Compte-rendus PoiHL 2018

10/12/2018

Compte rendu du poihl du 10/12/2018

Formation LMDZ:
- Toujours 27 personnes (un désistement et une nouvelle arrivée). 19 demandent un PC formation
- Le clonage des PCs formation est lancé. Il faudra tester les TPs dessus...

Les TPS: Rappel les énoncés 2017 sont sur /home/users/lmdz/WWW/Distrib/Tutorials_docs_2017 (de l'extérieur http://www.lmd.jussieu.fr/~lmdz/Distrib/Tutorials_docs_2017) et 2018 sur /home/users/lmdz/WWW/Distrib/Tutorials_docs_2018. Il faudra basculer le lien sous "pub" pour pointer sur 2018.
- TP1: Nicolas le teste (+le 1D). Et l'énoncé du TD1 est corrigé pour que les étudiants aient fait le "bon" run pour l'analyse des paramétrisations physiques du jour 2.
- Adriana teste le TP2, y compris le nudging (sur Ciclad) => désignée responsable du TP2.
- TP Orchidee : Frédérique?
- TP XIOS: semble avoir des pb à l'exec. sur les PCs formation... à suivre (Ehouarn)
- TP parallèle: OK. (Ehouarn)
- TP physiques: Lidia va tester sur Ciclad.
- TP traceurs: Adriana teste.
- TP 1D: Marie-Pierre a testé. Ca marche.
Cours: N'oubliez pas de revoir vos cours et tirer les polys (e.g. 3-4 pages par feuille) !

Aspects pratiques:
- Penser à installer la salle 205 vendredi après-midi : Bonnes volontés bienvenues...

Tour de table:

Lidia: simu CMIP6 sur Irene; pb de plantage machine et post-traitement à faire en manuel... Mêmes pbs pour Yangfen
Jean-Yves: c'est reparti pour les aérosols avec Binta
Ionela: sur la correction des T2m; regarde avec Guillaume pour un post-processing python et avec Yann pour règler ça via XIOS.
Les autres: préparation de la formation LMDZ...

3/12/2018

Compte rendu du poihl du 3/12/2018

Durée 1h10.

Tour de table

Marie-Pierre: Formation LMDZ

  • il y a 27 inscrits !
  • Lionel va retirer le STOP dans leapfrog pour ne pas avoir les exceptions IEEE à la fin de chaque exécution
  • on propose de faire installer la version 20181108=svn 3412

Jean-Yves:

Travaille sur l'organisation des calculs de la convection de façon à éliminer les précipitations liquides au cours de l'ascendance adiabatique.

Jean-Baptiste:

N'a plus de voix car il fait beaucoup d'enseignement !

Avec ses étudiants de licence, il travaille sur les modèles EDUEARTH ou EDUPLANET.

Son projet CLUEDO (Cluster Educatif Open Source) soumis avec l'aide de P.Weill, J.Lefrère; A.Spiga et F.Codron a été accepté. Il pourrait fonctionner dés le second semestre.

Lionel:

  • demande s'il y a des modifications qui sont intervenues dans les E/S du modèle pour mettre à jour sa présentation. A priori non.
  • Marie-Alice signale que pour CMIP6, les sorties sont générées en mode compressé (sans perte de précision) par XIOS.
  • avec H.Bellenger et X. Perrot (postdoc), il travaille sur la paramétrisation de la température à l'interface océan/atmosphère. Il se demande s'il vaut mieux créer une branche sur svn ou essayer un transfert svn - git, le temps du projet. L'inconvénient de la branche svn est que ça fait du bruit pour tout le monde.
     

Laurent:

  • travaille sur la convergence de la physique Dynamico: il a "mergé" la physique Dynamico dans la trunk. Le modèle compile et tourne mais il n'a pas la convergence numérique (il est en 144x142x79 sur 5 jours).
  • modifié le serveur LMDZpedia pour pouvoir inclure des graphiques et des fichiers sources
     

Marie-Alice:

  • réunion demain, mardi 4/12 du projet QUEST, modèle IPSL-CM6 en MR1
  • O.Marty a crée une grille en 64 bits : grid-p8
  • très décue du rapport du TGCC sur LMDZ ! Il semblerait que le modèle passe trop de temps dans la préparation des variables pour les sorties (70% du temps !). Laurent a déjà fait des tests en retirant toutes les sorties et ca ne lui a pas paru aussi important !? Le temps sur Irene est de 9000 secondes pour 1 an. Le temps équivalent sur Curie n'est pas indiqué. Marie-Alice et Laurent vont préparer une réponse.
  • Frédérique Vidal, ministre de l'Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation, et  Mounir Mahjoubi, secrétaire d'Etat au numérique, ont présenté, le 28 novembre 2018 à Toulouse, les grandes orientations de la stratégie nationale de recherche en intelligence artificielle (IA). Il a annoncé l'arrivée d'une nouvelle machine à l'IDRIS, d'une puissance de 10 Pétaflops dédiée à l'intelligence Artificielle. Nous n'avons pas plus de détail pour le moment. Voir ici.

26/11/2018

Pas de POIHL

19/11/2018

Compte rendu du poihl du 12/11/2018

Formation LMDZ:

- 24 inscrits! 17 veulent un PC formation.

- Logistique: pause-café OK. Tickets de cantine OK. On mettre un cable + Wifi pour le WWW. Penser aux multiprises... Penser à faire une feuille avec les commande de base Ferret (et Grads?)

- demander une slide de présentation à chaque étudiant (action MP).

- PC formation (Ubuntu 18) à préparer pour le vendredi 7 (lundi 10 au plus tard!) ; avec une version locale pour éviter téléchargement (modifier install_lmdz.sh pour l'occasion ? => action Ehouarn). Karine peut préparer des PCs Ubuntu 16 et 18 pour premiers tests au bocal de jeudi 22/11 (MP lui donne un install.sh). Avec un beau fond d'écran "formation LMDZ"! (action Karine + Laurent)

- Le programme: On reprend le déroulement de 2017: "configuration" + "physiques idéalisées" Lionel G., J-B fait les nuages (donc le reste de la physique aussi?). Interface par Jean-Louis. Paramétrisations physiques: Marine? + J-B (rappel: mettre moins de détail sur les GW et plus d'exemples)? Install: Laurent + Ionela? Aérosols: Olivier B.

- Qui sera là: Adriana ? Ionela ? Marine ? Abderrahmane ? Lidia ? ... ? Si Frédérique n'est pas là, qui sera l'expert ORCHIDEE? Joséfine? Patricia?

- Les TPs: a priori on rejoue les mêmes. Première séance de tests Jeudi au Bocal! Les textes sont sur le site (sur le compte LMDZ; faire un  Distrib/Tutorials_docs_2018/ calqué sur Distrib/Tutorials_docs_2017/ pour commencer. Action Ehouarn. Qu'y a t'il a ajouter? Il faut choisir ou désigner un responsable rédaction pour chaque TP:

TP1: ? , TP2: ?, traceurs: ? orchidee: ? 1D : Marie-Pierre , Physique: ?, XIOS: Ehouarn, Parallelisme: Ehouarn

- La doc: Faire un effort pour remplir LMDZPedia? En repartant des mails passés à lmdz-users. Action Laurent d'ici jeudi: mettre à jour (ou non) LMDZPedia.


Tour de Table:

Marie-Pierre: install 1D 3412. Tout va bien. Continue à travailler sur le calendrier 365 jours. Sera commit un jour (une fois le moratoire levé). Prépare tous les cas 1D pour fonctionner avec calendrier "vrai".

Laurent: Sur la convergence Dynamico-LMDZ. A commit la version de Yann sur la branche DYnamico-Conv. Merge avec la trunk en cours.

Jean-Yves: Apprend à cloner les RaspberryPi...

Ehouarn: A testé la 3412 sur Ada. OK.




12/11/2018

Pas de POIHL

5/11/2018

Compte rendu du poihl du 5/11/2018

===================
(après épilation de deux poihls)

Durée: 1h30

Prochaine formation LMDZ :
==========================
17-18-19 décembre
20 incsrits (en comptant les deux high-tune en attente de réponse)
C. Rio pas là
Jean-Louis et Jean-Baptiste présents

Consolidation LMDZ6 :
=====================

Problème de réstartabilité résolu: c'était un problème
de configuration pour les simulations CLIM. Pour résoudre le problème,
il suffit de mettre VEGET_UPDATE_at_start=n dans orchidee.card

Vérifier si les problèmes de reproductibilité sur ada avec
install_lmdz.sh sont résolus. (F&F) Qui semblaient être là même
sans orchidee.

Inchangé en-dessous

Problèmes de reproductibilité sur curie (Abderrahmane).
   Résolu avec la branche svn3353 plutôt que la trunk 3360.
   Abderrahmane s'en occupe avec Laurent.

Inchangé ci dessous :
* Ionela a des problèmes équivalents quand elle met les calculs
       directement dans pbl ou dans un sous programme.
* Plantages bizares à la ligne de changement de date dans les aquaplanetes
de Max.


Problème de diagnostics pour T2m :
----------------------------------
Ionela :
Si on a T2m et T2m_max on peut identifier les points bizares
    à partir d'une simulation corrigée qu'on utilise pour
    déterminer M=max( T2m_max-T2m ) en chaque point de grille.
Sur une simulation buggée, on corrige les points où T2m_max-T2m>M.

On remplace la valeur abhérante par une interpolation
temporelle sur 2, 4 ou 6 jours et apres j'ai applique egalement une
interpolation spatiale sur 4 points (nord-sud+est-ouest) pour combler
les points abherants restants pour le premier et/ou le dernier jour
de simulation.
Privilégier la correction au même point plutôt que les moyennes spatiales.

J'ai teste sur le run Amip et un run historical r1i1p1f1. Ca a l'air de bien
marcher.
Pour Amip j'ai utilise comme reference le run Amip corrige on-line sur
les points terrestres (simulation PatchTER).
Pour le run historical j'ai pris comme reference une simulation couplee
corrigee on-line en global du membre 2 (r2i1p1f1).

Le vent max a 10m ne semble pas affecte par des valeurs "abherantes", mais
je n'ai pas verifie que les situations abherantes correspondent a des vents
tres faibles. A faire.

L'humidite specifique ne semble pas affectee mais elle doit l'etre
puisqu'en tracant l'humidite relative minimale (hursmin) j'ai trouve
beaucoup (je dirais beaucoup plus si l'on compare aux valeurs abherantes de
tasmax) de jours avec des valeurs negatives.
A cause de ces valeurs negatives qui risquent d'etre presentes plusieurs pas
de temps dans la journee (a verifier quand meme), je dirais qu'il est
impossible de corriger huss et hurs.
   Diagnostiquer la fraction de points avec des rh2m_min négatifs.
   Regarder si on a sorti systématiqument rh2m_min quand on sortait t2m_max.
   Regarder l'erreur sur rh2m, rh2m_min et q2m (par comparaison des simulations
    jumelles)

Frédérique :
* Dans les cas qui plantent, la longueur de Monin Obukov et Richardson ne sont
pas du même signe. Peut-être lié à l'humidité.
   Si on prend tout sec on n'a plus de problème.
   Ou si on prend l'humidité de l'air patout (et pas beta qsat d'Orhcidee)
      on n'a plus de problème non plus.
   Le beta qsurf est très fort et beaucoup plus fort que l'humidité de l'air.
   Est-ce le cas ?
* Vérifier que l'utilisation de l'humidité à la surface beta qsat est bien
    cohérente et applicable à toutes les sous surface (Frédérique)
* Vérifier qu'on ne viole pas la 2ème principe (Jean-Yves)


Haute résolution + dynamico :
-----------------------------
Note sur la comparaison dynamico/lon-lat avec la physque 6A.

