycle_diurne et iflag_cycle_diurne
#88     routines cldrag
#89     Problèmes grille zoomée


Tour de table :
===============

Marie-Alice :
-------------
Pousse à venir à la prospective du pôle.

Ehouarn :
---------
RAS sur les tests.
Question 1D : cas radiatif/convectif tout bête ?
  rce_oce_les avec radiatif imposé
  eq_rd_cv avec radiatif interactif (continental ou océanique
     suivant que surf_type = 0 ou 1 )
La FAQ LMDZ est fausse pour install.
  Comment fait-on ?
  http://lmdz.lmd.jussieu.fr/utilisateurs/guides

Jean-Yves :
-----------
S'est mis à high-tune.

Francis :
---------
Questions sur les flux dynamiques Vq
dynzon n'est pas activé dans CMIP. Faut-il et peut-on activer

  dynzon dans les simulations. Si oui tout le temps ou pas.
  Attention au problème du calendrier.
  Comment sortir jour par jour ?

dynzon marche mais sans tenir compte du calendrier vrai.

  Demande en plus une petite modif sur libigcm.

regardé ce qui est sorti dans la physique :

  * vq et ve intégré sur la verticale.
  * fait apparaître beaucoup de bruit.
  * Pas trop grave sur vq et vgz, mais problématique pour ve.

Problème de décallage temporel entre dynzon et la physique.

  On peut améliorer en ajoutant la motité de l'incrément
  de la physique. Il faudrait mettre en entrée du calcul
  dans la physique u+(u_seri-u)/2

La question se pose de ne pas distribuer des variables aussi

  bruitées.

Francis prend la responsabilité de dynzon et d'une sortie
  minimum de vorticité dans la physique, et éventuellement
  des sorties dynamiques 3D XIOS.

Frédéric :
----------
Travaille beaucoup sur le tuning.

23/4/2018

Compte rendu du poihl du 23/4/2018

Durée : 1h30min

Consolidation LMDZ6 :
=====================

Plantage/1+1=2/reproductibulité :
   Perte de reproductibilité.

   Peut-être retrouvée après un ajout de barrière dans la lecture de l'ozone.
   Peut-être combiné avec des options de compilation trop agressive.

   Problème de restartabilité :
   le couplé faisait changer les résultats quand on modifiait la date de début du calendrier. Problèmes dans Nemo et Orchidee. Résolu.
   En revanche, le calendrier vraifait qu'on n'est jamais complètement reproductible quand on change la date de début. Vive le calendrier en 360 jours !

   Soucis identifiés sur la data request


Lancement des simulations :
===========================

La série de simulation piControl-spinup, piControl, historical 61-01 va être privilégiée.
   On ne rejoue pas les 100 ans de piControl-spinup.
   On rebranche un piControl avec les sources definitifs mercredi.
   Et on branche un historical en 1870, 20 ans après le début du piControl

Suivi de la version figée avec check-list de lancement :
   http://forge.ipsl.jussieu.fr/igcmg/wiki/IPSLCM6/IPSL-CM6A-LR


Configurations / réalisation de simulations :
---------------------------------------------

Amip :
   Vérifier qu'on tourne avec le découpage des côtes du couplé.
   Relancer Guillaume pour savoir si on fait quelque chose sur la banquise.
   A relancer avec Jean-Bapiste.

Besoin de spécifier le rayon effectif.
   Deux rayons rad_chaud 1 et 2.
   Faire des test avec cdnc=n pour voir quelle est la taille des gouttes équivalente
   Ionela a lancé des simulations avec une version ancienne OK
   Mais version du 16 avril très bizare.

(inchangé)
Préparation des simulations aquaplanètes et amip4K (Ionela)
   Manque l'ozone stratosphérique symmétrique et désaisonalisé.
   Problème des SSTs sur maille mixtes en amip4K.

CFMIP : Laurent (couplés, abrupts), Abderrahmane (cookies, CRELW off)
        Lidia (Ensemble amip + guidé, sauf celle du Deck), Ionela (amip du deck et multi config, aqua n'co) Scenarios : Laurent ?


Préparation des simulations MR pour le Deck CMIP6 :
---------------------------------------------------

Contrôle des sources :
----------------------
Jean-Yves a trouvé des F90 sans implicit none.
   9 fichiers. A regarder.

Grand challenge + dynamico :
----------------------------
Machine redémarrée.

Data request (responsable Laurent et Sandrine)
=====================================
Faire le travail de vérification sur les sorties des piControl et pi-spinup.

Contrôle Qualité / trunk / scripts
========================

Problème de reproductibilité identifié sur la trunk avec install en cours de test (F&F)

Bug quand on veut enchainer les simulations avec lecture des aérosols annuels.
    iday==0 -> iday==1 dans aerosols_interp.sh. A commettre (Frédéric)

Problèmes identifiés dans tutorial_ada.tar
    Ne marche pas en compilo 2017 -> Retour en arrière à 2013.
    Sans doute le fait qu'il faut passer à mpi_run au lieu de poe

    Interpolation des aérosols ne tournait plus lancée par un job.
        Passage du job d'initialisation en "multisep" (merci Ehouarn, CR précédent)
        avec une partie parallèle (pour allouer de la mémoire à ce0l) et une séquentielle (pour l'interpollation).

install.sh et svn :
    depuis qu'on est sur carey, la version de svn utilisée pour faire le checkout pour les sources est très récente.       Davantage que celle des SentOS du réseau.
    On ne peut plus utiliser svn sur les versions téléchargées.
    Deux solutions : downgrader carey pour svn
                     faire un svn via ssh sur une machine avec une svn
                     plus ancienne

Frédéric a créé des modips*tar pour la branche
    modipsl.20180405.IPSLCM6.0.15.tar.gz

Passer au nouvel orchidee par défaut.

Articulation convection profonde / convection peu profonde
==========================================================
* Modèle pronostic de densité de poches : en test
* Splitting des poches : en test (inchangé ci dessous)
* Entrainement convectif / nouvel épluchage (à tester)
* Tube dentifrice (à tester)

Evolution physique/versions futures :
=====================================
(inchangés ci-dessous)
* Jean-Yves, Jean-Philippe et Catherine pensent qu'il faut éliminer une partie des précipitations dans les ascendances adiabatiques.
* Eau avec source méthane
* sursaturation
* grille plus groissère en bas pour la convection

Tuning automatique :
=================

Préparation des 3 jours high-tune

Passage sous git ou svn ?

Test des scripts high tune le jeudi après midi en vue de l'atelier.
   A fait apparaitre que rstudio n'était pas disponible sur les machines.
   En renvanche, ca marche sur le PC enseignement de Marie-Pierre.
   Penser à compiler le 1D sans l'option debug pour accélerer (facteur 3 ?)
   les séries de simulations.

Préparation de 250 simulations sur 19 paramètres pour explorer la variabilité
   de la convection cobinée au réglage radiatif.
   Simulations réalisées en 1D (1min par simulation pour 20 ans)
   sur le cas d'équilibre radiatif-convectif de Caroline.
   Les tentatives de lancement en 3D on fait apparaitre les problèmes de
   reproductibilité puis les problèmes de lecture des aérosols (voir plus haut)
   La première simulation est en machine.

Convergence 1D std / Dephy :
============================

Marie-Pierre a repris les forcages LES arm_cu de Fleur. Mais les flux de surface
   sur la moitié du temps. Toujours pas de réponse.

Travail sur bomex en cours

Marie-Pierre reprend le tableau de description des cas.

Discussion sur la standardisation des noms des cas :
   majuscules/minuscules
   avec des sous cas par défaut.
   Marie-Pierre étend la discussion.


Publications :
==============
(Inchangé)
- Stratocumulus (Arnaud Jam)
- Thermiques / stratocumulus / bords Est (Frédéric)
- Couplage / Flux de surface / rafales (Traore)
- Splitting (Jean-Yves)
- Tuning (Ionela/Frédéric)
- Articulation convection peu profonde / profonde ?

Prochaine réunion des utilisateurs :
====================================
Réunion LMDZ les 11-12 juin.
Amphi Herpin + caves Esclangon pour les pauses.
Envoyer un premier mail à lmdz et lmdz-users
* Présentation des versions CMIP6
* Présentation de l'évolution de l'outil informatique (IO, atlas, ...)
* Présentation des utilisateurs.
* Faire remonter les problèmes.
* Présentation de faits marquants.
* Discussion sur la communication vers les utilisateurs.
Définir un petit comité (Marie-Pierre, Ehouarn, Frédéric + Ionela + Adriana)
Marie-Pierre envoie un premier mail pour bloquer la date.

Faire le point sur la question de la doc d'ici là et pendant.

Labélisation :
==============
Présentation de LMDZ à la CSOA le 14 juin.
Réponse à un questionaire en ligne du CNRS.
Organiser une réunion d'une demi journée avec les acteurs de LMDZ
    Après les journées utilisateurs. Debrief.
    Par exemple lundi 25 juin. avec une intro en réunion climat.
    Faire un doodle.

tickets trac :
==============
A regardé #87 sur le cycle diurne : va commettre.