Contrôle Qualité / trunk / scripts
==================================
(inchangé)

install_lmdz.sh marche en local et sur ciclad avec ifort (ancien ~ 2013).
      Il faudrait tourner avec 2018 pour pouvoir initialiser à NaN
      Mais toute la chaine pour lancer est différente.
      En plan pour le moment parce qu'il faudra faire en même temps la
bascule du lancement parallèle par libigcm de poe vers mpirun.

Passer au nouvel orchidee par défaut.
      Fait en option.

La compilation avec XIOS n'est pas à jour pour Orchidee.

Version 6B
==========
Projet PRACE déposé pour porter entre autre un modèle
MR025 : grille MR dans l'atmosphère et résolution 1/4° océan.
Début de l'allocation avril 2019.
Définir d'ici là, et tuner, une version nouvelle de la nouvelle physique.
* Correction T2m
A compléter ...

Articulation convection profonde / convection peu profonde
==========================================================
(inchangé)
* Jean-Yves : toutes les équations sont simples et claires en cours de publi.
* Modèle pronostic de densité de poches : en test
* Splitting des poches : en test
* Entrainement convectif / nouvel épluchage (à tester)
* Tube dentifrice (à tester)

Evolution physique/versions futures :
=====================================
(inchangés ci-dessous)

Frédéric a fait des tests sur les stratocumulus, sur la convection
profonde (densité de poches interactive et épluchage modifié de Catherine)

* Jean-Yves, Jean-Philippe et Catherine pensent qu'il faut éliminer une
partie des précipitations dans les ascendances adiabatiques.
* Eau avec source méthane
* sursaturation
* grille plus groissère en bas pour la convection

Tuning automatique :
====================
(inchangés ci-dessous)
Marie-Pierre a un script pour interpoller LES et 1D sur la même grille
verticale. Important pour les EOFs. A mettre sur svn (Marie-Pierre et Ionela)

Convergence 1D std / Dephy :
============================


Publications :
==============
(inchangé)
Frédérique confirme qu'elle va écrire une publi sur le forçage à la surface
Biais de Bords Est (Frédéric, en attente de correction pat Catherine)
Stratocumulus (entre les mains d'Arnaud)
Gusts/z0 (Traore, figures en cours).
Nuages (demander à Jean-Baptiste où il en est)
Splitting (Nicolas et Jean-Yves)
Convection/poches (Catherine)
Reste description générale, tuning forcé et couplé, stratégie des
lancement ajustement des historiques.

Prospective LMDZ :
==================
(inchangé)
Organiser une prospective LMDZ en janvier/février.
Une grosse réunion ?
Des réunions régulières avec visio ?


tickets trac :
==============
#9     Modifications pour une dynamique commune (terre – planete)
#11     Menage sur les prints
#21     "day_ini" dans "create_etat0_limit" et "gcm"
#28     Initialisation problems in cloudth ?
#30     Pb valeurs nulles/non définies sur configs linux
#32     Concervation de la masse des traceurs dans la dynamique
#34     Calving faux en zoome
#44     getin_dump et name
#52     readchlorophyll en OpenMP?
#54     Erreur sur la vorticité en mode zoomé
#55     Constantes non uniformes dans le modèle
#56     Vérifier le calcul des nombres de jours de pluie
#61     Calendrier
#66     Sensibilité au pas de temps de la fermeture stochastique
#67     Traceurs et isotopes.
#70     Conservation de l'énergie avec l'eau
#71     Filtrage de la vorticité
#75     ppm3d non fonctionnel
#76     Sortie epmax
#82     Nouveau calcul de wind10m
#84     Use getin_p instead of getin
#85     Rayonnement dans le 1D
#86     Get rid of "stop" comands in phylmd
#88     routines cldrag
#89     Problèmes grille zoomée :
#90     Nbre d'appel à cdrag buggé?
#91     iflag_con et restartabilité du modèle
#92     Incohérence paramètres d'overlap des nuages
#93     Plantage à la ligne de changement de date
#94     Problème de reproductibilité
#95     Problème de reproductibilité

le #94 doit pouvoir être fermé


Tour de table :
===============
JYG
---
A regardé travailler Marie-Pierre et Ehouarn.
Le 1D fonctionne en 365 jours.
Problème de notations pour le papier splting.
    Coefs A, B et K pour le couplage avec la surface.
    Phi = K ( h1 - hs )
    K est arbitaire et redondant avec A et B.
Jean-Yves fait circuler un texte extrait de son texte splitting.

Abderrahmane :
--------------
RAS

Adriana :
---------
RAS

Ionela :
--------
Runs avec la branche IPSL-CM5A mais .def nouvelle physique.
On a aussi les soucis de T2m. Y compris avec Orchidee2

Marie-Pierre :
--------------
Voudrait commettre les modifications pour avoir le calendrier 365 en 1D.
A préparé un document scientifique pour le MTS (ex MEDDE).

Frédéric :
----------
A travaillé sur une revue de la paramétrisation de la convection avec Catherine.
A écrit deux rapports convergence : 1 sur dynamico
http://www.lmd.jussieu.fr/~lmdz/DOCUMENTS/TRAVAIL/D2.1b.pdf
 et 1 sur les simulations à 50km.
http://www.lmd.jussieu.fr/~lmdz/DOCUMENTS/TRAVAIL/D2.5a.pdf
A contribué à l'écriture du projet PRACE soumis.
http://www.lmd.jussieu.fr/~lmdz/DOCUMENTS/TRAVAIL/Demande_Prace.pdf

29/10/2018

Pas de POIHL

22/10/2018

Pas de POIHL

8/10/2018

Pas de POIHL

15/10/2018

Compte rendu du poihl du 15/10/2018

Durée: 1h40

Prochaine formation LMDZ :
==========================
17-18-19 décembre

Pas beaucoup d'inscrits, relance avant les vacances puis le 2 novembre
C. Rio pas là
Jean-Louis et Jean-Baptiste présents
M. Ménegoz vient avec un mac, il est prévenu ....

Consolidation LMDZ6 :
=====================
Problèmes de reproductibilité sur ada (F&F). Résolu: c'était un problème de configuration pour les simulations CLIM. Pour résoudre le problème, il suffit de mettre VEGET_UPDATE_at_start=n dans orchidee.card

Inchangé en-dessous

Problèmes de reproductibilité sur curie (Abderrahmane). A analyser
     Ionela a des problèmes équivalents quand elle met les calculs directement dans pbl ou dans un sous programme.
Problèmes de reproductibilité sur ada (F&F). A analyser.
     Problèmes persistants sur ada (Frédéric).
Plantages bizares à la ligne de changement de date dans les aquaplanetes de Max.


Problème de diagnostics pour T2m :
----------------------------------

Corrections à posteriori, Ionela a fait des tests, discussion en cours

Les T2max ont été dépubliés ainsi que les t2m

Il faut aussi dépublier les q2m et les éventuels min/max de cette variable. Quid du rh?
Pas besoin de dépublier le vent à 10m

Il faut par ailleurs remettre complètement à plat le calcul des T2m, q2m et vent à 10m.

Utilisation des dernières (19 Millions d'heures !!!) sur curie !
----------------------------------------------------------------
Curie c'est fini ... on a une allocation CMIP6 sur IRENE

grosse consommation sur la fin de curie,

Haute résolution + dynamico :
-----------------------------------------
Points marquants de la réunion de vendredi:

Il faut rephaser le plus vite possible avec la trunk, les sources sont assez mûres pour qu'il n'y ait plus de différences
Couplage avec orchidee fait

Archiver la configuration Grand Challenge qui n'est que chez Traore

Pb quand on fait de la très haute résolution: problème d'écriture des restarts (limite des 2Go du Netcdf classique?). Faire une mise à jour netcdf dans la trunk LMDZ

Remarque que quand on descend en résolution (au 1/8e), obligé de baisser aussi le pas de temps physique sinon ça plante.

Perfs sur irene: la communauté astro a les mêmes problèmes de perfs (20% plutôt que 100%). Intel a réussi à faire du 100% en tweakant la compilation du code mais ne livre que le binaire sans dire comment ils ont fait ...


Contrôle Qualité / trunk / scripts
==================================
(inchangé)

install_lmdz.sh marche en local et sur ciclad avec ifort (ancien ~ 2013).
     Il faudrait tourner avec 2018 pour pouvoir initialiser à NaN
     Mais toute la chaine pour lancer est différente.
     En plan pour le moment parce qu'il faudra faire en même temps la bascule du lancement parallèle par libigcm de poe vers mpirun.

Passer au nouvel orchidee par défaut.
     Fait en option.

La compilation avec XIOS n'est pas à jour pour Orchidee.


Articulation convection profonde / convection peu profonde
==========================================================
(inchangé)
* Jean-Yves : toutes les équations sont simples et claires
                en cours de publi.
* Modèle pronostic de densité de poches : en test
* Splitting des poches : en test
* Entrainement convectif / nouvel épluchage (à tester)
* Tube dentifrice (à tester)

Evolution physique/versions futures :
=====================================
(inchangés ci-dessous)

Frédéric a fait des tests sur les stratocumulus, sur la convection profonde (densité de poches interactive et épluchage modifié de Catherine)

* Jean-Yves, Jean-Philippe et Catherine pensent qu'il faut éliminer une partie des précipitations dans les ascendances adiabatiques.
* Eau avec source méthane
* sursaturation
* grille plus groissère en bas pour la convection

Tuning automatique :
====================
(inchangés ci-dessous)

Ionela a réussi à faire les 6 métriques sur les simulations 3D globales.
     Est passée à 100 000 ou 1M de points.
     On arrive du coup à construire les cartes d'implausibilité.
     Faire les calculs avec la simulation CTRL (contrôle) plutôt qu'avec les vraies obs pour voir ce que ca donne.
Marie-Pierre a un script pour interpoller LES et 1D sur la même grille verticale. Important pour les EOFs
Ecrire un mail pour expliquer pourquoi on n'a pas consommé les 2Mh chez Laurent Li.


Convergence 1D std / Dephy :
============================
Marie-Pierre se pose des questions sur les différences de variables fournies entre les forçages 'Marie-Pierre' et les forçages 'Romain' en particulier aux demi-niveaux.

Publications :
==============
(inchangé)
Frédérique confirme qu'elle va écrire une publi sur le forçage à la surface
Biais de Bords Est (Frédéric, en attente de correction pat Catherine)
Stratocumulus (entre les mains d'Arnaud)
Gusts/z0 (Traore, figures en cours).
Nuages (demander à Jean-Baptiste où il en est)
Splitting (Nicolas et Jean-Yves)
Convection/poches (Catherine)
Reste description générale, tuning forcé et couplé, stratégie des lancement ajustement des historiques.

Labélisation :
==============
(inchangé)
Organiser une réunion de prospective LMDZ entre le 5 et le 16 novembre ?
Une grosse réunion ?
Des réunions régulières avec visio ?


tickets trac :
==============
 

#9     Modifications pour une dynamique commune (terre – planete)
#11     Menage sur les prints
#21     "day_ini" dans "create_etat0_limit" et "gcm"
#28     Initialisation problems in cloudth ?
#30     Pb valeurs nulles/non définies sur configs linux
#32     Concervation de la masse des traceurs dans la dynamique
#34     Calving faux en zoome
#44     getin_dump et name
#52     readchlorophyll en OpenMP?
#54     Erreur sur la vorticité en mode zoomé
#55     Constantes non uniformes dans le modèle
#56     Vérifier le calcul des nombres de jours de pluie
#61     Calendrier
#66     Sensibilité au pas de temps de la fermeture stochastique
#67     Traceurs et isotopes.
#70     Conservation de l'énergie avec l'eau
#71     Filtrage de la vorticité
#75     ppm3d non fonctionnel
#76     Sortie epmax
#82     Nouveau calcul de wind10m
#84     Use getin_p instead of getin
#85     Rayonnement dans le 1D
#86     Get rid of "stop" comands in phylmd
#88     routines cldrag
#89     Problèmes grille zoomée :
#90     Nbre d'appel à cdrag buggé?
#91     iflag_con et restartabilité du modèle
#92     Incohérence paramètres d'overlap des nuages
#93     Plantage à la ligne de changement de date
#94     Problème de reproductibilité
#95     Problème de reproductibilité

le #94 doit pouvoir être fermé


Tour de table :
===============
JYG
------
RAD

Ionela
---------

Runs sur ada pour analyse t2m, 4 climatiques, 1 bug, 1 borné, 2 avec des propositions de corrections pour le calcul de t2m.

+ simus avec borne sur curie: AMIP et AMIP4K

Laurent
-----------
Priorité, phasage DYNAMICO.

Adriana
-----------
RFMIP sur curie: 6 membres du tier 1 sont passés. Reste 2 expt du tier 2, sur irene: plantage, xml "cassés" et problème de dates fichiers de forçage aérosols. Une fois résolu avec l'aide de JLD, a pu tourner 2 membres des deux ensembles restants.

Ehouarn
-----------
Atoodit

Marie-Pierre
-----------------
S'est occupé des AMA 2019 11-12-13 mars: 2 jours: tuning de modèles et quantification des incertitudes + 1 jour lancement GDR DEPHY

Lidia
------
simulations CMIP6 sur curie, toutes passées: 10 membres AMIP de L. Li + extensions
Pour sensibilité à l'orographie, passées aussi. Le progamme de L.Li passé sur curie pour créer les restarts.
10 membres AMIP 1950-2014 passés sur curie aussi
+ une simulation AMIP/RFMIP pour JLD à faire avec le patch t2m

Marie-Alice
---------------
Formation modipsl + outils le 27 et 28 novembre, ORCHIDEE le 29 et 30
Journée brainstorming le 16/10 groupe plate-forme: réflexion et partage sur les taches essentielles maintenant que rush CMIP6/curie est passé
Travail IPSLCM6-MR1 dans le cadre de projet PRACE QUEST: quantification des incertitudes dans les modèles climatiques.
Lève le pied, TP 80% à partir de janvier

Frédérique
--------------
A testé la FAQ d'extraction des points, quelques corrections à apporter mais ça marche ...

 

 

1/10/2018

Compte rendu du poihl du 1/10/2018

Durée: 1h35

Prochaine formation LMDZ :
==========================
17-18-19 décembre

Consolidation LMDZ6 :
=====================
Problèmes de reproductibilité sur curie (Abderrahmane). A analyser
     Ionela a des problèmes équivalents quand elle met les calculs directement dans pbl ou dans un sous programme.
Problèmes de reproductibilité sur ada (F&F). A analyser.
     Problèmes persistants sur ada (Frédéric).
Plantages bizares à la ligne de changement de date dans les aquaplanetes de Max.


Problème de diagnostics pour T2m :
----------------------------------
vérifier que ce n'est pas utilisé par Orchidee
On utilise les relations de similitudes.
Ionela : sur 36 ans , 715 points dépassent 325 en t2m_max
   en journalier.
   Un point avec 21 dépassement sur 36 ans
   Un jour donné : au max 3 dépassements sur le globe
Propositions de corrections en cours
On rejoue 4 historical (r1, r2, r9, r10) et les amip de Ionela.

Les T2max ont été dépubliés.
Faut il en dépublier d'autre ?
Faut il rejouer un bout du piControl sur curie ?

Il faut par ailleurs remettre complètement à plat le calcul des T2m, q2m et vent à 10m.

Utilisation des dernières (19 Millions d'heures !!!) sur curie !
----------------------------------------------------------------
Test dynamico sur 10000 coeurs au 8eme de degré (Sébastien)
RFMIP (Jean-Louis et Adriana)
DCPP à fond (20 dates de départ). Utilisation massive ce week end
DAMIP : des simulations et des scenarios provisoires.
Un énorme merci pour la réactivité et l'engouement !!!

Haute résolution + dynamico :
----------------------------

Des résultats de 5 ans de dynamico (bucket pour la surface) dormaient depuis cet été.

Le multi atlas comparatif (en cours d'enrichissement) que je viens de lancer sur cette simulation et une simulation équivalente en lon-lat, toutes deux lancées par Abdoul Khadre Traore sous l'égide de Convergence et dans le
cadre du Grand Challenge sur irene, valident le couplage avec la version trunk.
Même si il reste un peu de travail pour qu'on ait une
configuration complète (orchidee avec routage, OpenMP, assemblage définitif et pérenne des deux trunk de dynamico et LMDZ, en attendant le couplage avec l'océan)
Les différences très bizares sur les pressions de surface ont disparu.
On a deux configurations du modèle indicernables en termes de climat moyen ; au sens où les différences minimes sur les moyennes zonales par exemple
https://vesg.ipsl.upmc.fr/thredds/fileServer/IPSLFS/fabric/lmdz/MultiSimu/DY
NAMICO.1/ZON/YEAR/index.html sont typiquement de l'ordre des différences associées à un changement de résolution horizontale modérée ou à un ajustement léger des paramètres radiatif.
cf aussi les cartes de pluies et T2m par exemple sur :
https://vesg.ipsl.upmc.fr/thredds/fileServer/IPSLFS/fabric/lmdz/MultiSimu/DY
NAMICO.1/ZON/YEAR/index.html


Contrôle Qualité / trunk / scripts
==================================
(inchangé)

install_lmdz.sh marche en local et sur ciclad avec ifort (ancien ~ 2013).
     Il faudrait tourner avec 2018 pour pouvoir initialiser à NaN
     Mais toute la chaine pour lancer est différente.
     En plan pour le moment parce qu'il faudra faire en même temps la bascule du lancement parallèle par libigcm de poe vers mpirun.

Passer au nouvel orchidee par défaut.
     Fait en option.

La compilation avec XIOS n'est pas à jour pour Orchidee.


Articulation convection profonde / convection peu profonde
==========================================================
(inchangé)
* Jean-Yves : toutes les équations sont simples et claires
                en cours de publi.
* Modèle pronostic de densité de poches : en test
* Splitting des poches : en test
* Entrainement convectif / nouvel épluchage (à tester)
* Tube dentifrice (à tester)

Evolution physique/versions futures :
=====================================
Frédéric a fait des tests sur les stratocumulus, sur la convection profonde (densité de poches interactive et épluchage modifié de Catherine)

(inchangés ci-dessous)
* Jean-Yves, Jean-Philippe et Catherine pensent qu'il faut éliminer une partie des précipitations dans les ascendances adiabatiques.
* Eau avec source méthane
* sursaturation
* grille plus groissère en bas pour la convection

Tuning automatique :
====================
Ionela a réussi à faire les 6 métriques sur les simulations 3D globales.
     Est passée à 100 000 ou 1M de points.
     On arrive du coup à construire les cartes d'implausibilité.
     Faire les calculs avec la simulation CTRL (contrôle) plutôt qu'avec les vraies obs pour voir ce que ca donne.
Marie-Pierre a un script pour interpoller LES et 1D sur la même grille verticale. Important pour les EOFs
Ecrire un mail pour expliquer pourquoi on n'a pas consommé les 2Mh chez Laurent Li.


Convergence 1D std / Dephy :
============================
Romain a repassé l'ensemble des cas au format standard à Marie-Pierre qui a commencé à regarder.
  Les fichiers de Romain sont en netcdf4. Ca plante à la lecture.
  En cours d'instruction.

Publications :
==============
(inchangé)
Frédérique confirme qu'elle va écrire une publi sur le forçage à la surface
Biais de Bords Est (Frédéric, en attente de correction pat Catherine)
Stratocumulus (entre les mains d'Arnaud)
Gusts/z0 (Traore, figures en cours).
Nuages (demander à Jean-Baptiste où il en est)
Splitting (Nicolas et Jean-Yves)
Convection/poches (Catherine)
Reste description générale, tuning forcé et couplé, stratégie des lancement ajustement des historiques.

Labélisation :
==============
Organiser une réunion de prospective LMDZ entre le 5 et le 16 novembre ?
Une grosse réunion ?
Des réunions régulières avec visio ?


tickets trac :
==============

#9     Modifications pour une dynamique commune (terre – planete)
#11     Menage sur les prints
#21     "day_ini" dans "create_etat0_limit" et "gcm"
#28     Initialisation problems in cloudth ?
#30     Pb valeurs nulles/non définies sur configs linux
#32     Concervation de la masse des traceurs dans la dynamique
#34     Calving faux en zoome
#44     getin_dump et name
#52     readchlorophyll en OpenMP?
#54     Erreur sur la vorticité en mode zoomé
#55     Constantes non uniformes dans le modèle
#56     Vérifier le calcul des nombres de jours de pluie
#61     Calendrier
#66     Sensibilité au pas de temps de la fermeture stochastique
#67     Traceurs et isotopes.
#70     Conservation de l'énergie avec l'eau
#71     Filtrage de la vorticité
#75     ppm3d non fonctionnel
#76     Sortie epmax
#82     Nouveau calcul de wind10m
#84     Use getin_p instead of getin
#85     Rayonnement dans le 1D
#86     Get rid of "stop" comands in phylmd
#88     routines cldrag
#89     Problèmes grille zoomée :
#90     Nbre d'appel à cdrag buggé?
#91     iflag_con et restartabilité du modèle
#92     Incohérence paramètres d'overlap des nuages

Tour de table :
===============

Marie-Alice
-----------
En transe avec l'extension de curie.
Gare au sevrage !

Jean-Yves
---------
RAS

Ehouarn
-------
On fait "mumuse" avec Jean-Yves sur LMDZPedia au dernier bocal.
Marche bien.
http://lmdz.lmd.jussieu.fr/LMDZPedia/
Permet d'inclure des html.
Pour partir de documents LaTeX existants :
- latex2html un peu lourd (formules sous forme image)
- tth plus léger. Qui comprend les formules mathématiques.
Mise en place de répertoires avec les .tex et pdf pour garder l'information propre, initiale.
3398 sur ada : RAS

Remarque de Lionel (hors POIHL)

 

Pour que la bannière soit lisible sur la page d'accueil de
LMDZpedia, il faudrait à mon avis que :

-- N'apparaisse pas la case "fichiers" joints à un article :

Effet de la formation de la glace sur la température de la particule
soulevée adiabatiquement (fichiers)

Pour cela, aller sur la page concernée et, dans l'onglet Edit,
sous-onglet Settings, cliquer "Exclude from navigation". En
contrepartie, on devrait mettre un lien interne vers cette page
"fichiers" depuis la page contenant l'article.

-- Il y ait un titre court (plus court) destiné à la bannière de la
page d'accueil (en gardant le titre long pour l'intérieur de l'article
bien sûr).



Abderrahmane
------------
A lancé une 3ème simulation pour le problème de reproductibilité sur une idée de Laurent. Mais différente des deux autres. Pas exploitable.
A lancé des simulations pour la thèse de Jean. A trouvé une erreur corrigée depuis sur la trunk.

Marie-Pierre
------------
3398 ok

Ionela
------
A regardé les problèmes high tune de Binta.
Pas encore résolu.
Tuning en 3D :
Avait mis 1 Million de points.