(inchangé)
#9      Modifications pour une dynamique commune (terre \u2013 planete)
#11     Menage sur les prints
-> ??? #21     "day_ini" dans "create_etat0_limit" et "gcm"
-> ??? #28     Initialisation problems in cloudth ?
-> Faire test snan et fermer. #30     Pb valeurs nulles/non définies sur configs linux
#32     Concervation de la masse des traceurs dans la dynamique
#34     Calving faux en zoome
-> mail Lionel et on ferme #44     getin_dump et name
-> mail Olivier (B) et on ferme #52     readchlorophyll en OpenMP?
#54     Erreur sur la vorticité en mode zoomé
#55     Constantes non uniformes dans le modèle
#56     Vérifier le calcul des nombres de jours de pluie
#61     Calendrier     Consolidation
-> mail à Frédéric et fermer #62     Problème avec les variables SAVE dans yamada4?
#66     Sensibilité au pas de temps de la fermeture stochastique
#67     Traceurs et isotopes.
#70     Conservation de l'énergie avec l'eau
#71     Filtrage de la vorticité
-> Réunir avec 89 #74     grossismx
#75     ppm3d non fonctionnel
#76     Sortie epmax
-> Fermer en retrouvant les numéros de révision svn 2523 #77     Fréquence des fichiers aérosols
#82     Nouveau calcul de wind10m
-> Corrigé par Jean-Yves, svn 3000 #83     Mais où est donc passée la prise en compte de la ALP conditionnelle?
#84     Use getin_p instead of getin
--> faire evoluer sur la nécessité de définir les focages en
    surface en absence de chauffage radiatif de l'atmosphère
         #85     Rayonnement dans le 1D
#87     cycle_diurne et iflag_cycle_diurne
#88     routines cldrag
#89     Problèmes grille zoomée


Tour de table :
===============

Jean-Baptiste :
---------------
RAS

Marie-Pierre :
--------------
Plein d'instal 1D.
Perte de convergence dans tend_to_tke version 20180212 qui est celle d'avant IMPLICIT NONE.
Mais OK après.

Jean-Yves :
-----------
Fit de cercle sous grads (pour caractérisé les poches).
Jean-Baptise fait remarquer que beaucoup de choses ont été développées
pour les comptages de cratères en planétologie.

Ehouarn :
---------
3317 OK

Ionela :
--------
problèmes de rstudio, vent à 10m, rayons effectifs.
Il faut calculer les taux de cfc correspondant à 0.24 W/m2 pour les aquaplanètes CMIP6.

Frédérique :
---------------
Contribution à la reproductibilité.
Travaille sur les biais au Sirta avec Yan Feng
   Manque de nuages et de variabilité.
Contribution à Causes avec la NPv6.0.14
Va à la réunion Actris. Vont discuter de l'ANR sur l'observation des hétérégéonéités sur sites.
Proposition école de la météo sur les mêmes problématiques.

Frédéric :
------------
Travail sur le tuning automatique, la reproductibilité, les scripts du tutorial,
suivi de la mise au point de la version CMIP6 (cf plus haut)

16/4/2018

Compte rendu du poihl du 16/4/2018

Consolidation LMDZ6 :

Plantage/1+1=2/reproductibulité :
   Perte de reproductibilité.
   Peut-être retrouvée après un ajout de barrière dans la lecture de
   l'ozone.
   Peut-être combiné avec des options de compilation trop agressive.


Lancement des simulations :

Les simulations 61-pi-spinup 01 et 02 on fait leur 100 ans
    Laurent a lancé la 61-pi de la 02
    Décision en début de semaine entre les deux.

Suivi de la version figée avec check-list de lancement :
   http://forge.ipsl.jussieu.fr/igcmg/wiki/IPSLCM6/IPSL-CM6A-LR


Configurations / réalisation de simulations :
Amip :
   Vérifier qu'on tourne avec le découpage des côtes du couplé.
   Relancer Guillaume pour savoir si on fait quelque chose sur la banquise.
   A relancer avec Jean-Bapiste.

(ci-dessous inchangé)

Préparation des simulations aquaplanètes et amip4K (Ionela)
   Manque l'ozone stratosphérique symmétrique (pas disponible sur le site).
   Problème des SSTs sur maille mixtes en amip4K.
Besoin de spécifier le rayon effectif.
   Deux rayons rad_chaud 1 et 2.
   Faire des test avec cdnc=n pour voir quelle est la taille des
   gouttes équivalente

CFMIP : Laurent (couplés, abrupts), Abderrahmane (cookies, CRELW off)
        Lidia (Ensemble amip + guidé, sauf celle du Deck), Ionela (amip du
        deck
        et multi config, aqua n'co) Scenarios : Laurent ?

Préparation des simulations MR pour le Deck CMIP6 :

Contrôle des sources :
Jean-Yves a trouvé des F90 sans implicit none.
   9 fichiers. A regarder.

Grand challenge + dynamico :

Machine redémarrée.


Data request (responsable Laurent et Sandrine)
Faire le travail de vérification sur les sorties des piControl et pi-spinup.


Articulation convection profonde / convection peu profonde

(inchangé ci dessous)
* Jean-Yves a corrigé le bug dans l'évolution de la densité de poches.
Tests en cours.
* Modèle pronostic de densité de poches.
* Splitting des poches : équations imprésentable
* Entrainement convectif / nouvel épluchage
* Tube dentifrice (à tester)
* Dyamique de population de poches
* gestion des précipitations

Evolution physique/versions futures :

(inchangés ci-dessous)
* Jean-Yves continue à mettre en place le spliting incluant les températures de surface.
* Jean-Yves, Jean-Philippe et Catherine pensent qu'il faut éliminer une partie des précipitations dans les ascendances adiabatiques.
* Eau avec source méthane
* sursaturation
* Augmentation de la résolution.
* grille plus groissère en bas pour la convection

Tuning automatique :
A envoyé une première version des scripts high-tune standard.
Préparation de 250 simulations sur 19 paramètres pour explorer la variabilité de la convection cobinée au réglage radiatif.
    Simulations réalisées en 1D (1min par simulation pour 20 ans) sur le cas d'équilibre radiatif-convectif de Caroline.
    Va lancer en 3D.


Convergence 1D std / Dephy :

Marie-Pierre a repris les forcages LES arm_cu de Fleur. Mais les flux de surface
   sur la moitié du temps. Toujours pas de réponse.

Romain a envoyé un fichier bomex.
    Découverte d'un bug dans le forcage de l'ancien bomex.
    Fleur a envoyé ses forcages LES

Publications :
(Inchangé)
- Stratocumulus (Arnaud Jam)
- Thermiques / stratocumulus / bords Est (Frédéric)
- Couplage / Flux de surface / rafales (Traore)
- Splitting (Jean-Yves)
- Tuning (Ionela/Frédéric)
- Articulation convection peu profonde / profonde ?

Prochaine réunion des utilisateurs :
Réunion LMDZ les 11-12 juin.
* Présentation des versions CMIP6
* Présentation de l'évolution de l'outil informatique (IO, atlas, ...)
* Présentation des utilisateurs.
* Faire remonter les problèmes.
* Présentation de faits marquants.
Définir un petit comité.
Marie-Pierre envoie un premier mail.
Recherche d'une salle.

Faire le point sur la question de la doc d'ici là et pendant.


tickets trac :
A regardé #87 sur le cycle diurne : va commettre.

(inchangé)
#9      Modifications pour une dynamique commune (terre \u2013 planete)
#11     Menage sur les prints
-> ??? #21     "day_ini" dans "create_etat0_limit" et "gcm"
-> ??? #28     Initialisation problems in cloudth ?
-> Faire test snan et fermer. #30     Pb valeurs nulles/non définies sur configs linux
#32     Concervation de la masse des traceurs dans la dynamique
#34     Calving faux en zoome
-> mail Lionel et on ferme #44     getin_dump et name
-> mail Olivier (B) et on ferme #52     readchlorophyll en OpenMP?
#54     Erreur sur la vorticité en mode zoomé
#55     Constantes non uniformes dans le modèle
#56     Vérifier le calcul des nombres de jours de pluie
#61     Calendrier     Consolidation
-> mail à Frédéric et fermer #62     Problème avec les variables SAVE dans yamada4?
#66     Sensibilité au pas de temps de la fermeture stochastique
#67     Traceurs et isotopes.
#70     Conservation de l'énergie avec l'eau
#71     Filtrage de la vorticité
-> Réunir avec 89 #74     grossismx
#75     ppm3d non fonctionnel
#76     Sortie epmax
-> Fermer en retrouvant les numéros de révision svn 2523 #77     Fréquence des fichiers aérosols
#82     Nouveau calcul de wind10m
-> Corrigé par Jean-Yves, svn 3000 #83     Mais où est donc passée la prise en compte de la ALP conditionnelle?
#84     Use getin_p instead of getin
--> faire evoluer sur la nécessité de définir les focages en
    surface en absence de chauffage radiatif de l'atmosphère
         #85     Rayonnement dans le 1D
#87     cycle_diurne et iflag_cycle_diurne
#88     routines cldrag
#89     Problèmes grille zoomée


Tour de table :

Marie-Pierre :
Rien à ajouter

Jean-Baptiste :
Content d'être de retour car en cours les autres lundi.
Travaille sur des super mesure de température / humidité à Dome C.
A mis au point une version eduEarth de LMDZ pour des L3 de physique.
  * Encapsulage bash/python des tutoriaux.
  * Tourne sur les ordinateurs de l'université.
  * A disposition sur github. Regarder gitlab.
  * Super expérience.

Ehouarn :
Dernière version OK
Planeto : 290000 heures sur occigène
Problème de version de svn dans les install.sh

Lidia :
6015 split et ttop réalisées.
Post-traitements à faire en manuel.
Causes : Mise à disposition des NPv3.2 guidées sur le serveur ftp. Récupérées.

Abderrahmane :
Passe

Marie-Alice :
Rappel prospective I-CMC 14-15 mai à Saint-Remi les Cheuvreuses.

Frédéric :
Tout dit

9/4/2018

Compte rendu du poihl du 6/4/2018

Durée : 1h30min


Consolidation LMDZ6 :
=====================

Plantage/1+1=2/reproductibulité :
   Passer l'option init_real de nan à snan ?

Problème de perte de reproductibilité.
   Priorité à la réouverture de curie.

simulation 61-pi-spinup en machine
   Sélection de la version de contrôle cette semaine.


Lancement des simulations :
===========================

Configurations / réalisation de simulations :
---------------------------------------------
Préparation des simulations aquaplanètes et amip4K (Ionela)
   Manque l'ozone stratosphérique symmétrique (pas disponible sur le site).
   Problème des SSTs sur maille mixtes en amip4K.
Besoin de spécifier le rayon effectif.
   Deux rayons rad_chaud 1 et 2.
   Faire des test avec cdnc=n pour voir quelle est la taille des
   gouttes équivalente

CFMIP : Laurent (couplés, abrupts), Abderrahmane (cookies, CRELW off)
        Lidia (Ensemble amip + guidé, sauf celle du Deck), Ionela (amip du deck et multi config, aqua n'co) Scenarios : Laurent ?

Préparation des simulations MR pour le Deck CMIP6 :
---------------------------------------------------

Contrôle des sources :
----------------------
Jean-Yves a trouvé des F90 sans implicit none.
   9 fichiers. A regarder.
Seuil dans cvltr_noscav remplacé par tiny (Abderrahmane et Jean-Yves)


Grand challenge + dynamico :
----------------------------
Réouverture d'irene mercredi.
CR point grand challenge ce matin :
* Mise en place d'une configuration LMDZOR V6
    Conditions aux limites créées en 50km et en LR
    Mise en place des aérosols plume.
    Commissions des options nécessaires pour la compilation sur irene
    A la fois dans LMDZ, Orchidee et XIOS
    Pour l'instant il faut extraire sur curie puis refaire les ins_make sur irene
    Modification de l'environnement du code commun.
    Probleme principal : le job maître ne peux pas relancer un autre job.
    Marche en LMDZOR-XIOS sur un serveur.
    A lancé aussi le workflow CMIP6 qui semble tourner.
* Convergence dynamico LMDZ-trunk sur curie.
    Modifications nécessaires intégrées dans une branche (pour abandonner définitivement
    sur la trunk).
    Difficultés avec XIOS (tourne si on enlève set_context).
    Besoin d'aide XIOS.
* Dynamico compile et tourne (Thomas).
    Identification des options de compilations qui accélèrent tout en conservant
    la masse.
    avec XAVX à 1% près aussi rapide que xCore-AVX512
    Infos mises en place sur la page de Heat.
    Problemes XIOS CMIP6 (mieux avec la trunk).
    A compilé uen version aquaplanète qui a tourné.
* Acceleration : le bench dynamico aurait été fait avec 3 fois
    Test Thomas : 40% de mieux sur irene


Data request (responsable Laurent et Sandrine)
==============================================
32 variables manquantes.
Dont les flux d'Eliasen Palm dans la dynamique et le rotationnel.
Beaucoup de séparations nuages stratiformes/convectifs dont on ne sait
   pas trop comment les adapter au modèle.
Calcul des vents à 10m en cours (Ionela)

Articulation convection profonde / convection peu profonde
==========================================================
(inchangé ci dessous)
* Jean-Yves a corrigé le bug dans l'évolution de la densité de poches.
Tests en cours.
* Modèle pronostic de densité de poches.
* Splitting des poches : équations imprésentable
* Entrainement convectif / nouvel épluchage
* Tube dentifrice (à tester)
* Dyamique de population de poches
* gestion des précipitations

Evolution physique/versions futures :
=====================================
Jean-Yves continue à mettre en place le spliting incluant les températures
   de surface.
(inchangés ci-dessous)
* Jean-Yves, Jean-Philippe et Catherine pensent qu'il faut éliminer une
   partie des précipitations dans les ascendances adiabatiques.
* Eau avec source méthane
* sursaturation
* Augmentation de la résolution.
* grille plus groissère en bas pour la convection

Tuning automatique :
====================
A envoyé une première version des scripts high-tune standard.

Convergence 1D std / Dephy :
============================
Marie-Pierre a repris les forcages LES arm_cu de Fleur. Mais les flux de surface
   sur la moitié du temps.
Romain a envoyé un fichier bomex
Frédéric ....

Publications :
==============
- Stratocumulus (Arnaud Jam)
    Finalisation des simulations à partir de la configuration S
    en changeant ed_dz
    Simulations 3D + post traitements Cosp + 1D Irina
- Thermiques / stratocumulus / bords Est (Frédéric)
    Simulation de sensibilité à ed_dz ave retuning réalisées
    A doubler par des simulations couplées (Traore)
- Couplage / Flux de surface / rafales (Traore)
    Décision de faire deux papiers : 1/ sur la fermeture ale/alp wk/bl
    Comparée au LES (piloté par Catherine) et 2/ sur les rafales
    spécifiquement.
    Comparaisons LES / SCM sur le cas de RCE de Caroline.

(inchangé)
- Splitting (Jean-Yves)
- Tuning (Ionela/Frédéric)
- Articulation convection peu profonde / profonde ?

Prochaine réunion des utilisateurs :
====================================
Réunion LMDZ les 11-12 juin.
* Présentation des versions CMIP6
* Présentation de l'évolution de l'outil informatique (IO, atlas, ...)
* Présentation des utilisateurs.
* Faire remonter les problèmes.
* Présentation de faits marquants.
* Bocal

Faire le point sur la question de la doc d'ici là et pendant.

Revoir la composition du comité de pilotage.
Avant présentation de l'outil LMDZ pour labélisation à la CSOA (14 juin)
    en en évitant COCOA la semaine du 4 au 10


tickets trac :
==============
A regardé #87 sur le cycle diurne : va commettre.

(inchangé)
#9      Modifications pour une dynamique commune (terre \u2013 planete)
#11     Menage sur les prints
-> ??? #21     "day_ini" dans "create_etat0_limit" et "gcm"
-> ??? #28     Initialisation problems in cloudth ?
-> Faire test snan et fermer. #30     Pb valeurs nulles/non définies sur configs linux
#32     Concervation de la masse des traceurs dans la dynamique
#34     Calving faux en zoome
-> mail Lionel et on ferme #44     getin_dump et name
-> mail Olivier (B) et on ferme #52     readchlorophyll en OpenMP?
#54     Erreur sur la vorticité en mode zoomé
#55     Constantes non uniformes dans le modèle
#56     Vérifier le calcul des nombres de jours de pluie
#61     Calendrier     Consolidation
-> mail à Frédéric et fermer #62     Problème avec les variables SAVE dans yamada4?
#66     Sensibilité au pas de temps de la fermeture stochastique
#67     Traceurs et isotopes.
#70     Conservation de l'énergie avec l'eau
#71     Filtrage de la vorticité
-> Réunir avec 89 #74     grossismx
#75     ppm3d non fonctionnel
#76     Sortie epmax
-> Fermer en retrouvant les numéros de révision svn 2523 #77     Fréquence des fichiers aérosols
#82     Nouveau calcul de wind10m
-> Corrigé par Jean-Yves, svn 3000 #83     Mais où est donc passée la prise en compte de la ALP conditionnelle?
#84     Use getin_p instead of getin
--> faire evoluer sur la nécessité de définir les focages en
    surface en absence de chauffage radiatif de l'atmosphère
         #85     Rayonnement dans le 1D
#87     cycle_diurne et iflag_cycle_diurne
#88     routines cldrag
#89     Problèmes grille zoomée


Tour de table :
===============

Ehouarn :
---------
3309 : perte de convergence sans doute expliquée par un problème de
       traceurs.

Hors réunion, Ehouarn confirme que c'est du au commit 3253.

Marie-Pierre :
--------------
install 1D OK.
Le reste a déjà été dit.

Lidia :
-------
Amip controle-guidage split/ttop en 6015 executé.
    post-traitements à vérifier.
Causes : post traitement des NPv3.2
    A automatisé les scripts pour reconstruire une histore continue
    à J+N jours.
    A mis les 6014 au format Causes. Archivé et mis sur le ftp du labo.
        Doit encore mettre à disposition les 3.2

Jean-Yves :
-----------
Travaille sur le splitting et sur la dynamique de population de poches.
A discuté avec Nicolas. Papiers sur océans et continents en projet.

Ionela :
--------
Mise

Abdoul Khadre :
---------------
A mené à bout le modèle de plume (aérosols Bjorn Stevens).
   Vérifier que l'effet radiatif est branché.
   Evaluer le besoin éventuel de retuning.
Travaille sur le papier.

Frédéric :
----------
RAS

2/4/2018

C'est lundi de Paques !

26/3/2018

19/3/2018

12/3/2018

Compte rendu du poihl du 12/3/2018

Durée : 58min


Consolidation LMDZ6 :
=====================

Plantage/1+1=2/reproductibulité :
    Passer l'option init_real de nan à snan ?
    En attente de nouveaux plantages en 4CO2

Problème de temps de calcul aléatoire :
    Aussi bien sur ada que sur curie ...

Passage à la 6015 :
    Simulations S et T en machine avec plusieurs reréglages.

Travail sur le contrôle du double appel au rayonnement et à Cosp
    à partir des xml.
    Ca marche pour Cosp, y compris en debug.
    Petit doute sur le double appel au rayonnement.


Lancement des simulations :
===========================

Contribution des ingénieurs de l'équipe :
-----------------------------------------
(inchangé)
Répartition envisagée :
Ionela et Abderrahmane s'occuperaient de CFMIP
Laurent s'occuperait des scenario.
Lidia portera les simulations d'ensemble Amip

Préparation des simulations MR pour le Deck CMIP6 :
---------------------------------------------------

Contrôle des sources :
----------------------
Jean-Yves a trouvé des F90 sans implicit none.
   9 fichiers. A regarder.
Problème identifié en debug dans cvltr_noscav
           if(mp(i,j+1).ne.0) then
              zmd(i,j,k)=zmd(i,j+1,k)*min(1.,mp(i,j)/mp(i,j+1))
           ENDif


Préparation des configs :
-------------------------
RAS

Grand challenge + dynamico :
----------------------------
Fermeture de irene jusqu'au 21.
Priorités : faire converger dynamico avec la physique de la trunk LMDZ
Installer la version de LMDZ6 avec tout le workflow à l'ouverture.
+ tests dynamico openMP (Thomas)
Le placement des tâches XIOS sur les processus sera sans doute un des
chantiers importants.

Data request (responsable Laurent et Sandrine)
==============================================

Atlas comparé LMDZ / CNRM disponibles !
A permis de trouver des erreurs sur les variables
(comme la hauteur geopotentielle qui doit etre z et pas g*z).

6 variables de transport intégrés verticalement vont être récupérées dans
   la physique (anciens diagnostics de Laurent Li), après une petite modif.