Frédéric
--------
RAS

24/9/2018

Compte rendu du poihl du 24/9/2018

Durée: 1h05

Prochaine formation LMDZ :
==========================
17-18-19 décembre
Annonce envoyée avec un questionaire
5 réponse (dont Martin Ménégoz)
Ionela présente le 17 seulement.

Consolidation LMDZ6 :
=====================
Problèmes de reproductibilité sur curie (Abderrahmane). A analyser
     Ionela a des problèmes équivalents quand elle met les calculs directement dans pbl ou dans un sous programme.
Problèmes de reproductibilité sur ada (F&F). A analyser.
Plantages bizares à la ligne de changement de date dans les aquaplanetes de Max.
Ouvrir trois tickets

Marie-Alice fait remarquer que :
Quand on a lancé les simulations paléo, les résultats sont différents si on démarre en 1850 ou en 2200.
Problème d'années bisextiles ? calendrier ?

Problème de diagnostics pour T2m :
----------------------------------
vérifier que ce n'est pas utilisé par Orchidee
On utilise les relations de similitudes.
Elles ne fonctionnent pas par vent très faible.
Il y avait un pensement mais on repasse dessus.
On trouve alors des T2m de 400K. Ne dure en général qu'un pas de temps.
      Doit faire des erreurs de 100K sur un pas de temps, soit 1K sur la température moyenne diurne.
Retourné 10 ans climatiques avec et sans pour estimer les eurreurs sur T2m (Frédérique)
Pour la amip du Deck, on peut les recalculer car on a les sorties à tous les pas de temps (Ionela)
Faut il dépublier les T2m, q2m max et min?
Question annexe : quel est le rôle du qsurf utilisé par stdlevvar ?

Corriger pour les simulations à venir.
Rejouer l'historique de base ?


Haute résolution + dynamico :
----------------------------
Le projet ESIWACE2 est passé. Affiché à 10km global.
Pour le moment, pas de gain de preformance sur irene.

Traore relance 10 ans de simulation avec dynamico LR.
      Frédéric va faire des multi atlas de comparaison.

Convergence avec la trunk :
     Yann a une nouvelle version.
     Laurent va l'intégrer dans la "conv" puis faire un merge.
     Puis réintégration sur la trunk pour avoir la même version définitivement.
     Priorité pour Laurent.

Josefine poursuit le highResMIP lon-lat (50km)
Passage à ORCA 1 enc ouplé avec le MR ?


Contrôle Qualité / trunk / scripts
==================================
(inchangé)

install_lmdz.sh marche en local et sur ciclad avec ifort (ancien ~ 2013).
     Il faudrait tourner avec 2018 pour pouvoir initialiser à NaN
     Mais toute la chaine pour lancer est différente.
     En plan pour le moment parce qu'il faudra faire en même temps la bascule du lancement parallèle par libigcm de poe vers mpirun.

Passer au nouvel orchidee par défaut.
     Fait en option.

La compilation avec XIOS n'est pas à jour pour Orchidee.


Articulation convection profonde / convection peu profonde
==========================================================
(inchangé)
* Jean-Yves : toutes les équations sont simples et claires
               en cours de publi.
* Modèle pronostic de densité de poches : en test
* Splitting des poches : en test
* Entrainement convectif / nouvel épluchage (à tester)
* Tube dentifrice (à tester)

Evolution physique/versions futures :
=====================================
Frédéric a fait des tests sur les stratocumulus, sur la convection
profonde (densité de poches interactive et épluchage modifié de Catherine)

(inchangés ci-dessous)
* Jean-Yves, Jean-Philippe et Catherine pensent qu'il faut éliminer une partie des précipitations dans les ascendances adiabatiques.
* Eau avec source méthane
* sursaturation
* grille plus groissère en bas pour la convection

Tuning automatique :
====================
Ionela a réussi à faire les 6 métriques sur les simulations 3D globales.
     Est passée à 100 000 ou 1M de points.
     On arrive du coup à construire les cartes d'implausibilité.
     Faire les calculs avec la simulation CTRL (contrôle) plutôt qu'avec les vraies obs pour voir ce que ca donne.
Marie-Pierre a un script pour interpoller LES et 1D sur la même grille verticale. Important pour les EOFs
Ecrire un mail pour expliquer pourquoi on n'a pas consommé les 2Mh chez Laurent Li.


Convergence 1D std / Dephy :
============================
Romain a repassé l'ensemble des cas au format standard à Marie-Pierre qui a commencé à regarder.
     1er essai : le cas arm_cu plante.

Publications :
==============
Frédérique confirme qu'elle va écrire une publi sur le forçage à la surface
Biais de Bords Est (Frédéric, en attente de correction pat Catherine)
Stratocumulus (entre les mains d'Arnaud)
Gusts/z0 (Traore, figures en cours).
Nuages (demander à Jean-Baptiste où il en est)
Splitting (Nicolas et Jean-Yves)
Convection/poches (Catherine)
Reste description générale, tuning forcé et couplé, stratégie des lancement
     ajustement des historiques.

Labélisation :
==============
Il devient urgent de redéfinir l'organisation.
Organiser une réunion de prospective LMDZ entre le 5 et le 16 novembre ?
Inviter Catherine, Martin, Nicolas


tickets trac :
==============

#9     Modifications pour une dynamique commune (terre – planete)
#11     Menage sur les prints
#21     "day_ini" dans "create_etat0_limit" et "gcm"
#28     Initialisation problems in cloudth ?
#30     Pb valeurs nulles/non définies sur configs linux
#32     Concervation de la masse des traceurs dans la dynamique
#34     Calving faux en zoome
#44     getin_dump et name
#52     readchlorophyll en OpenMP?
#54     Erreur sur la vorticité en mode zoomé
#55     Constantes non uniformes dans le modèle
#56     Vérifier le calcul des nombres de jours de pluie
#61     Calendrier
#66     Sensibilité au pas de temps de la fermeture stochastique
#67     Traceurs et isotopes.
#70     Conservation de l'énergie avec l'eau
#71     Filtrage de la vorticité
#75     ppm3d non fonctionnel
#76     Sortie epmax
#82     Nouveau calcul de wind10m
#84     Use getin_p instead of getin
#85     Rayonnement dans le 1D
#86     Get rid of "stop" comands in phylmd
#88     routines cldrag
#89     Problèmes grille zoomée :
#90     Nbre d'appel à cdrag buggé?
#91     iflag_con et restartabilité du modèle
#92     Incohérence paramètres d'overlap des nuages

Tour de table :
===============

Jean-Yves
---------
RAS

Marie-Pierre
------------
3394 ok

Frédérique
----------
atoodee

Laurent
-------
Se bat sur le quality control de la dernière simulations CFMIP

Abderrahmane
------------
Travaille sur le passage en OpenMP pour Cosp 2.
Marche en basse résolution mais pas avec montée en résolution.

Ionela
------
A aidé Jean Jouhaud à faire ses simulations seul.

Frédéric
--------
RAS

17/9/2018

Compte rendu du poihl du 17/9/2018

Durée:  55 min

Prochaine formation LMDZ :
==========================
17-18-19 décembre: dates bonnes, pas de réponses négatives à MPL
Au second. MPL a réservé la 205 mais voir si il faudrait pas plutôt la 201

MPL lance un premier message pour informer des dates.

Consolidation LMDZ6 :
=====================
Problème de reproductibilité (Abderrahmane). A analyser. inchangé
Plantages bizares à la ligne de changement de date dans les aquaplanetes de Max. en train de regarder

Marie-Alice fait remarquer que :
Quand on a lancé les simulations paléo, les résultats sont différents
si on démarre en 1850 ou en 2200.  Laurent regarde

Suivi/lancement des simulations CMIP6 :
======================================

Simulations CMIP6 d'Abderrahmane terminées. Prêtes à etre publiées

Simulation SST-clim lancées avec les mêmes niveaux de sortie que GMIP.
    Forcages actuels. A tourné de 1870 à 1990. Terminée: s'arrête en 2014

On compte les jours avant la fermeture de curie.

pdctrl.
   Rejouer 200 ans en s'assurant qu'on est bien compatible avec le pictrl.

Simuls de Lidia
--------------------

GMIP: 1er ensemble des simus de L.Li AMIP, QC Ok, attend éval scientifique de Laurent avant publication
veut faire les 7 prochains membres, Lidia a préparé, le 4ème est fait, le 5ème a planté, bypass avec hgardfou, est passé par dessus le plantage, les autres membres sont en cours d'exécution (80 sur 150 ans).
2ème ensemble de sensibilité sur l'orographie (qui diminue dans une région du Pacifique), simulations de 30 ans

Ensemble AMIP du DECK, les membres de 2 à 10 sont effectués, a fallu refaire le post-proc à la main, multimonitoring et mutli-atlas faits.
Membre 1: beaucoup de soucis parce que DR demandait beaucoup de sorties, a finalement tourné mi août
Attend évaluation scientifique pour publication.



Préparation des simulations MR pour le Deck CMIP6 :
---------------------------------------------------
inchangé

Une discussion a eu lieu sur le MR
Le couplé MR (256x256-L79) a tourné avec des forcages partiels (Marie-Alice)
A faire :
des simulations avec forcage propre
Passage à Nemo 0.25 degré
Sans doute un projet Prace sur le sujet.

Grand challenge + dynamico :
========================
Le projet ESIWACE2 est passé. Affiché à 10km global.
Pour le moment, pas de gain de performance sur irene.  à suivre ...

Sébastien Fromang, fait des spectres d'énergie avec un pic bizarre.
A la fois dans LMDZ et dynamico mais pas pareil.
Mais en fait les deux modèles n'ont pas la même discrétisation verticale.

En fait si c'est la même discrétisation mais c'est le coefficient de diffusion qui est différent. A confirmer

Manque un changement de signe sur le flux vertical entre la physique et la dynamique. 

 



Contrôle Qualité / trunk / scripts
==================================

Olivier B a des problèmes pour tourner install_lmdz.sh avec une version récente d'orchidee, se retrouve avec un STOP 1 à l'exécution. Frédérique a vérifié que ça tournait pour elle. Vient probablement des modifications d'Olivier à l'interface LMDZ/ORCHIDEE

FC doit compiler deux fois sur Ada avec xios car il manque des informations pour l'édition des liens

(inchangé ci-dessous)
install_lmdz.sh marche en local et sur ciclad avec ifort (ancien ~ 2013).
   Il faudrait tourner avec 2018 pour pouvoir initialiser à NaN
   Mais toute la chaine pour lancer est différente.
   En plan pour le moment parce qu'il faudra faire en même temps la bascule
      du lancement parallèle par libigcm de poe vers mpirun.

La compilation avec XIOS n'est pas à jour pour Orchidee.


Articulation convection profonde / convection peu profonde
==========================================================
(inchangé)
* Jean-Yves : toutes les équations sont simples et claires
              en cours de publi.
* Modèle pronostic de densité de poches : en test
* Splitting des poches : en test
* Entrainement convectif / nouvel épluchage (à tester)
* Tube dentifrice (à tester)

Evolution physique/versions futures :
=====================================
(inchangés ci-dessous)

Frédéric a fait des tests sur les stratocumulus, sur la convection
profonde (densité de poches interactive et épluchage modifié de Catherine)

* Jean-Yves, Jean-Philippe et Catherine pensent qu'il faut éliminer une
   partie des précipitations dans les ascendances adiabatiques.
* Eau avec source méthane
* sursaturation
* grille plus groissère en bas pour la convection

Tuning automatique :
====================
(inchangés ci-dessous)

Coding sprint jeudi et vendredi 6 et 7 septembre
   Encore un grand succès.
   Première émulation (par Ionela) de métriques de tuning sur les 250 simulations 3D réalisées
     (par Frédéric).
   Marie-Pierre a mis au point un script pour interpoler les SCM sur la grille des LES.