Sortie de la DR22 mais on va sans doute rester sur la 21.

Autour de 35 variables manquantes.
Dont les flux d'Eliasen Palm dans la dynamique


Articulation convection profonde / convection peu profonde
==========================================================
Jean-Yves a corrigé le bug dans l'évolution de la densité de poches.
Tests en cours.
(inchangé ci dessous)
* Modèle pronostic de densité de poches.
* Splitting des poches : équations imprésentable
* Entrainement convectif / nouvel épluchage
* Tube dentifrice (à tester)
* Dyamique de population de poches
* gestion des précipitations

Evolution physique/versions futures :
=====================================
* Jean-Yves travaille sur le splitting
Code la partie avec différences de températures de surface.
(inchangés ci-dessous)
* Jean-Yves, Jean-Philippe et Catherine pensent qu'il faut éliminer une
   partie des précipitations dans les ascendances adiabatiques.
* Eau avec source méthane
* sursaturation
* Augmentation de la résolution.
* grille plus groissère en bas pour la convection


Tuning automatique :
====================
(Inchangé)
Va distribuer la version courante des scripts.
doodle en cours pour le créneau pour l'atlier #2
entre les 2, 3 et 4 mai.

Convergence 1D std / Dephy :
============================
Marie-Pierre s'est replongée sur les fichiers de Fleur sur le cas ArmCu.

Publications :
==============
(inchangé)
- Simulations en cours pour les deux premiers papiers (Frédéric)
- Stratocumulus (Arnaud Jam)
     A récupéré les sorties d'Irina Sandu.
- Thermiques / stratocumulus / bords Est (Frédéric)
- Splitting (Jean-Yves)
- Couplage / Flux de surface / rafales (Traore)
- Tuning (Ionela/Frédéric)
- Articulation convection peu profonde / profonde ?

Prochaine réunion des utilisateurs :
====================================
Dernière semaine de mai (du 28 mai)
Décider la date à la réunion climat.
* Présentation des versions CMIP6
* Présentation de l'évolution de l'outil informatique (IO, atlas, ...)
* Présentation des utilisateurs.
* Faire remonter les problèmes.
* Présentation de faits marquants.
* Bocal

Faire le point sur la question de la doc d'ici là et pendant.

Revoir la composition du comité de pilotage.
Avant présentation de l'outil LMDZ pour labélisation à la CSOA (13-14 juin)
    en en évitant COCOA la semaine du 4 au 10


tickets trac :
==============
(inchangé)
#9      Modifications pour une dynamique commune (terre \u2013 planete)
#11     Menage sur les prints
-> ??? #21     "day_ini" dans "create_etat0_limit" et "gcm"
-> ??? #28     Initialisation problems in cloudth ?
-> Faire test snan et fermer. #30     Pb valeurs nulles/non définies sur configs linux
#32     Concervation de la masse des traceurs dans la dynamique
#34     Calving faux en zoome
-> mail Lionel et on ferme #44     getin_dump et name
-> mail Olivier (B) et on ferme #52     readchlorophyll en OpenMP?
#54     Erreur sur la vorticité en mode zoomé
#55     Constantes non uniformes dans le modèle
#56     Vérifier le calcul des nombres de jours de pluie
#61     Calendrier     Consolidation
-> mail à Frédéric et fermer #62     Problème avec les variables SAVE dans yamada4?
#66     Sensibilité au pas de temps de la fermeture stochastique
#67     Traceurs et isotopes.
#70     Conservation de l'énergie avec l'eau
#71     Filtrage de la vorticité
-> Réunir avec 89 #74     grossismx
#75     ppm3d non fonctionnel
#76     Sortie epmax
-> Fermer en retrouvant les numéros de révision svn 2523 #77     Fréquence des fichiers aérosols
#82     Nouveau calcul de wind10m
-> Corrigé par Jean-Yves, svn 3000 #83     Mais où est donc passée la prise en compte de la ALP conditionnelle?
#84     Use getin_p instead of getin
--> faire evoluer sur la nécessité de définir les focages en
    surface en absence de chauffage radiatif de l'atmosphère
         #85     Rayonnement dans le 1D
#87     cycle_diurne et iflag_cycle_diurne
#88     routines cldrag
#89     Problèmes grille zoomée


Tour de table :
===============

Marie-Pierre :
--------------
A travaillé sur la GdR
svn3245 OK
A repris les fichiers de Fleur
Florentin est revenu du meeting Pan GASS en Australie.
Etudiante de Steve Sherwood qui travaille sur WRF 1D. Elle voudrait LMDZ1D.

Laurent :
---------
A mis en place une vérification de la convergence numérique sur la branche 6015.
A travaillé sur la data request pour sortir des champs pour Arnaud.
A vérifié les fichiers ping
S'est remis à la convergence dynamico/LMDZ.
Après discussion avec Arnaud, deux questions :
    Faire du ménage aussi sur les 2D dans les histmth.
    On n'a plus besoin du fichier histmthNMC ?


Abderrahmane :
--------------
A fini les corrections et commissions pour Cosp.
Tourne en mode debug et permet de gérer les clés de sorties en fonction
   de la data request.
Insiste sur le fait qu'il a progressé beaucoup plus vite grâce aux installations
  en local en 48x36x39.
De là, ca tournait en intéractif sur curie. Mais pas en qsub.
Corrigé depuis. Tout marche maintenant.

Lidia :
-------
Simulations CM6014 en cours, splith et ttop.
Aucun post-traitement automatique. Refait en manuel. Finalisé pour AMIP ctrl/guidé
Pour Causes : résultats mis à disposition
              Travaille sur NPv3.2
              Il faut maintenant les mettre à disposition.
              Commence à regarder les simulations initialisées de 5 jours glissants.
              Comparaisons en cours entre guidées et initialisées.
Va prendre en charge les Ensembles amip pour CMIP6

Jean-Yves :
-----------
Ahtoodee

Ehouarn :
---------
3245 ok

Frédéric :
----------
A re-réglé une simulation S un peu plus chaude et avec un effet indirect des aérosols plus fort.
A fait aboutir les scripts en local et sur ada avec cosp en mode ioipsl.
Presque prêt avec xios aussi.

5/3/2018

Compte rendu du poihl du 5/3/2018

Durée : 1h30


Consolidation LMDZ6 :
=====================

Plantage/1+1=2/reproductibulité :
    Passer l'option init_real de nan à snan ?
    Laisser tomber l'analyse des plantages précédents et relancer
       Marie-Alice a relancé un 4CO2

Problème de temps de calcul aléatoire :
    Aussi bien sur ada que sur curie ...

Passage à la 6015 :
    Simulations S et T en machine.
    Test avec correction dans Orchidee.
    Discussion du passage en mode workflow demain.

Doute de Laurent sur l'activation du double rayonnement seulement quand
    Il y avait une erreur qui faisait qu'on appelait toujours le
    double rayonnement.
    On gagne 10% de temps de calcul.
    Comprendre pourquoi Traore a réussi à faire 19 ans par jour.


Lancement des simulations :
===========================

Contribution des ingénieurs de l'équipe :
-----------------------------------------
(inchangé)
Répartition envisagée :
Ionela et Abderrahmane s'occuperaient de CFMIP
Laurent s'occuperait des scenario.
Lidia portera les amip.

Préparation des simulations MR pour le Deck CMIP6 :
---------------------------------------------------

Contrôle des sources :
----------------------
Jean-Yves a trouvé des F90 sans implicit none.
   9 fichiers. A regarder.

Préparation des configs :
-------------------------
RAS

Grand challenge :
-----------------
Fermeture de irene jusqu'au 21.
Installation : recuperation sur curie
               suivi de ins_make et compilation sur irene
En attendant, travailler sur l'interpollation des
fichiers limit à 50 km de résolution.
Point jeudi après midi ou pas ? voir demain à Esci ?


Data request (responsable Laurent et Sandrine)
==============================================

Atlas comparé LMDZ / CNRM disponibles !
A permis de trouver des erreurs sur les variables
(comme la hauteur geopotentielle qui doit etre z et pas g*z).

conservé d'il y a 15 jours :
On est passé de 330 à 326 variables demandées.
82 qu'on ne fournira pas.
42 encore à trouver mais qu'on ne fournira sans doute pas non plus.


Articulation convection profonde / convection peu profonde
==========================================================
Jean-Yves a un bud dans l'évolution de la densité de poches
   qui croît sans raison.
(inchangé ci dessous)
* Modèle pronostic de densité de poches.
* Splitting des poches : équations imprésentable
* Entrainement convectif / nouvel épluchage
* Tube dentifrice (à tester)
* Dyamique de population de poches
* gestion des précipitations

Evolution physique/versions futures :
=====================================
(inchangés ci-dessous)
* Jean-Yves travaille sur le splitting
* Jean-Yves, Jean-Philippe et Catherine pensent qu'il faut éliminer une
   partie des précipitations dans les ascendances adiabatiques.
* Eau avec source méthane
* sursaturation
* Augmentation de la résolution.
* grille plus groissère en bas pour la convection


Dynamico :
==========
On bascule sur la version de Laurent.

Tuning automatique :
====================
Va distribuer la version courante des scripts.
doodle en cours pour le créneau pour l'atlier #2
entre les 2, 3 et 4 mai.

Convergence 1D std / Dephy :
============================
RAS

Publications :
==============
Simulations en cours pour les deux premiers papiers (Frédéric)
(inchangé)
- Stratocumulus (Arnaud Jam)
     A récupéré les sorties d'Irina Sandu.
- Thermiques / stratocumulus / bords Est (Frédéric)
- Splitting (Jean-Yves)
- Couplage / Flux de surface / rafales (Traore)
- Tuning (Ionela/Frédéric)
- Articulation convection peu profonde / profonde ?

Prochaine réunion des utilisateurs :
====================================
Dernière semaine de mai (du 28 mai)
Avant présentation de l'outil LMDZ pour labélisation à la CSOA (13-14 juin)
    en en évitant COCOA la semaine du 4 au 10

tickets trac :
==============
#9      Modifications pour une dynamique commune (terre \u2013 planete)
#11     Menage sur les prints
-> ??? #21     "day_ini" dans "create_etat0_limit" et "gcm"
-> ??? #28     Initialisation problems in cloudth ?
-> Faire test snan et fermer. #30     Pb valeurs nulles/non définies sur configs linux
#32     Concervation de la masse des traceurs dans la dynamique
#34     Calving faux en zoome
-> mail Lionel et on ferme #44     getin_dump et name
-> mail Olivier (B) et on ferme #52     readchlorophyll en OpenMP?
#54     Erreur sur la vorticité en mode zoomé
#55     Constantes non uniformes dans le modèle
#56     Vérifier le calcul des nombres de jours de pluie
#61     Calendrier     Consolidation
-> mail à Frédéric et fermer #62     Problème avec les variables SAVE dans yamada4?
#66     Sensibilité au pas de temps de la fermeture stochastique
#67     Traceurs et isotopes.
#70     Conservation de l'énergie avec l'eau
#71     Filtrage de la vorticité
-> Réunir avec 89 #74     grossismx
#75     ppm3d non fonctionnel
#76     Sortie epmax
-> Fermer en retrouvant les numéros de révision svn 2523 #77     Fréquence des fichiers aérosols
#82     Nouveau calcul de wind10m
-> Corrigé par Jean-Yves, svn 3000 #83     Mais où est donc passée la prise en compte de la ALP conditionnelle?
#84     Use getin_p instead of getin
--> faire evoluer sur la nécessité de définir les focages en
    surface en absence de chauffage radiatif de l'atmosphère
         #85     Rayonnement dans le 1D
#87     cycle_diurne et iflag_cycle_diurne
#88     routines cldrag
#89     Problèmes grille zoomée


Tour de table :
===============

Jean-Yves :
-----------
Rien d'autre

Ehouarn :
---------
3233 sur ada OK;
Relance la réunion utilisateurs

Abdoul Khadre :
---------------
A repris une expérience ancienne physique à 79 niveaux
   Plante au bout de quelques dizaines de jours.
Travaille sur le papier couplage/rafales.

Ionela :
--------
A travaillé sur le vent à 10m.
   Bug identifié sur zhalf.
   Va commettre la correction plus le vent à 10m

Laurent :
---------
RAS

Marie-Pierre :
--------------
A travaillé sur la rédaction du GdR.
A 3233 OK

Abderrahmane :
--------------
A modifié Cosp pour que ça marche sans XIOS

Frédéric :
----------
A finalisé la compilation avec Cosp dans tutorial.tar en local et tutorial_ada.tar
A modifié les noms des fichiers cosp (non fichier = nom module) pour
    pouvoir compiler avec makegcm (commissions Abderrahmane)
Est tombé sur un problème inatendu lié à l'utilisation de la stack.
Des plantages avec ulimit -s unlimited ou avec la stack par défaut (8Mo)
Il faut en fait ajuster la taille de la stack.
Le problème arrivait quand on créait un tableau de tableau au travers de déclarations
    types avec des attributs tableaux
    Faire une maquette pour esssayer de reproduire le problème.
A pu ensuite identifier la source des plantages en mode debug (division / underflow)
Continue à trouver le travail de dév/debug nettement plus facile et efficace
     en local.
     avec makegcm plutôt que makegcm_fcm
       1/ parce qu'on peut avoir les versions debug et prod en parallèle
       2/ parece qu'on a directement acces aux lignes dans le code fortran.
A finalisé les mini-projets "développement de paramétrisation".

26/2/2018

Compte rendu du poihl du 26/2/2018

Durée : 1h15


Consolidation LMDZ6 :
=====================
Plantage/1+1=2/reproductibulité :
     Passer l'option init_real de nan à snan ?
    Laisser tomber l'analyse des plantages précédents et relancer
       Marie-Alice a relancé un 4CO2

Passage à la 6015 :
    Incluera l'insensibilité au découpage de domaines.
    On ne conserve que ttop et splith rebaptisée _T et _S
    Simulations en machines.
    Inquiétudes sur un changement de salinité.

Doute de Laurent sur l'activation du double rayonnement seulement quand
    certaines variables étaient appelées par le rayonnement.
    En fait double appel tout le temps.
    Laurent a corrigé. Mais on est quand même obligé d'appeler une
      fois le double rayonnement car XIOS n'est pas encore fermé
      avant la fin de la physique.
    Laurent a fait des tests.
    On gagne 10% de temps de calcul.
    On passe de 15 à 16 ans par jour.
    Comprendre pourquoi Traore a réussi à faire 19 ans par jour.


Lancement des simulations :
===========================
Contribution des ingénieurs de l'équipe :
-----------------------------------------
(inchangé)
Répartition envisagée :
Ionela et Abderrahmane s'occuperaient de CFMIP
Laurent s'occuperait des scenario.
Lidia portera les amip.

Préparation des simulations MR pour le Deck CMIP6 :
---------------------------------------------------
Configuration MR pour CMIP6 256x256x79 avec eORCA1 pour l'océan
c'est à dire la configuration qu'a fait tourné Marie-Alice.
Sans doute avec la physique S
Marie-Alice a lancé un test de sensibilité à l'orographie sous maile
   en MR. 6011
   Envisage de refaire un MR en 6015

Contrôle des sources :
----------------------
Jean-Yves a trouvé des F90 sans implicit none.
   9 fichiers. A regarder.

Préparation des configs :
-------------------------
RAS

Grand challenge :
-----------------
Traore a fait des tests de performances.
Sur la version actuelle 8 OMP
   52 min par 24h contre 1h15 (ou 75 min)
   44 min sur 12 OMP
   42 min sur 16 OMP
A réussi à compiler IOIPSL et XIOS (depuis que perl est adapté).
Compilation d'orchidee en cours.
Des discussion sur les nouvelles facons de faire avec netcdf et hdf5.
A réussi a initialiser et lancer le modèle en 512x360x79 (7 jours)
A compilé en 1024x720x79 mais l'initialisation a planté.
    Regarder le problème posé par l'interpolation vers une grille
    plus fine des SSTs.

Data request (responsable Laurent et Sandrine)
==============================================
Atlas comparé LMDZ / CNRM disponibles !
A permis de trouver des erreurs sur les variables
(comme la hauteur geopotentielle qui doit etre z et pas g*z).

conservé d'il y a 15 jours :
On est passé de 330 à 326 variables demandées.
82 qu'on ne fournira pas.
42 encore à trouver mais qu'on ne fournira sans doute pas non plus.

Articulation convection profonde / convection peu profonde
==========================================================
(inchangé ci dessous)
* Modèle pronostic de densité de poches.
* Splitting des poches : équations imprésentable
* Entrainement convectif / nouvel épluchage
* Tube dentifrice (à tester)
* Dyamique de population de poches
* gestion des précipitations

Evolution physique/versions futures :
=====================================
(inchangés ci-dessous)
* Jean-Yves travaille sur le splitting
* Jean-Yves, Jean-Philippe et Catherine pensent qu'il faut éliminer une
   partie des précipitations dans les ascendances adiabatiques.
* Eau avec source méthane
* sursaturation
* Augmentation de la résolution.
* grille plus groissère en bas pour la convection

Dynamico :
==========
pression de surface différente entre les dynamique longitude-latitude
    et dynamico.
    Tests en cours.
Faire converger dynamico avec la dernière version de LMDZ (Laurent et Abdoul)

Tuning automatique :
====================
Frédéric a une série de scripts R qui permettent de refaire ce qui avait
    été fait pendant l'atelier.
    Travaille avec sur les stratocumulus.

Convergence 1D std / Dephy :
============================
Marie-Pierre retravaille sur bomex.
Va reprendre contact avec Fleur sur les forcages.

Publications :
==============
(inchangé)
- Stratocumulus (Arnaud Jam)
     A récupéré les sorties d'Irina Sandu.
- Thermiques / stratocumulus / bords Est (Frédéric)
- Splitting (Jean-Yves)
- Couplage / Flux de surface / rafales (Traore)
- Tuning (Ionela/Frédéric)
- Articulation convection peu profonde / profonde ?

tickets trac :
==============
#9      Modifications pour une dynamique commune (terre \u2013 planete)
#11     Menage sur les prints
#21     "day_ini" dans "create_etat0_limit" et "gcm"
#28     Initialisation problems in cloudth ?
#30     Pb valeurs nulles/non définies sur configs linux
#32     Concervation de la masse des traceurs dans la dynamique
#34     Calving faux en zoome
#44     getin_dump et name
#52     readchlorophyll en OpenMP?
#54     Erreur sur la vorticité en mode zoomé
#55     Constantes non uniformes dans le modèle
#56     Vérifier le calcul des nombres de jours de pluie
#61     Calendrier     Consolidation
#62     Problème avec les variables SAVE dans yamada4?
#66     Sensibilité au pas de temps de la fermeture stochastique
#67     Traceurs et isotopes.
#70     Conservation de l'énergie avec l'eau
#71     Filtrage de la vorticité
#74     grossismx
#75     ppm3d non fonctionnel
#76     Sortie epmax
#77     Fréquence des fichiers aérosols
#82     Nouveau calcul de wind10m
#83     Mais où est donc passée la prise en compte de la ALP conditionnelle
?
#84     Use getin_p instead of getin
#85     Rayonnement dans le 1D
#87     cycle_diurne et iflag_cycle_diurne
#88     routines cldrag
#89     Problèmes grille zoomée

Tour de table :
===============

Marie-Alcie :
-------------
Travaille sur le MR.
Problèmes de reconstruction sur les séries longues pour la glace saisonnière.
Il faut passer en ferret 7.2

Laurent :
---------
flowtrace 6015. Rien de choquant.
Interaction avec Arnaud sur la data request.

Abdoul Khadre :
---------------
grand challenge et dynamico plus haut.
Travaille avec Aurore Voldoire sur le papier avec les SST initialisées.