Ecrire un mail pour expliquer pourquoi on n'a pas consommé les 2Mh chez
   Laurent Li.


Convergence 1D std / Dephy :
============================
(inchangés ci-dessous)

Romain a repassé l'ensemble des cas au format standard à Marie-Pierre qui
   va essayer de les intégrer.

Publications :
==============
En cours


Labélisation :
==============
Il devient urgent de redéfinir l'organisation.
Organiser une réunion fin septembre.


tickets trac :
==============
(inchangé)
#9      Modifications pour une dynamique commune (terre \u2013 planete)
#11     Menage sur les prints
-> ??? #21     "day_ini" dans "create_etat0_limit" et "gcm"
-> ??? #28     Initialisation problems in cloudth ?
-> Faire test snan et fermer. #30     Pb valeurs nulles/non définies sur configs linux
#32     Concervation de la masse des traceurs dans la dynamique
#34     Calving faux en zoome
Lionel confirme qu'on laisse ouvert le #44     getin_dump et name
-> mail Olivier (B) et on ferme #52     readchlorophyll en OpenMP?
#54     Erreur sur la vorticité en mode zoomé
#55     Constantes non uniformes dans le modèle
#56     Vérifier le calcul des nombres de jours de pluie
#61     Calendrier     Consolidation
#66     Sensibilité au pas de temps de la fermeture stochastique
#67     Traceurs et isotopes.
#70     Conservation de l'énergie avec l'eau
#71     Filtrage de la vorticité
#75     ppm3d non fonctionnel
#76     Sortie epmax
#82     Nouveau calcul de wind10m
#84     Use getin_p instead of getin
--> faire evoluer sur la nécessité de définir les focages en
    surface en absence de chauffage radiatif de l'atmosphère
#85     Rayonnement dans le 1D
#86     Get rid of stop commands
#87     cycle_diurne et iflag_cycle_diurne => Fait. A fermer.
#88     routines cldrag
#89     Problèmes grille zoomée



Tour de table :
===============
Lidia
-------
Atoodee

Ehouarn :
---------
La 3392 marche.
S. Cabanes a fait plein de choses sur les spectres d'énergie pour Saturne, EM voudrait les récupérer au moins pour les aqua-planètes

Jean-Yves
---------------
s'est remis au splitting, on va y arriver
Ecriture de doc pour LMDZPedia

Aderrahmane :
-------------
Interactions avec J. Jouhaud pour sa thèse: a fait des modifs à COSP et AI fait des simuls pour lui. Récupérer ces modifs et les tester
La version 2 COSP a un problème avec OpenMP

Marie-Pierre :
--------------
Test 1D bien passé pour les svn 3388 et 3392.

Frédérique
----------
Y. Feng a trouvé des températures journalières monstrueuses (80 degrés de plus) dans des simulations de Frédérique. Ne fait pas planter le modèle car c'est juste un diagnostique. Pourrait etre présent dans les simus CMIP6. Serait dû au calcul du cdrag pour  t2m. Possible interaction avec l'interpolation du vent à 10m?

10/9/2018

Compte rendu du poihl du 10/9/2018

Durée:  45 min

Prochaine formation LMDZ :
==========================
17-18-19 décembre
Au second.

Consolidation LMDZ6 :
=====================
Problème de reproductibilité (Abderrahmane). A analyser
Plantages bizares à la ligne de changement de date dans les aquaplanetes de Max.

Marie-Alice fait remarque que :
Quand on a lancé les simulations paléo, les résultats sont différents
si on démarre en 1850 ou en 2200.

Suivi/lancement des simultions CMIP6 :
======================================

Simulation CMIP6 d'Abderrahmane terminées.

Simulation SST-clim lancées avec les mêmes niveaux de sortie que GMIP.
    Forcages actuels. A tourné de 1870 à 1990

On compte les jours avant la fermeture de curie.

pdctrl.
   Rejouer 200 ans en s'assurant qu'on est bien compatible avec le pictrl.


Préparation des simulations MR pour le Deck CMIP6 :
---------------------------------------------------
Une discussion a eu lieu sur le MR
Le couplé MR (256x256-L79) a tourné avec des forcages partiels (Marie-Alice)
A faire :
des simulations avec forcage propre
Passage à Nemo 0.25 degré
Sans doute un projet Prace sur le sujet.

Grand challenge + dynamico :
----------------------------
Le projet ESIWACE2 est passé. Affiché à 10km global.
Pour le moment, pas de gain de preformance sur irene.

Sébastien Fromang,

fait des spectres d'énergie avec un pic bizare.
A la fois dans LMDZ et dynamico mais pas pareil.
Mais en fait les deux modèles n'ont pas la même discrétisation verticale.
Manque un changement de signe sur le flux vertical entre la physique et la dynamique.



Contrôle Qualité / trunk / scripts
==================================

(inchangé)

install_lmdz.sh marche en local et sur ciclad avec ifort (ancien ~ 2013).
   Il faudrait tourner avec 2018 pour pouvoir initialiser à NaN
   Mais toute la chaine pour lancer est différente.
   En plan pour le moment parce qu'il faudra faire en même temps la bascule
      du lancement parallèle par libigcm de poe vers mpirun.

Problème de phasage svn/install_lmdz.sh résolu.

Passer au nouvel orchidee par défaut.
   Fait en option.

La compilation avec XIOS n'est pas à jour pour Orchidee.


Articulation convection profonde / convection peu profonde
==========================================================
(inchangé)
* Jean-Yves : toutes les équations sont simples et claires
              en cours de publi.
* Modèle pronostic de densité de poches : en test
* Splitting des poches : en test
* Entrainement convectif / nouvel épluchage (à tester)
* Tube dentifrice (à tester)

Evolution physique/versions futures :
=====================================
Frédéric a fait des tests sur les stratocumulus, sur la convection
profonde (densité de poches interactive et épluchage modifié de Catherine)

(inchangés ci-dessous)
* Jean-Yves, Jean-Philippe et Catherine pensent qu'il faut éliminer une
   partie des précipitations dans les ascendances adiabatiques.
* Eau avec source méthane
* sursaturation
* grille plus groissère en bas pour la convection

Tuning automatique :
====================
Coding sprint jeudi et vendredi 6 et 7 septembre
   Encore un grand succès.
   Première émulation (par Ionela) de métriques de tuning sur les 250 simulations 3D réalisées
     (par Frédéric).
   Marie-Pierre a mis au point un script pour interpoler les SCM sur la grille des LES.

Ecrire un mail pour expliquer pourquoi on n'a pas consommé les 2Mh chez
   Laurent Li.


Convergence 1D std / Dephy :
============================
Romain a repassé l'ensemble des cas au format standard à Marie-Pierre qui
   va essayer de les intégrer.

Publications :
==============
En cours


Labélisation :
==============
Il devient urgent de redéfinir l'organisation.
Organiser une réunion fin septembre.


tickets trac :
==============
(inchangé)
#9      Modifications pour une dynamique commune (terre \u2013 planete)
#11     Menage sur les prints
-> ??? #21     "day_ini" dans "create_etat0_limit" et "gcm"
-> ??? #28     Initialisation problems in cloudth ?
-> Faire test snan et fermer. #30     Pb valeurs nulles/non définies sur configs linux
#32     Concervation de la masse des traceurs dans la dynamique
#34     Calving faux en zoome
Lionel confirme qu'on laisse ouvert le #44     getin_dump et name
-> mail Olivier (B) et on ferme #52     readchlorophyll en OpenMP?
#54     Erreur sur la vorticité en mode zoomé
#55     Constantes non uniformes dans le modèle
#56     Vérifier le calcul des nombres de jours de pluie
#61     Calendrier     Consolidation
#66     Sensibilité au pas de temps de la fermeture stochastique
#67     Traceurs et isotopes.
#70     Conservation de l'énergie avec l'eau
#71     Filtrage de la vorticité
#75     ppm3d non fonctionnel
#76     Sortie epmax
#82     Nouveau calcul de wind10m
#84     Use getin_p instead of getin
--> faire evoluer sur la nécessité de définir les focages en
    surface en absence de chauffage radiatif de l'atmosphère
#85     Rayonnement dans le 1D
#86     Get rid of stop commands
#87     cycle_diurne et iflag_cycle_diurne => Fait. A fermer.
#88     routines cldrag
#89     Problèmes grille zoomée



Tour de table :
===============

Ehoaurn :
---------
La 3387 plante.
Sans doute une commission d'Olivier

Aderrahmane :
-------------
Passe

Marie-Alice :
-------------
Il faut fournir des cas tests à irene.
Laurent s'en occupe.
Conseil d'écouter Gilles Ramstein dans "La méthode scientifique" sur France Culture.

Marie-Pierre :
--------------
Atoodee

Frédéric :
----------
Atoodee

3/9/2018

Compte rendu du poihl du 3/9/2018

Durée: 1h25

Consolidation LMDZ6 :
=====================
Plantages Amip+4K (Ionela). En cours d'analyse.
    Plantait en 97 : hgardfou et plantages XIOS
    A tourné en changeant oliqmax
    A réussi à tourner aussi avec une dissipation modifiée sans le workflow

Nouveau plantage dans le abrupt 4xCO2. Passe avec addnoise.
    en gros une fois tous les 300 ans.

Problème de reproductibilité (Abderrahmane). A analyser

Problème pour les lancer les aquaplanètes sur ada chez Max (mais ca tourne sans probleme chez Frédéric)

Petit bug sur la prise en compte des bosquets qui sont activés sur  les 13 PFT seulement.
    Pas grave parce que les PFTs 14 et 15 sont les mêmes.

Suivi/lancement des simultions CMIP6 :
======================================
Ionela fini toutes les amip (ctrl, ±4K, Future4K, 4xCO2)
    et les aquaplanètes (ctr, +4K, 4xCO2)
    N'arrive pas à avoir le contrôle qualité sur de la simulation amip
      avec le maximum de sorties.

Configurations / réalisation de simulations :
---------------------------------------------
Faire un run long sur SSTs climatiques.
   Abderrahmane. Frédéric envoie un mail à Sébastien.

Préparation des simulations MR pour le Deck CMIP6 :
---------------------------------------------------

Grand challenge + dynamico :
----------------------------
Le projet EASIWACE2 est placé. Affiché à 10k global.
Pour le moment, pas de gain de preformance sur irene.


Contrôle Qualité / trunk / scripts
==================================

(inchangé)

install_lmdz.sh marche en local et sur ciclad avec ifort (ancien ~ 2013).
   Il faudrait tourner avec 2018 pour pouvoir initialiser à NaN
   Mais toute la chaine pour lancer est différente.
   En plan pour le moment parce qu'il faudra faire en même temps la bascule
      du lancement parallèle par libigcm de poe vers mpirun.

install.sh et svn :
   le svn checkout de LMDZ pour les modipsl.tar est maintenant fait sur erskine.
   Donc avec une ancienne versrion de svn pour permettre de travailler
   avec des clients anciens.
   Mais pas sur que sur que ca resolve tout (cf mails du 03/09).

Passer au nouvel orchidee par défaut.
   Fait en option.

La compilation avec XIOS n'est pas à jour pour Orchidee.