Lidia :
-------
- simulations CAUSES

*LMDZ6-CAUSES CM6.0.14 splith
==> exécution OK
==> mise en forme des résultats CAUSES au format CAUSES
et mise à disposition des résultats.

* LMDZ5-CAUSES NPv3.2
reprise des résultats de ces simulations réalisées avec
la configuration LMDZ5-NPV3.2, à la résolution 144x142x39,
avec le protocole CMIP5 et les sorties haute fréquence CAUSES.
les résultats CAUSES sont définis sur toute la grille du domaine
du modèle LMDZ, et à la haute fréquence de 1 heure, pour l'année
d'étude CAUSES 2011.
==> séries temporelles manquantes pour les variables résultats
CAUSES, réalisation d'un script pour extraire les variables :
temps d'execution long pour cette résolution, et pour une trentaine
de variables, dont des variables 3D
==> extraction des variables résultats sur le domaine 3x3 points
centré au point ARM/SGP, pour l'application du script automatique
aux fichiers résultats CAUSES du modèle LMDZ, pour la mise en forme
des résultats au format CAUSES
==> mise à disposition des résultats.

Jean-Yves :
-----------
A suivi les mini projets Sahel/Amazonie
Densité de poches :
    Contraste fort entre phase inhibées et actives de la MJO avec la NPv5.70.
    Mais disparait avec les versions récentes.
    Pas démélé encore.
    Trouve des choses bizares.
A découvert l'option -L dans grep
    grep -L -i "implic.*.none" *.F90
    sort le nom des fichiers ne contenant pas la implicit none.

Marie-Pierre :
--------------
install de la svn 3231 OK
A préparé une nouvelle version du 1D incluant la fiche technique développée pour les cours.

Frédéric :
----------
cf tuning plus haut.
A travaillé sur le texte du GdR Dephy.
A adapté le tutorial.tar et tutorial_ada.tar pour pouvoir tourner avec XIOS.
Se bat avec la compilation de COSP

19/2/2018

Compte rendu du poihl du 19/2/2018

Durée : 1h30


Consolidation LMDZ6 :
=====================


Plantage/1+1=2/reproductibulité :
     Bascule des scripts de création automatique des modipsl*tar et des tests associés de erskine (scientific linux) sur carey (ubuntu).
        Activation des tests en parallèle et avec changement de découpage de domaine (mpixomp : 4x1 versus 2x2). Activation du test en mode
        debug (qui était buggué:). Utilisation de NPv6.0.14splith pour les tests nouvelle physique au lieu de la 5.5.
        Les tests automatiques relancés sur les dernières versions ont
        bien confirmé le retour de l'indépendance au découpage de domaine:

install version         SVN     Bench   Conv.   1+1=2   Init
                                run     Nnum.     &
                                        /prev.  mpiXomp

20180208.trunk        3192    OK    sn-     OK-    OK
20180209.trunk        3197    OK    Snd     OK-    OK
20180212.trunk        3199    OK    SnD     OK2    OK   : insensibilite au decoupage
20180216.trunk        3218    -
20180217.trunk        3219    OK    SnD     OK2    OK
20180218.trunk        3225    OK    OK     OK2    OK

     Passer l'option init_real de nan à snan ?

     Faire un script pour vérifier qu'on a au moins un implicit none par fichier contenant une routine. Ou trouver un compilateur
       capable de vérifier.

     Plantage dans une 4 CO2 dans une pi Controle Split D.
     Plantage sur un autre abrupt 4 CO2. QUi pourrait être cette fois sur la convection.
     Plantage splitD : fin avril sur les grandes plaines.

     Laisser tomber l'analyse des plantages précédents et relancer un 4CO2 rapidement une fois la version figée.

"Bug" sur le découpage entre les poches et les thermiques
     Pas important (tests Abderrahmane validés par Jean-Yves)

Passage à la 6015 :
    Incluera l'insensibilité au découpage de domaines.
    On ne conserve que ttop et splith rebaptisée T et S


Lancement des simulations :
===========================

Contribution des ingénieurs de l'équipe :
-----------------------------------------
Répartition envisagée :
Ionela et Abderrahmane s'occuperaient de CFMIP
Laurent s'occuperait des scenario.
Lidia portera les amip.


Préparation des simulations MR pour le Deck CMIP6 :
---------------------------------------------------
Configuration MR pour CMIP6 256x256x79 avec eORCA1 pour l'océan c'est à dire la configuration qu'a fait tourné Marie-Alice.
Sans doute avec la physique S

Contrôle des sources :
----------------------
A contrôler : les implicit none.

Préparation des configs :
-------------------------
RAS

Data request (responsable Laurent et Sandrine)
==============================================

Atlas comparé LMDZ / CNRM disponibles !
A permis de trouver des erreurs sur les variables (comme la hauteur geopotentielle qui doit etre z et pas g*z).

conservé d'il y a 15 jours :
On est passé de 330 à 326 variables demandées.
82 qu'on ne fournira pas.
42 encore à trouver mais qu'on ne fournira sans doute pas non plus.


Articulation convection profonde / convection peu profonde
==========================================================
Commissions du calcul d'évolution pronostique de la densité de poches
    (sans advection).
    Permet d'avoir des densités qui varient entre les valeurs retenues pour les continents et pour les océans.
(inchangé ci dessous)
Faire le point sur ce qui est vraiment dans le code
* Splitting des poches : équations imprésentable
* Entrainement convectif / nouvel épluchage
* Tube dentifrice (à tester)
* Dyamique de population de poches
* gestion des précipitations

Evolution physique/versions futures :
=====================================
(inchangés ci-dessous)
* Jean-Yves travaille sur le splitting
* Jean-Yves, Jean-Philippe et Catherine pensent qu'il faut éliminer une
   partie des précipitations dans les ascendances adiabatiques.
* Eau avec source méthane
* sursaturation
* Augmentation de la résolution.
* grille plus groissère en bas pour la convection


Dynamico :
==========

pression de surface différente entre les dynamique longitude-latitude et dynamico.
    Pas de problème avec la discrétisation verticale.
    Tests de sensibilité à la dissipation horizontale et à la sponge
           layer.

AboulKhadre a accès à irene.
    Peut commencer à faire des tests.
    A demandé des ouvertures de comptes pour tout le monde.
    Lancer une réunion pour mettre en place les configurations
       sur irene.

Regarder la demande de stage de M1.
Grand challenge sur Irene (remplacement de curie) : accepté
1/ simulation globales LMDZ à 50km, production highresMip
2/ Passage à 25km
3/ Passage à dynamico
Demande de calcul sur le compte rces sur irene.

Tuning automatique :
====================
en cours

Convergence 1D std / Dephy :
============================
A présenté une synthèse aux AMA très encourageante sur la convergence vers les standards Dephy.
Notamment les deux modèles sont maintenant capables de sortir en format standard intercomparés ensuite sur le site d'itune.


Publications :
==============
(inchangé)
- Stratocumulus (Arnaud Jam)
     A récupéré les sorties d'Irina Sandu.
- Thermiques / stratocumulus / bords Est (Frédéric)
- Splitting (Jean-Yves)
- Couplage / Flux de surface / rafales (Traore)
- Tuning (Ionela/Frédéric)
- Articulation convection peu profonde / profonde ?


tickets trac :
==============
#9      Modifications pour une dynamique commune (terre \u2013 planete)
#11     Menage sur les prints
#21     "day_ini" dans "create_etat0_limit" et "gcm"
#28     Initialisation problems in cloudth ?
#30     Pb valeurs nulles/non définies sur configs linux
#32     Concervation de la masse des traceurs dans la dynamique
#34     Calving faux en zoome
#44     getin_dump et name
#52     readchlorophyll en OpenMP?
#54     Erreur sur la vorticité en mode zoomé
#55     Constantes non uniformes dans le modèle
#56     Vérifier le calcul des nombres de jours de pluie
#61     Calendrier     Consolidation
#62     Problème avec les variables SAVE dans yamada4?
#66     Sensibilité au pas de temps de la fermeture stochastique
#67     Traceurs et isotopes.
#70     Conservation de l'énergie avec l'eau
#71     Filtrage de la vorticité
#74     grossismx
#75     ppm3d non fonctionnel
#76     Sortie epmax
#77     Fréquence des fichiers aérosols
#82     Nouveau calcul de wind10m
#83     Mais où est donc passée la prise en compte de la ALP conditionnelle
?
#84     Use getin_p instead of getin
#85     Rayonnement dans le 1D
#87     cycle_diurne et iflag_cycle_diurne
#88     routines cldrag
#89     Problèmes grille zoomée


Tour de table :
===============

Abdoul Khadre :
---------------
A travaillé sur le mini-projet surface océan.
   A fait les tests sur ada.
   Test de paramétrisations avec iflag_thermals = 17 à 18
Continue à travailler sur le problème de pression de surface sur dynamico.

Marie-Pierre :
--------------
A travaillé sur les mini projets et rerédigé les ennoncés 1D
Décidé de faire une fiche technique pour le 1D avec 4 étapes
   1/ installation avec install_lmdz.sh -SCM ou 1D.tar
   2/ run.sh pour mettre en place les cas.
   3/ comment travailler dans RESU/PHYS/arm_cu2
   4/ compile.sh
Test 1D 18 fevrier OK.

Jean-Yves :
-----------
A commis les corrections sur les densités pronostiques.

Jean-Baptiste :
---------------
A repris les histoires de mesures de sur-saturation à Dome C associées à des mesures de visibilité.
   Comparaison avec LMDZ. A besoin de faire de la réinterpolation verticale.
A commencé à nettoyer fisrtilp (sur le papier).

Lidia :
-------
Simulation 6014 avec les forçages CMIP6
   splitD, splith et ttop
   Finies à l'execution malgré de gros arrêts au moment de la maintenance.
   Amip contrôle - guidage , 1999-2014
   Post-traitements non finalisés à cause de la maintenance.
Causes : 6012 execution OK
   Mise en forme au format Causes avec un script (Lidia/Frédérique)
   Résultats OK = toujours le même biais.
   Va retourner avec la 6014.
Simulations LMDZ6 vague de chaleur 2003 et 2010
   Mise en place avec la 6012.
   Avec chaque année un point de sortie différent.
   Nécessité de sortir les humidités sous surface.