Articulation convection profonde / convection peu profonde
==========================================================
(inchangé)
* Jean-Yves : toutes les équations sont simples et claires
              en cours de publi.
* Modèle pronostic de densité de poches : en test
* Splitting des poches : en test
* Entrainement convectif / nouvel épluchage (à tester)
* Tube dentifrice (à tester)

Evolution physique/versions futures :
=====================================
Frédéric a fait des tests sur les stratocumulus, sur la convection
profonde (densité de poches interactive et épluchage modifié de Catherine)

(inchangés ci-dessous)
* Jean-Yves, Jean-Philippe et Catherine pensent qu'il faut éliminer une
   partie des précipitations dans les ascendances adiabatiques.
* Eau avec source méthane
* sursaturation
* grille plus groissère en bas pour la convection

Tuning automatique :
====================
(Coding sprint jeudi et vendredi 6 et 7 septembre)
Frédéric a lancé :
   Deux séries de 250 simulations de 2 ans en 96x95x79 et 144x142x79
   Deux simulations plantent en 96x95x79
   Une petite dizaine en 144x142x79
   A automatiser les scripts permettant de lancer les séries de simulations
   à partir du tutorial_ada.tar et des fichiers générés sous R par high-tune.

Ecrire un mail pour expliquer pourquoi on n'a pas consommé les 2Mh chez
   Laurent Li.

Convergence 1D std / Dephy :
============================


Publications :
==============
Frédéric a fait circuler une proposition de liste de publications autour
du couplé IPSL-CM.


Labélisation :
==============
Il devient urgent de redéfinir l'organisation.
Organiser une réunion fin septembre.


tickets trac :
==============
(inchangé)
#9      Modifications pour une dynamique commune (terre \u2013 planete)
#11     Menage sur les prints
-> ??? #21     "day_ini" dans "create_etat0_limit" et "gcm"
-> ??? #28     Initialisation problems in cloudth ?
-> Faire test snan et fermer. #30     Pb valeurs nulles/non définies sur configs linux
#32     Concervation de la masse des traceurs dans la dynamique
#34     Calving faux en zoome
Lionel confirme qu'on laisse ouvert le #44     getin_dump et name
-> mail Olivier (B) et on ferme #52     readchlorophyll en OpenMP?
#54     Erreur sur la vorticité en mode zoomé
#55     Constantes non uniformes dans le modèle
#56     Vérifier le calcul des nombres de jours de pluie
#61     Calendrier     Consolidation
#66     Sensibilité au pas de temps de la fermeture stochastique
#67     Traceurs et isotopes.
#70     Conservation de l'énergie avec l'eau
#71     Filtrage de la vorticité
#75     ppm3d non fonctionnel
#76     Sortie epmax
#82     Nouveau calcul de wind10m
#84     Use getin_p instead of getin
--> faire evoluer sur la nécessité de définir les focages en
    surface en absence de chauffage radiatif de l'atmosphère
#85     Rayonnement dans le 1D
#86     Get rid of stop commands
#87     cycle_diurne et iflag_cycle_diurne => Fait. A fermer.
#88     routines cldrag
#89     Problèmes grille zoomée



Tour de table :
===============

Marie-Pierre :
--------------
drdv (de retour de vacances)

Ionela :
--------
A réussi à faire les sorties niveaux de pression via XIOS sur ada
   avec une version récente de XIOS hors du workflow CMIP6.
Probleme pour conserver les configurations libigcm des runs de production
   CMIP6 sur la forge avant bascule irene. A voir avec Marie-Alice.

Marie-Alice :
-------------
A fait tourner le MR, 2 versions de 50 ans.
   Il manque des forcages.
Mauvaise surprise : pas réussi à faire tourner Nemo sur 220 coeurs mais sur 360 OK.
Reunion avec Nemo 04/09 à 13:45
Plantage abrupt 4xCO2 (cf. plus haut).
Demande un plan de route pour l'année qui vient.

Ehouarn :
---------
3381 marche.

Jean-Baptiste :
---------------
Travaille sur un fisrt2 qui fait la même chose que fisrt.
   (Passe l'aspirateur)

Frédérique :
------------
S'est rendu d'un petit bug sur la prise en compte des PFT pour les bosquets (cf. plus haut)
Travaille sur install_lmdz.sh / XIOS / orchidee

Frederic
------------
cf Itune et install_lmdz.sh plus haut.

30/7/2018

Pas de poihl

23/7/2018

Compte rendu du poihl du 23/7/2018

Tour de table:

Laurent: J'étais là avec Marie-Pierre mais on a décidé de faire le tour de table par e-contribution

 - a fini de boucher les trous dans les simups CMIP6 abrupt-0p5xCO2 et abrupt-2xCO2. Le problème sur cette dernière était vicieux et la résolution laborieuse. Les deux simulations sont publiées sur ESGF, merci Guillaume
 - a relancé les 2 simulations abrupt-sol[mp]4p pour CMIP, qui étaient en mode "contrôle qualité" avant publication, après s'être rendu compte que la constante solaire, bien que changée dans le config.def, était restée à sa valeur par défaut: le problème étant que RRTM lit la constante solaire dans un fichier, que ce fichier n'avait pas été modifié et que rien ne nous en avertit. Regarde avec Olivier comment avertir (a priori, si ok_suntime_rrtm = TRUE et que la valeur de solaire est différente de la valeur par défaut, alors on arrête le code). La simulation abrupt-solp4p a encore 50 ans à faire. La simulation abrupt-solm4p s'est plantée après avoir pris une mauvaise trajectoire apparemment. Elle a été re-relancée
 - installe DYNAMICO-CONV sur irene
 - teste la reproductibilité de LMDZ sur irene

Fred: (e-contribution)

A mis sur ~lmdz/pub la version de install_lmdz.sh modifiée par Abderrahmane pour permettre d'uilitser Cosp.
Mise à jour de ~lmdz/Training/tutorial_ada.tar pour permettre de tourner avec Cosp et Xios. Test effectué. Il suffit de mettre les options dans
TESTADA/main.sh
Travail sur les articles.

Lidia: (e-contribution)

- CMIP6-simulations Amip historiques GMMIP (1870-2014)

* définition des éléments de la configuration des simulations avec
Laurent Li.

* mise en place de la configuration des simulations de l'ensemble
de 3 simulations du Tier1, avec Laurent F.

* installation du modèle IPSLCM6.1.5-LR, et de la configuration Amip
à partir de la configuration Amip_CMIP6 de Josefine.

* introduction des modifications nécessaires pour suivre les forçages
historiques.

* définition de restart = couplé historique, au 31.12.1869, pour
commencer la 1ère simulation d'ensemble au 1er.01.1870

* data request générée par Sébastien, à partir des éléments de
définition de la configuration des simulations, et du nom attribué
aux simulations et introduites dans le tableau des simulations :

https://docs.google.com/spreadsheets/d/1hF2edFrYwVw1ttPgpRg1NnlbwMpjRqU3o0DJt3SRMC4/edit?pli=1#gid=893380781

==> lancement de la 1ère simulation Amip historique 1870-2014,
de l'ensemble Amip amip-hist : exécution terminée

==> lancement de la 2ème simulation Amip historique 1870-2014,
de l'ensemble Amip amip-hist : exécution en cours


- Ensemble Amip 1958-2014 spécifié par Frédéric Hourdin

* définition des éléments de la configuration des simulations
à partir de la configuration des simulations Amip d'ensemble CMIP5,
et de la simulation avec guidage CM5B en configuration CMIP5

* les 10 simulations des 2 ensembles Amip sont définies :
- pour la période 1958-2014, pour être homogène avec la 1ère année
de la simulation avec guidage, 1958, pour les réanalyses ERA40
(le protocole CMIP6 Amip est 1979-2014, et CMIP5 1979-2009)

* avec un restart :
- simulation Amip 1958-2014 en configuration standard avec le modèle
LMDZ CM6.1.5
- années de restart= 1960, 1967, 1973, 1983, 1990, 1995, 2000, 2003,
2010, 2014

==> préparation de la simulation de restart :
simulation de restart exécutée, avec la sous-imputation
de projet devcmip6 : exécution terminée

==> lancement de 3 simulations de l'ensemble sous la sous-imputation
de projet dekcmip6,, avec la simulation de restart :

- simulation  : CM61-LR-amip-1960    avec stations, avec Cosp
- simulation  : CM61-LR-amip-1967    sans stations, avec Cosp
- simulation  : CM61-LR-amip-1983    sans stations, sans Cosp

==> erreur à l'exécution de la 1ère simulation de l'ensemble :
CM61-LR-amip-1960, dépassement de temps de calcul, le temps d'exécution
d'une année pour cette simulation est de 5 heures environ.
il n'a pas été possible de la faire redémarrer avec la procédure
courante, donc relance de la simulation : en cours d'exécution,
18 années exécutées

==> les 2ème et 3ème simulations sont en cours d'exécution :
simulation CM61-LR-amip-1967 : 47 années exécutées
simulation CM61-LR-amip-1983 : 57 années exécutées

debuggage et mise à jour du tableau des simulations avec Laurent F.

==> le ralentissement d'exécution de la 1ère simulation de cet ensemble,
est dû aux sorties stations.

Marie-Pierre:

+ Suite à une demande de Fleur, ajouté aux fichiers de sortie 1D les profils initiaux de P, T, q,U,V

+ Install des svn 3369 et 3375

+ Tests en cours pour faire tourner COSP en 1D. Fred a modifié install_lmdz.sh et Abderrahmane a fourni quelques fichiers à ajouter

 

16/7/2018

Compte rendu du poihl du 16/7/2018

Durée: 1h00

Consolidation LMDZ6 :
=====================
Plantages Amip+4K (Ionela). En cours d'analyse.
Problème de reproductibilité (Abderrahmane). A analyser
.
Suivi/lancement des simultions CMIP6 :
======================================

Ionela a lancé tous les amip (ctrl, ±4K, Future4K, 4xCO2)
    et les aquaplanètes (ctr, +4K, 4xCO2)
    Tout a tourné sauf la ctrl, très lente à cause des sorties
     et plantage +4K (cf. ci-dessus).
    question concernant les niveaux de sorties des histmth.
    Est ce qu'on n'avait pas prévu plusieurs niveaux de sorties.
    Eventuellement doubler cette simulation (?)

Abderrahmane a lancé deux simulations avec CRE LW inhibé
      amip et amip+4K. Reste à faire les aquaplanètes.

Sur la pre cmip6
   Suite aux problèmes rencontrés par Ionela, on est passé à
   7 niveaux pression pour toutes les variables concernées.


Configurations / réalisation de simulations :
---------------------------------------------
Faire un run long sur SSTs climatiques.
   Abderrahmane. Frédéric envoie un mail à Sébastien.

Préparation des simulations MR pour le Deck CMIP6 :
---------------------------------------------------

Grand challenge + dynamico :
----------------------------

Contrôle Qualité / trunk / scripts
==================================

(inchangé)

Ehouarn a fait en sorte que install_lmdz.sh marche sur climserv comme ciclad
   Ce qu'il faut pour compiler orchidee avec XIOS.

Ehouarn a testé que les options d'initialisations à NaN de ifort marchent
   vraiment bien.
   A mettre en place en même temps que la bascule ifort 2013/2017 sur ada.
   Dossier pour Laurent.
   Commencer par basculer le 2017 sur ada
   Puis faire le changement sur les arch.

Problème de reproductibilité identifié sur la trunk avec install en cours de test (F&F)
   Problème de reproductibilité du forcé dans les configurations install_lmdz.
   Reproductible au premier mois mais pas au second. Même sans orchidee ni lecture d'aérosols (FrédériKs travaillent dessus).