Ehouarn :
---------
3225 sur ada.
Travaille sur XIOS pour faire des interpollations de grille côté planeto.

Abderrahmane :
--------------
Travaille sur Cosp sur curie en mode debug.

Frédéric :
----------
Mise au point des nouveaux tests sur carey (cf. plus haut)
Correction d'un bug introduit dans tend_to_tke.F90 en voulant retrouver l'independance au nombre de domaines.
Mise à jour des cas sandu en 1D (modification adhoc de lmdz1d.F90 + changement des fichiers LES + changement des scripts diag.sh).
Sur la base de ces tests, confirmation que le fact_ed_dz=0.07 utilisé dans splith est bon.
Quelques corrections sur le tutorial_ada.tar.

12/2/2018

Compte rendu du poihl du 12/2/2018

Durée : 5mn (2 personnes physiquement présentes!)


Consolidation LMDZ6 :
=====================

Frédéric a probablement identifié les origines de la non indépendance par
rapport au nombre de processeurs mpi x openMP.
Ca change un peu les résultats numériques mais rien d'inquiétant a priori.
Du coup, il serait bien de basculer les chaînes splith et ttop sur les nouveaux sources
(attention, les commissions ne sont faites pour le moment que sur la trunk).
Il faudrait aussi lancer des simulations forcées (a priori Abderrahmane) pour vérifier
qu'on n'a pas de mauvaise surprise (pareil: sur la splith et la ttop).

A priori, on conserve pour CMIP6 les configurations ttop et splith
à qui il faut trouver un petit nom : IPSL-CM6A et 6B ?
En prenant pour 6A celle qu'on aura retenu comme prioritaire ?
Les diagnostics d'Abderrahmane confirment que les tailles de gouttes sont
beaucoup trop petites dans la version ttop et que c'est mieux dans splith
(c'était une des grosses cibles du réglage de splith).

>>> inchangé par rapport au CR du 2018/02/05 <<<
Date butoir absolue du lancement des simulations : semaine du 5 février;
     Data request terminée / évaluée.

Plantage/1+1=2/reproductibulité :
     Plantage dans une 4 CO2 dans une pi Controle Split D. Plantage sur un
     autre abrupt 4 CO2. QUi pourrait être cette fois sur la convection.
     Plantage splitD : fin avril sur les grandes plaines.

     Problème apparu récemment de non reproductibilité suivant le nombre
     de proc Omp.
     Source de non reproductibilité identifié dans la routine
     flott_gwd_rando.

Passage à la 6014 :
    Trois versions en machine : ttop, split-D et splith
    Problème identifié par Jean-Yves sur le couplage entre les poches et
    les thermiques.
    A tester en priorité pour voir si c'est important.


Lancement des simulations :
===========================
>>> inchangé par rapport au CR du 2018/02/05 <<<

Contribution des ingénieurs de l'équipe :
-----------------------------------------
Répartition envisagée :
Ionela et Abderrahmane s'occuperaient de CFMIP
Laurent s'occuperait des scenario.
Lidia pourrait porter les amip.


Préparation des simulations MR pour le Deck CMIP6 :
---------------------------------------------------
Plutôt SplitH. Vérifier les forçages.

Contrôle des sources :
----------------------
Jean-Yves a refait tourné son (super) script. Regarder s'il reste des choses embêtantes. Ionela va regarder les variables autres que l'ozone dans physiq_mod.F90

Préparation des configs :
-------------------------
RAS

Data request (responsable Laurent et Sandrine)
==============================================
>>> inchangé par rapport au CR du 2018/02/05 <<<
Nouvelle release de la dataRequest 1.0.20. Depuis la 1.0.21
Une journée de boulot pour faire le merge avec ce qu'on avait nous.
Ce qui est commis est compatible 1.0.21.

On est passé de 330 à 326 variables demandées.
82 qu'on ne fournira pas.
42 encore à trouver mais qu'on ne fournira sans doute pas non plus.

Commissions de modification sur les fréquences de convection
   (profonde/peu profonde).

Autres corrections diverses sur les précipitations diverses.

Problème de calendrier Cosp résolu.
   Reste la question de la compilation debug. Marche chez
   Abderrahmane. Faire en sorte que ca marche en couplé.

Problème xios avec le moyennage de certains champs (entre les mains d'Arnaud)

Ménage sur le histmth en cours.
   A renvoyé une liste de variables plus complète.

http://lmdz.lmd.jussieu.fr/developpeurs/groupes-de-travail-1/data-request-cmip6-et-workflow-ipsl/histmth1.html

En cours: Ionela reprend le calcul du vent à 10m ce qui implique un
réaménagement dans pbl_surface_mod.F et se pose la question de l'interaction entre les rafales et le splitting, Jean-Yves regarde



Articulation convection profonde / convection peu profonde
==========================================================
>>> inchangé par rapport au CR du 2018/02/05 <<<
Faire le point sur ce qui est vraiment dans le code
* Splitting des poches : équations imprésentable
* Entrainement convectif / nouvel épluchage
* Tube dentifrice (à tester)
* Dyamique de population de poches
* gestion des précipitations

Evolution physique/versions futures :
=====================================
>>> inchangé par rapport au CR du 2018/02/05 <<<
Jean-Yves travaille sur le splitting : Jean-Yves a commis une version du splitting sans écart de température de surface (et découvert au passage un problème dans l'articulation poches/thermiques)
 (inchangés ci-dessous)
* Jean-Yves, Jean-Philippe et Catherine pensent qu'il faut éliminer une
   partie des précipitations dans les ascendances adiabatiques.
* Eau avec source méthane
* sursaturation
* Augmentation de la résolution.
* grille plus groissère en bas pour la convection


Dynamico :
==========
On a obtenu le GRand Défi sur Irène!
Stagiaire de M1 qui bossera avec Simon pour regarder les spectres
    des simulations.
Grand challenge sur Irene (remplacement de curie) : soumis
1/ simulation globales LMDZ à 50km, production highresMip
2/ Passage à 25km
3/ Passage à dynamico
Demande de calcul sur le compte rces sur irene.

Tuning automatique :
====================
>>> inchangé par rapport au CR du 2018/02/05 <<<
Frédéric continue à travailler sur les scripts R

Convergence 1D std / Dephy :
============================
>>> inchangé par rapport au CR du 2018/02/05 <<<
Marie-Pierre s'est remise sur les fichier de Fleur.
A modifié la création des outputs standard.
A travaillé dessus pour la présentation aux AMMA.
A envoyé à Florence une série de simulations en version 6014ttop.
Envoyer la version splith.

Publications :
==============
>>> inchangé par rapport au CR du 2018/02/05 <<<
- Stratocumulus (Arnaud Jam)
     A récupéré les sorties d'Irina Sandu.
- Thermiques / stratocumulus / bords Est (Frédéric)
- Splitting (Jean-Yves)
- Couplage / Flux de surface / rafales (Traore)
- Tuning (Ionela/Frédéric)
- Articulation convection peu profonde / profonde ?


tickets trac :
==============
#9      Modifications pour une dynamique commune (terre \u2013 planete)
#11     Menage sur les prints
#21     "day_ini" dans "create_etat0_limit" et "gcm"
#28     Initialisation problems in cloudth ?
#30     Pb valeurs nulles/non définies sur configs linux
#32     Concervation de la masse des traceurs dans la dynamique
#34     Calving faux en zoome
#44     getin_dump et name
#52     readchlorophyll en OpenMP?
#54     Erreur sur la vorticité en mode zoomé
#55     Constantes non uniformes dans le modèle
#56     Vérifier le calcul des nombres de jours de pluie
#61     Calendrier     Consolidation
#62     Problème avec les variables SAVE dans yamada4?
#66     Sensibilité au pas de temps de la fermeture stochastique
#67     Traceurs et isotopes.
#70     Conservation de l'énergie avec l'eau
#71     Filtrage de la vorticité
#74     grossismx
#75     ppm3d non fonctionnel
#76     Sortie epmax
#77     Fréquence des fichiers aérosols
#82     Nouveau calcul de wind10m
#83     Mais où est donc passée la prise en compte de la ALP
        conditionnelle ?
#84     Use getin_p instead of getin
#85     Rayonnement dans le 1D
#87     cycle_diurne et iflag_cycle_diurne
#88     routines cldrag
#89     Problèmes grille zoomée


Tour de table :
===============

Adrianna :
----------
RAS

Ehouarn :
---------
- Problème identifié sur XIOS réglé (pb de dépassement pour une "missing value" convertie en "short"); merci Arnaud.
- Demande DARI "Atmosphère planétaires" soumise; 2.29Mh sur Occigen.
- Tests ancienne physique sur Ada avec la r3199. OK.

e-Abderrahmane :
----------------
- J'ai tourné 3 simulations LMDZOR forcé, correspondant aux 3 derniers réglages ttop, splith et sipliD.
Les diagnos multi-atlas :
https://vesg.ipsl.upmc.fr/thredds/fileServer/IPSLFS/fabric/lmdz/MultiSimu/LMDZOR6014/ACCUEIL.html
- J'ai tourné 2 simulations pour tester la correction de Jean-Yves sur le couplage entre les poches et les thermiques.
Les diagnos multi-atlas :
https://vesg.ipsl.upmc.fr/thredds/fileServer/IPSLFS/fabric/lmdz/MultiSimu/LMDZORsplith/ACCUEIL.html
- J'ai comparé pour les 3 simulations ttop, splith et sipliD les rayons des goutes issus du simulateurs Modis avec les observations Modis :
www.lmd.jussieu.fr/~idelkadi/Modis/CLOUD_PARTICLE_SIZE_LIQ_Janvier.ps
- J'ai mis à jours Cosp sur la trunk et la CM6.0.15 suite à la correction d'un bogue dans Modis (Corrigé récemment dans la version officielle v1.4.2 de Cosp).

e-Frédéric :
------------
Espere avoir retrouver l'indépendance vis-à-vis du découpge de domaine.
Problèmes dans les routines gwd_rando et cv3_yield à cause d'un
choix de niveau vertical sur un profile d'altitude au milieu du domaine
en klon/2.
Problème de mauvaise gestion du niveau klev+1 pour la tke.
Le problème apparaissait sans doute à cause de la diffusion verticale dans
yamada4. Mais dans les tests en local, il on ne perdait effectivement
l'indépendance au découpage que si on activait tend_to_tke qui
calcule des sources de tke à partir des tendances orographiques.
Pour trouver, le problème, j'ai équipé la physique avec des sorties
systématiques de la TKE avec les routines iophys_* basées sur les
routines iotd_* de mes cours de modélisation.
Je faisais deux simulations avec deux découpage différent et comparais
les deux fichiers.
J'ai perdu du temps avec le fait qu'il fallait sortir en "double" plutôt qu'en "float"
pour identifier le problème dés son apparition.

5/2/2018

Compte rendu du poihl du 5/2/2018

Durée : 1h15


Consolidation LMDZ6 :
=====================

Date butoir absolue du lancement des somulations : semaine du 5 février;
     Data request terminée / évaluée.

Plantage/1+1=2/reproductibulité :
     Plantage dans une 4 CO2 dans une pi Controle Split D. Plantage sur un
     autre abrupt 4 CO2. QUi pourrait être cette fois sur la convection.
     Plantage splitD : fin avril sur les grandes plaines.

     Problème apparu récemment de non reproductibilité suivant le nombre
     de proc Omp.
     Source de non reproductibilité identifié dans la routine
     flott_gwd_rando.

Passage à la 6014 :
    Trois versions en machine : ttop, split-D et splith
    Problème identifié par Jean-Yves sur le couplage entre les poches et
    les thermiques.
    A tester en priorité pour voir si c'est important.


Lancement des simulations :
===========================

Contribution des ingénieurs de l'équipe :
-----------------------------------------
Répartition envisagée :
Ionela et Abderrahmane s'occuperaient de CFMIP
Laurent s'occuperait des scenario.
Lidia pourrait porter les amip.


Préparation des simulations MR pour le Deck CMIP6 :
---------------------------------------------------
Plutôt SplitH. Vérifier les forçages.

Contrôle des sources :
----------------------
Jean-Yves a refait tourné son (super) script. Regarder s'il reste des choses embêtantes. Ionela va regarder les variables autres que l'ozone dans physiq_mod.F90

Préparation des configs :
-------------------------
RAS

Data request (responsable Laurent et Sandrine)
==============================================
Nouvelle release de la dataRequest 1.0.20. Depuis la 1.0.21
Une journée de boulot pour faire le merge avec ce qu'on avait nous.
Ce qui est commis est compatible 1.0.21.

On est passé de 330 à 326 variables demandées.
82 qu'on ne fournira pas.
42 encore à trouver mais qu'on ne fournira sans doute pas non plus.

Commissions de modification sur les fréquences de convection
   (profonde/peu profonde).

Autres corrections diverses sur les précipitations diverses.

Problème de calendrier Cosp résolu.
   Reste la question de la compilation debug. Marche chez
   Abderrahmane. Faire en sorte que ca marche en couplé.

Problème xios avec le moyennage de certains champs (entre les mains d'Arnaud)

Ménage sur le histmth en cours.
   A renvoyé une liste de variables plus complète.

http://lmdz.lmd.jussieu.fr/developpeurs/groupes-de-travail-1/data-request-cmip6-et-workflow-ipsl/histmth1.html

En cours: Ionela reprend le calcul du vent à 10m ce qui implique un
réaménagement dans pbl_surface_mod.F et se pose la question de l'interaction entre les rafales et le splitting, Jean-Yves regarde



Articulation convection profonde / convection peu profonde
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(inchangé)
Faire le point sur ce qui est vraiment dans le code
* Splitting des poches : équations imprésentable
* Entrainement convectif / nouvel épluchage
* Tube dentifrice (à tester)
* Dyamique de population de poches
* gestion des précipitations

Evolution physique/versions futures :
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Jean-Yves travaille sur le splitting : Jean-Yves a commis une version du splitting sans écart de température de surface (et découvert au passage un problème dans l'articulation poches/thermiques)
 (inchangés ci-dessous)
* Jean-Yves, Jean-Philippe et Catherine pensent qu'il faut éliminer une
   partie des précipitations dans les ascendances adiabatiques.
* Eau avec source méthane
* sursaturation
* Augmentation de la résolution.
* grille plus groissère en bas pour la convection


Dynamico :
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RAS
Stagiaire de M1 qui bossera avec Simon pour regarder les spectres
    des simulations.
Grand challenge sur Irene (remplacement de curie) : soumis
1/ simulation globales LMDZ à 50km, production highresMip
2/ Passage à 25km
3/ Passage à dynamico
Demande de calcul sur le compte rces sur irene.

Tuning automatique :
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Frédéric continue à travailler sur les scripts R

Convergence 1D std / Dephy :
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Marie-Pierre s'est remise sur les fichier de Fleur.
A modifié la création des outputs standard.
A travaillé dessus pour la présentation aux AMMA.
A envoyé à Florence une série de simulations en version 6014ttop.
Envoyer la version splith.

Publications :
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(inchangé)
- Stratocumulus (Arnaud Jam)
     A récupéré les sorties d'Irina Sandu.
- Thermiques / stratocumulus / bords Est (Frédéric)
- Splitting (Jean-Yves)
- Couplage / Flux de surface / rafales (Traore)
- Tuning (Ionela/Frédéric)
- Articulation convection peu profonde / profonde ?


tickets trac :
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#9      Modifications pour une dynamique commune (terre \u2013 planete)
#11     Menage sur les prints
#21     "day_ini" dans "create_etat0_limit" et "gcm"
#28     Initialisation problems in cloudth ?
#30     Pb valeurs nulles/non définies sur configs linux
#32     Concervation de la masse des traceurs dans la dynamique
#34     Calving faux en zoome
#44     getin_dump et name
#52     readchlorophyll en OpenMP?
#54     Erreur sur la vorticité en mode zoomé
#55     Constantes non uniformes dans le modèle
#56     Vérifier le calcul des nombres de jours de pluie
#61     Calendrier     Consolidation
#62     Problème avec les variables SAVE dans yamada4?
#66     Sensibilité au pas de temps de la fermeture stochastique
#67     Traceurs et isotopes.
#70     Conservation de l'énergie avec l'eau
#71     Filtrage de la vorticité
#74     grossismx
#75     ppm3d non fonctionnel
#76     Sortie epmax
#77     Fréquence des fichiers aérosols
#82     Nouveau calcul de wind10m
#83     Mais où est donc passée la prise en compte de la ALP
        conditionnelle ?
#84     Use getin_p instead of getin
#85     Rayonnement dans le 1D
#87     cycle_diurne et iflag_cycle_diurne
#88     routines cldrag
#89     Problèmes grille zoomée


Tour de table :
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Marie-Pierre :
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install 3167 -> 3175 OK
A repris les textes des mini projets du cours OACOS.

Ehouarn :
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Soucis OpenMP sur la 3180. Va faire la dichotomie pour savoir d'où ça vient.
Demande Dari pour jeudi.
Toujours des problèmes avec XIOS.

Jean-Yves :
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A travaillé sur le splitting.
Va passer le script sur les openMP/thread private.
Travaille sur la dynamique de population des poches.

Abderrahmane :
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Commissions sur Cosp.
Ménage dans les routines d'écriture des variables.
A fait des modifications pour le problème du dernier pas de temps qui
ne sortait pas. Il fallait ajouter un attribut dans les xml.
A lancé trois simulations en revenant à une version précédente de XIOS.
A retravaillé la page web cosp.

Laurent :
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Travaille sur la dataRequest.
A récupéré dans la trunk et mis dans la branche les modifications nécessaires.
La branche est prête à distribuer.
A continué à aider Patricia sur des histoires d'interface entre LMDZ et orchidee.

Marie-Alice :
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Cherche à sortir le point de plantage 4CO2 et à remettre au carré
les simulations en machine.

e-Lidia
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- simulations LMDZ6

* CM6.0.12 : mise à jour de la page Wiki LMDZ6 avec les simulations CM6.0.12 Amip Contrôle-Guidage et
les Multi-Atlas associés

http://lmdz.lmd.jussieu.fr/Members/lmellul/simulations-lmdz6

* CM6.0.14 : configuration des simulations Amip
==> exécution de la simulation de contrôle Amip CM6.0.14 split
en cours (une dizaine d'années), la split est la split du modèle
à l'installation, équivalent de la splitD.

- simulations LMDZ6-CAUSES

* CM6.0.11.3 : mise à disposition des résultats CAUSES à haute
fréquence, avec les sorties du modèle LMDZ.
mise en forme des résultats au format CAUSES, avec un script.
automatisation du script pour le traitement de toutes les variables,
et pour la période d'étude CAUSES.
mise à disposition des résultats au format CAUSES.

* CM6.0.12 : identification du segmentation fault à l'exécution, vient
de la nouvelle version XIOS2
une solution pour la définition des sous-domaines CAUSES :
configuration du modèle CM6.0.12 avec la version XIOS2 de la CM6.0.11.3.
==> exécution OK dans cette configuration.

- simulations LMDZ6-Vagues de Chaleur

* CM6.0.12 : mise en place de la configuration des simulations avec les
variables résultats haute fréquence de CAUSES, pour 2 années distinctes,
chaque année à un point de sortie du modèle pour les résultats à haute
fréquence de la composante atmosphère.
des variables résultats supplémentaires sont à définir pour la
composante Orchidee, à la fréquence journalière.
ces variables résultats et la fréquence journalière ne sont pas
définis dans la configuration standard du modèle.


Frédéric :
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Contribution aux projets genci : tuning sur rlmd
Travail sur les scripts R de itune.
A travaillé sur la routine de François Lott.