Problèmes identifiés dans tutorial_ada.tar
    Ne marche pas en compilo 2017 -> Retour en arrière à 2013.
    Sans doute le fait qu'il faut passer à mpi_run au lieu de poe
    (à conserver)

install.sh et svn :
    depuis qu'on est sur carey, la version de svn utilisée pour faire le checkout pour
    les sources est très récente. Davantage que celle des SentOS du réseau.
    On ne peut plus utiliser svn sur les versions téléchargées.
    Deux solutions : downgrader carey pour svn faire un svn via ssh sur une machine avec une svn plus ancienne
    A faire

Passer au nouvel orchidee par défaut.
    A faire


Articulation convection profonde / convection peu profonde
==========================================================
(inchangé)
* Jean-Yves : toutes les équations sont simples et claires
              en cours de publi.
* Modèle pronostic de densité de poches : en test
* Splitting des poches : en test
* Entrainement convectif / nouvel épluchage (à tester)
* Tube dentifrice (à tester)

Evolution physique/versions futures :
=====================================
Frédéric a fait des tests sur les stratocumulus, sur la convection
profonde (densité de poches interactive et épluchage modifié de Catherine)

(inchangés ci-dessous)
* Jean-Yves, Jean-Philippe et Catherine pensent qu'il faut éliminer une
   partie des précipitations dans les ascendances adiabatiques.
* Eau avec source méthane
* sursaturation
* grille plus groissère en bas pour la convection

Tuning automatique :
====================
Frédéric a beaucoup travaillé sur les scripts automatiques.
Va relancer une série de 250 simulations pour explorer la variabilité
   de la convection combinée au réglage radiatif.
En fait les grands ensembles (# paramtres = 19 et 250 simulations)
   font planter les scripts R.
   En revanche ca marche avec 16 parametre et 160 simulations
   Frédéric va lancer 3 séries de simulations avec les différentes
     versions de la convection (standard, densité interactive et
     épluchage modifié).

Convergence 1D std / Dephy :
============================

Publications :
==============
Frédéric a fait circuler une proposition de liste de publications autour
du couplé IPSL-CM.


Labélisation :
==============
Il devient urgent de redéfinir l'organisation.


tickets trac :
==============
(inchangé)
#9      Modifications pour une dynamique commune (terre \u2013 planete)
#11     Menage sur les prints
-> ??? #21     "day_ini" dans "create_etat0_limit" et "gcm"
-> ??? #28     Initialisation problems in cloudth ?
-> Faire test snan et fermer. #30     Pb valeurs nulles/non définies sur configs linux
#32     Concervation de la masse des traceurs dans la dynamique
#34     Calving faux en zoome
Lionel confirme qu'on laisse ouvert le #44     getin_dump et name
-> mail Olivier (B) et on ferme #52     readchlorophyll en OpenMP?
#54     Erreur sur la vorticité en mode zoomé
#55     Constantes non uniformes dans le modèle
#56     Vérifier le calcul des nombres de jours de pluie
#61     Calendrier     Consolidation
#66     Sensibilité au pas de temps de la fermeture stochastique
#67     Traceurs et isotopes.
#70     Conservation de l'énergie avec l'eau
#71     Filtrage de la vorticité
#75     ppm3d non fonctionnel
#76     Sortie epmax
#82     Nouveau calcul de wind10m
#84     Use getin_p instead of getin
--> faire evoluer sur la nécessité de définir les focages en
    surface en absence de chauffage radiatif de l'atmosphère
#85     Rayonnement dans le 1D
#86     Get rid of stop commands
#87     cycle_diurne et iflag_cycle_diurne => Fait. A fermer.
#88     routines cldrag
#89     Problèmes grille zoomée



Tour de table :
===============

Abderrahmane
------------
Cosp-v2 :
A commis une version sur la trunk. phylmd/cosp2 à compiller
  avec l'option -cosp2
  Testé en parallèle sur curie avec XIOS
  en cours de test avec install_lmdz.sh IOIPSL.

Ionela :
--------
déjà dit

Adriana :
---------
de retour


Lidia
-----

- CMIP6-simulations Amip historiques GMMIP (1870-2014)

* définition des éléments de la configuration des simulations avec
Laurent Li.

* mise en place de la configuration des simulations de l'ensemble
de 3 simulations du Tier1, avec Laurent F.

* installation du modèle IPSLCM6.1.5-LR, et de la configuration Amip
à partir de la configuration Amip_CMIP6 de Josefine.

* introduction des modifications nécessaires pour suivre les forçages
historiques.

* définition de restart = couplé historique, au 31.12.1869, pour
commencer la 1ère simulation d'ensemble au 1er.01.1870

* data request générée par Sébastien, à partir des éléments de
définition de la configuration des simulations, et du nom attribué
aux simulations et introduites dans le tableau des simulations :

https://docs.google.com/spreadsheets/d/1hF2edFrYwVw1ttPgpRg1NnlbwMpjRqU3o0DJt3SRMC4/edit?pli=1#gid=893380781

==> lancement de la 1ère simulation Amip historique 1870-2014,
de l'ensemble Amip amip-hist

==> exécution en cours : 50 années


- Ensemble Amip- spécifié par Frédéric Hourdin

* définition des éléments de la configuration des simulations
à partir de la configuration des simulations Amip d'ensemble CMIP5,
et de la simulation avec guidage CM5B en configuration CMIP5

==> les 10 simulations des 2 ensembles Amip sont définies :
- pour la période 1958-2014, pour être homogène avec la 1ère année
de la simulation avec guidage, 1958, pour les réanalyses ERA40
(le protocole CMIP6 Amip est 1979-2014, et CMIP5 1979-2009)
- sorties Cosp : pas de sorties Cosp pour les 10 simulations d'ensemble
- sorties stations : pour la 1ère simulation d'ensemble

==> avec un restart :
- simulation Amip 1958-2014 en configuration standard avec le modèle
LMDZ CM6.1.5
- années de restart= 1960, 1967, 1973, 1983, 1990, 1995, 2000, 2003,
2010, 2014

==> préparation de la simulation de restart
==> simulation de restart en cours d'exécution, avec la sous-imputation
de projet devcmip6

Frédéric :
----------
déjà dit.

 

9/7/2018

Compte rendu du poihl du 9/7/2018

Durée: 1h25

Consolidation LMDZ6 :
=====================
Mauvaises nouvelles sur les performances sur irene. Moindres que sur curie.
Perte de 20% en performances.
    Probleme d'allocation de mémoire detecté sur irene.
    Vérifier que les tests ne sont pas en debug.

Corrections Cosp commises dans la version 6.1.5.

Le bug trouvé (et corrigé) par Jean-Yves lié à un problème d'indice vertical.
   Abderrahmane a fait tourner la trunk avec et sans.
   Pas de différences évidentes jusque là.

Suivi/lancement des simultions CMIP6 :
======================================

Ionela a lancé amip et amip 4xCO2.
   Mais sur les histmth, niveaux low.
   Va relancer au moins amip avec high

Sur la pre cmip6
   Contrôle qualité (soucis d'axes, compatibilité DR)
   Trois variables sur niveaux de pression donnaient 2 fichiers.
       Une partie sur 7 et une autre sur 27 niveaux.
   Plus du tout de température sur des niveaux de presion.
   7 niveaux pour le géopotentiel et l'humidité.


Configurations / réalisation de simulations :
---------------------------------------------

Pour les aquaplanètes :
   Réglage des nuages et forcages en cours de finalisation

Abderrahmane prépare les amip avec forcages désactivés.
   Test en cours.

Faire un run long sur SSTs climatiques.
   Abderrahmane. Frédéric envoie un mail à Sébastien.

Préparation des simulations MR pour le Deck CMIP6 :
---------------------------------------------------

Grand challenge + dynamico :
----------------------------
Dernière semaine.
- Problèmes avec Cosp, résolu depuis.
- Refaire tourner après
- 30 ans réalisés en HR.
- Un run avec moins de coeur pourra continuer après le grand challenge
   (sans doute une 15aine d'années)
- Simulations guidées 1995-2000 disponibles (avec Orchidee mais sans stomate).

dynamico :
- convergence de la physique de la trunk avec le trunk de dynamico.
  Tourne en nouvelle physique.
  Donne des résultats proches, y compris pour la pression de surface qui
  était très bizare il y a un an.
- tourne avec la branche issue de la trunk.
  Mais une version la branche dans laquelle Laurent a réintroduit la dernière
  version de la trunk tourne avec latlon mais pas dynamico.
- sur la version d'avant le merge tourne avec openMP, aérosols et l'ozone.
  Très proche de pouvoir tourner avec orchidee.
- premier multi atlas dynamico/latlon disponible aujourd'hui.


Contrôle Qualité / trunk / scripts
==================================

Ehouarn a fait en sorte que install_lmdz.sh marche sur climserv comme ciclad
   Ce qu'il faut pour compiler orchidee avec XIOS.

Ehouarn a testé que les options d'initialisations à NaN de ifort marchent
   vraiment bien.
   A mettre en place en même temps que la bascule ifort 2013/2017 sur ada.
   Dossier pour Laurent.
   Commencer par basculer le 2017 sur ada
   Puis faire le changement sur les arch.

(inchangé)

Problème de reproductibilité identifié sur la trunk avec install en cours de test (F&F)
   Problème de reproductibilité du forcé dans les configurations install_lmdz.
   Reproductible au premier mois mais pas au second. Même sans orchidee ni lecture d'aérosols (FrédériKs travaillent dessus).

Problèmes identifiés dans tutorial_ada.tar
    Ne marche pas en compilo 2017 -> Retour en arrière à 2013.
    Sans doute le fait qu'il faut passer à mpi_run au lieu de poe (à conserver)

install.sh et svn :
    depuis qu'on est sur carey, la version de svn utilisée pour faire le checkout pour les sources est très récente. Davantage que celle des SentOS du réseau.
    On ne peut plus utiliser svn sur les versions téléchargées.
    Deux solutions : downgrader carey pour svn faire un svn via ssh sur une machine avec une svn plus ancienne
    A faire

Passer au nouvel orchidee par défaut.
    A faire


Articulation convection profonde / convection peu profonde
==========================================================
(inchangé)
* Jean-Yves : toutes les équations sont simples et claires
              en cours de publi.
* Modèle pronostic de densité de poches : en test
* Splitting des poches : en test
* Entrainement convectif / nouvel épluchage (à tester)
* Tube dentifrice (à tester)

Evolution physique/versions futures :
=====================================
(inchangés ci-dessous)
* Jean-Yves, Jean-Philippe et Catherine pensent qu'il faut éliminer une
   partie des précipitations dans les ascendances adiabatiques.
* Eau avec source méthane
* sursaturation
* grille plus groissère en bas pour la convection

Tuning automatique :
====================
Frédéric a beaucoup travaillé sur les scripts automatiques.
Va relancer une série de 250 simulations pour explorer la variabilité de la convection combinée au réglage radiatif.

Convergence 1D std / Dephy :
============================
MP travaille dessus en préparation de la réunion HighTune du 14 juin
(inchangé ci-dessous)
Fleur veut qu'on ajoute les profils initiaux dans les sorties standard.
Discussion sur la standardisation des noms des cas :
   majuscules/minuscules
   avec des sous cas par défaut.
   Marie-Pierre étend la discussion.
A quand le 1D couplé, issu de COCOA ou non ? (Marie-Alice)

Publications :
==============
Papiers de référence :
Faire un papier en plusieurs partie
- évolution 5A/5B/6 en termes de physique, forcage radiatif
- évaluation des nuages (avec Jean-Louis)
- Documenté le 1D multi-cas
- tuning. Y compris pour le couplé et résultats en couplé.
- effet sur les continents : réglage de la climato et intensité du couplage
- quid des régions polaires ?
- quid de la convection et de la varaibilité (moussons/intermitence/MJO) ?
- moyennes latitudes (Guillaume Gastineau).

(inchangé ci-dessous)
- Stratocumulus (Arnaud Jam). Finalisation de la partie 3D
- Thermiques / stratocumulus / bords Est (Frédéric). En cours d'écriture
(ci dessous inchangé)
- Couplage / Flux de surface / rafales (Traore)
- Convection profonde / peu, thermiques en dehors des poches/ RCE de Caroline (Catherine)
- Tuning (Ionela/Frédéric)


Labélisation :
==============
Il devient urgent de redéfinir l'organisation.


tickets trac :
==============
(inchangé)
#9      Modifications pour une dynamique commune (terre \u2013 planete)
#11     Menage sur les prints
-> ??? #21     "day_ini" dans "create_etat0_limit" et "gcm"
-> ??? #28     Initialisation problems in cloudth ?
-> Faire test snan et fermer. #30     Pb valeurs nulles/non définies sur configs linux
#32     Concervation de la masse des traceurs dans la dynamique
#34     Calving faux en zoome
Lionel confirme qu'on laisse ouvert le #44     getin_dump et name
-> mail Olivier (B) et on ferme #52     readchlorophyll en OpenMP?
#54     Erreur sur la vorticité en mode zoomé
#55     Constantes non uniformes dans le modèle
#56     Vérifier le calcul des nombres de jours de pluie
#61     Calendrier     Consolidation
#66     Sensibilité au pas de temps de la fermeture stochastique
#67     Traceurs et isotopes.
#70     Conservation de l'énergie avec l'eau
#71     Filtrage de la vorticité
#75     ppm3d non fonctionnel
#76     Sortie epmax
#82     Nouveau calcul de wind10m
#84     Use getin_p instead of getin
--> faire evoluer sur la nécessité de définir les focages en
    surface en absence de chauffage radiatif de l'atmosphère
#85     Rayonnement dans le 1D
#86     Get rid of stop commands
#87     cycle_diurne et iflag_cycle_diurne => Fait. A fermer.
#88     routines cldrag
#89     Problèmes grille zoomée



Tour de table :
===============

Jean-Baptiste :
---------------
écrit un fisrtilp2, plus clair !
  A trouvé des choses bizares sur les variables internes des thermiques.

Ehouarn :
---------
Les tests ne marchaient depuis la 3361.
Réparé depuis la 3368.
Est prêt à contribuer aux sorties dans la dynamique avec Laurent.

Frédérique :
------------
Voulait mettre à jour les simulations temps réel sur climserv.
   Coincée par un problème d'orchidee.
   Fonctionne en bench avec une petite résolution.
   Tout marche avec XIOS (quand ca marche).

Abderrahmane :
--------------
Lancement des simulations test pour Jean-Yves.
Préparation simulations CFMIP
Nouvelle version Cosp implémentée dans la trunk de LMDZ
   Va faire un travail de validation.
Question de Frédérique sur la disponibilité du simuateur sol dans Cosp
   Frédérique s'occupe de voir ca.

Ionela :
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A travaillé sur les distribution de nuages vues par Cosp.
   Résultats bizares concernant les nuages hauts.
   Peut-être des problèmes de fréquences de calcul ou de recouverement/contiguité.

Jean-Yves :
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RAS

Abdoul Khadre :
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Rien de plus

Marie-Pierre :
--------------
Travaille sur le forçage de fire.
Est tombée aussi sur les problèmes de plantage.

Frédéric :
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Finalisation des articles :
  1/ stratocumulus (découverte que dz=cste~80m pourrait être mieux que dz=0.07*z
      ou detrainement=f(B'), B'=(theta_up(z) - theta(z+dz)) / theta(z+dz)
  2/ bords Est. confirme le lien entre flux en surface dans les biais de SSTs
      dans des simulations initialisées couplées.
Travaille sur le tuning.
   Problèmes identifié sur les Mac à Exeter : plantages aléatoires du 1D.
   Romain Roehrig rencontre le même problème avec ARPEGE. Peut être problème de stack.
   Les scripts tunings sont stabilisés.... mais plantage de la construction de
   l'émulateur avec l'ensemble 19 param / 250 simulations.

2/7/2018

Compte rendu du poihl du 2/7/2018

Durée: 1h25

Consolidation LMDZ6 :
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Mauvaises nouvelles sur les performances sur irene. Moindres que sur curie.
Perte de 20% en performances.

Ionela semble confirmer que les problèmes de Cosp sont résolus, car 27 ans de amip sans problèmes.
   Avec des sorties cosp très élevées (6h/an au lieu de 2h/an)

Modifications comises dans la version 6.1.5.

Le bug trouvé (et corrigé) par Jean-Yves lié à problème d'indice vertical.
   A tester.
   1ere étape : simulations de 10 ans climatique avec et sans.


Suivi/lancement des simultions CMIP6 :
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 Laurent bouche des trous, suite aux problèmes Cosp et fait tourner des couplés. Ionela va relancer le amip. Frédérique et Lidia vont s'occuper des ensembles CMIP6.


Configurations / réalisation de simulations :
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Pour les aquaplanètes :
   Ionela a regardé les tailles de gouttes d'eau.
   A trouvé 11 micron.
   Va faire la même chose pour les cristaux de glace.
   Doit vérfier aussi des choses sur les forçages.
   A préparé l'ozone symétrique à partir de l'ozone amip.
   Espère lancer les aquaplanètes cette semaine.

Amip4K et 4CO2
   doit vérifier ce qui se passe sur les côtes.

Faire un run long sur SSTs climatiques.

Premier modèle publié sur ESGF.
   Sauf quelques variables mauvaises.
   Corrections en cours.

Préparation des simulations MR pour le Deck CMIP6 :
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Grand challenge + dynamico :
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Extension du grand Challenge de deux semaines.

Laurent a intégré les modifs de Yann sur les initialisations dans la branche.
   Puis a fait un fait merge de la branch avec notre trunk, sur la branche.
   Compile et tourne.
   Version disponible. En cours de test. Avec une version de la physique d'il y a deux semaines.


Contrôle Qualité / trunk / scripts
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Avec Frédérique qui voulait tout réinstaller sur climserv/ciclad, Ehouarn s'est rendu compte qu'on n'avait pas le bon XIOS.
    Mais avec le dernier XIOS est incompatible avec les compilo par défaut.
    En redescendant à XIOS 1540, ca passe encore.
    A changé la version des XIOS sur install_lmdz.sh

(inchangé)

Problème de reproductibilité identifié sur la trunk avec install en cours de test (F&F)
   Problème de reproductibilité du forcé dans les configurations install_lmdz.
   Reproductible au premier mois mais pas au second. Même sans orchidee ni lecture d'aérosols (FrédériKs travaillent dessus).

Problèmes identifiés dans tutorial_ada.tar
    Ne marche pas en compilo 2017 -> Retour en arrière à 2013.
    Sans doute le fait qu'il faut passer à mpi_run au lieu de poe
    (à conserver)

install.sh et svn :
    depuis qu'on est sur carey, la version de svn utilisée pour faire le checkout pour les sources est très récente. Davantage que celle des SentOS du réseau.
    On ne peut plus utiliser svn sur les versions téléchargées.
    Deux solutions : downgrader carey pour svn faire un svn via ssh sur une machine avec une svn plus ancienne
    A faire

Passer au nouvel orchidee par défaut.
    A faire


Articulation convection profonde / convection peu profonde
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(inchangé)
* Jean-Yves : toutes les équations sont simples et claires
              en cours de publi.
(inchangé ci dessous)
* Modèle pronostic de densité de poches : en test
* Splitting des poches : en test
* Entrainement convectif / nouvel épluchage (à tester)
* Tube dentifrice (à tester)

Evolution physique/versions futures :
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(inchangés ci-dessous)
* Jean-Yves, Jean-Philippe et Catherine pensent qu'il faut éliminer une
   partie des précipitations dans les ascendances adiabatiques.
* Eau avec source méthane
* sursaturation
* grille plus groissère en bas pour la convection

Tuning automatique :
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Frédéric a beaucoup travaillé sur les scripts automatiques.
Va relancer une série de 250 simulations pour explorer la variabilité de la convection combinée au réglage radiatif.

Convergence 1D std / Dephy :
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MP travaille dessus en préparation de la réunion HighTune du 14 juin
(inchangé ci-dessous)
Fleur veut qu'on ajoute les profils initiaux dans les sorties standard.
Discussion sur la standardisation des noms des cas :
   majuscules/minuscules
   avec des sous cas par défaut.
   Marie-Pierre étend la discussion.
A quand le 1D couplé, issu de COCOA ou non ? (Marie-Alice)

Publications :
===========
(inchangé ci-dessous)
- Stratocumulus (Arnaud Jam). Finalisation de la partie 3D
- Thermiques / stratocumulus / bords Est (Frédéric). En cours d'écriture
(ci dessous inchangé)
- Couplage / Flux de surface / rafales (Traore)
- Convection profonde / peu, thermiques en dehors des poches/ RCE de Caroline (Catherine)
- Tuning (Ionela/Frédéric)


Labélisation :
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Présentation de LMDZ à la CSOA le 13 juin.
La présentation au CSOA.
Il devient urgent de redéfinir l'organisation.
Journées utilisateurs tous les deux ans.

tickets trac :
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(inchangé)
#9      Modifications pour une dynamique commune (terre \u2013 planete)
#11     Menage sur les prints
-> ??? #21     "day_ini" dans "create_etat0_limit" et "gcm"
-> ??? #28     Initialisation problems in cloudth ?
-> Faire test snan et fermer. #30     Pb valeurs nulles/non définies sur configs linux
#32     Concervation de la masse des traceurs dans la dynamique
#34     Calving faux en zoome
Lionel confirme qu'on laisse ouvert le #44     getin_dump et name
-> mail Olivier (B) et on ferme #52     readchlorophyll en OpenMP?
#54     Erreur sur la vorticité en mode zoomé
#55     Constantes non uniformes dans le modèle
#56     Vérifier le calcul des nombres de jours de pluie
#61     Calendrier     Consolidation
#66     Sensibilité au pas de temps de la fermeture stochastique
#67     Traceurs et isotopes.
#70     Conservation de l'énergie avec l'eau
#71     Filtrage de la vorticité
#75     ppm3d non fonctionnel
#76     Sortie epmax
#82     Nouveau calcul de wind10m
#84     Use getin_p instead of getin
--> faire evoluer sur la nécessité de définir les focages en
    surface en absence de chauffage radiatif de l'atmosphère
#85     Rayonnement dans le 1D
#86     Get rid of stop commands
#87     cycle_diurne et iflag_cycle_diurne => Fait. A fermer.
#88     routines cldrag
#89     Problèmes grille zoomée



Tour de table :
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Jean-Yves :
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a travaillé avec Geneviève sur le papier avec Nada.
Dynamique de poches sa tourne.
Spliting tourne avec beta=1 seulement.

Ionela :
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En+ : en préparant l'ozone pour l'aquaplnète, s'est rendue compte
que l'interpollation de l'ozone en log de pression fait des choses bizares.
A regarder.

Laurent :
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cf. plus haut.

Ehouarn :
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cf. plus haut.
Va regarder les nouvelles options d'initialisations à NaN

Marie-Pierre :
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installs ok. RAS.
Suite au mail de Fleur sur le cas FIRE, s'est appercu de plusieurs choses
non conformes au papier de Duynkerque.
Pas de facteur de Coriolis (=0). Change beaucoup les résultats.

Frédéric :
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Bosse sur itune et sur le papier d'Arnaud.