Compte-rendus PoiHL 2019

24/6/2019

Pas de poihl pour cause de Pedalons

27/5/2019

Compte rendu du poihl du 27/5/2019

0h55

Informations diverses :
=================

Discuter des tickets au prochain poihl

Codutil :
======
(inchangé)
Composition du Codutil : Sébastien Fromang, Adriana Sima, Marion Marchand, Myriam Khodri
Prochaine réunion Pedalons le 24 juin.
Elle portera principalement sur les traceurs et les isotopes.
Le thème de la réunion suivante sera la variabilité de la convection tropicale
Lundi matin, 7 ou 14 octobre.


Problème T2m :
============
(inchangé)
Guillaume a commencé à passer les filtres sur les champs CMIP6.
Faut-il simplement ne pas modifier les t2m mensuels ?
Malheureusement, les DCPP n'ont pas l'humidité minimale en sortie.

Contrôle Qualité / trunk / scripts
========================
ndayrain est faux pour un problème d'initialisation.
Ce n'est pas une sortie CMIP6. Ionela va commettre une correction

XIOS ne marche plus depuis la 3509 sur ada.
Malgré les corrections sur les définitions de variables,
Ehouarn a une erreur NetCDF/HDF.
Corriger (les _auto_ et _reset_) les scripts install_lmdz (Abderrahmane).

(inchangé)
* Mettre une page contrôle qualité dans la partie développeurs où
on explicite les 5 tests au moins.
* install_lmdz.sh ne marche pas sur irene
* l'état initial zoomé ne se crée pas sur irene avec libigcm.
Quand la prochaines version du couplé aura été finalisée
sur libigcm (IPSL-CM6.2), faire les modifications suivantes dans
install_lmdz.sh :
Passer au nouvel orchidee (svn 5004) par défaut. Fait en option.
La compilation avec XIOS n'est pas à jour pour Orchidee.

Vérifier si les problèmes de reproductibilité sur ada avec install_lmdz.sh sont résolus. (F&F) Qui semblaient être là même sans orchidee.
Ionela a un problème de divergence de résultats quand elle ajoute un diagnostic pour T2m.
Lionel a un problème en séquentiel sur ada. Tourne en debug mais pas en prod (testé sur irene : pas de problème. Laurent)

Evolution physique/versions futures :
============================
* Jean-Yves travaille sur la supression de l'eau liquide dans les ascendances adiabatiques d'Emanuel.
  Modifications commises
  Se plante en 1 jour en 3D.
* Jean-Yves est sur la conservation de l'énergie.
* Modèle pronostic de densité de poches :
   En 3D, une simu sur deux plante... à suivre...
(inchangé)
* Splitting des poches :
   Jean-Yves : toutes les équations sont simples et claires en cours de publi.en test
* Entrainement convectif / nouvel épluchage (à tester)
* Tube dentifrice (à tester)
* Eau avec source méthane
* sur-saturation

Tuning automatique :
================
C'est là qu'on voit les simu qui plantent... (200 simus de 2 ans, ça teste un modèle!)

Version 6B
========
(Inchangé)
* Reformulation des flux de masse dans le modèle du thermique (en cours d'ajustement)
* Abderrahmane a intégré les routines de Jean dans une version récente.
Ca tourne.
* Frédéric a défini une nouvelle version 95 niveaux.
Projet PRACE/QUEST déposé pour porter entre autre un modèle
MR025 : grille MR dans l'atmosphère et résolution 1/4° océan.
Début de l'allocation avril 2019.
Définir d'ici là, et tuner, une version nouvelle de la nouvelle physique.
* Correction T2m
* entrainement modifié des thermiques.!!
* densité de poches interactive : il faut rerégler la mousson.
* schéma vertical des nuages

Convergence 1D std / Dephy :
========================
Ehouarn a vu avec Marie-Pierre pour mettre le calendrier.
C'est bon; à commetre;  mais il faut revoir les dates/calendriers de forçages.
Il y a un problème de forçage sur FIRE (Frédéric)

Publications / documentation :
=======================

Des simulations 5A et 5B ont été lancées (Abderrahmane) pour alimenter les articles 5A vs 5B vs 6A (en 144x142).
Avec 6A, Orchidee 11 et 2 couches pour tests de sensibilité.
Frédéric documente dans son article ces simulations pour le côté "rétrocompatibilité"

Pour la 5B, simulations avec l'ancien découpage nsplit_phys=2 sur des pas de temps physique de 15min
(pour la NPv3.1. Pour la NPv3.2 tourner avec des pas de temps de 15min)
Pour la 6A: 15mn sans nsplit_phys et convection toutes les 30mn

(inchangé)
Frédérique a démarré sur le papier sur le couplage continental.
  * regarde ce qui vient du couplage comme différence entre CMIP5 et CMIP6.
  * L'intermitence des pluies joue beaucoup sur les moyennes latitudes.
  * Couplage plus fort dans LMDZ6
  * Biais froid l'hivers dans les hautes latitudes.
Nuages : Jean-Baptiste a commencé à regarder la partie phase mixte et le lien avec la dynamique.
Papier stratocumulus bouclé (Jam) : major revisions en cours.
La dernière version de la documentation ES-DOC :
https://docs.google.com/spreadsheets/d/1eSpROQVPsYLCh97RNZbeapbVSkaypeeVWYGjZpXDF5Y/edit#gid=766710776
Papier bords Est (Fredho), presque bouclé
Papier général LMDZ6A, bien avancé (Fredho)
Gusts/z0 (Traore, figures en cours).
Splitting (Nicolas et Jean-Yves)
Convection/poches (Catherine)


tickets trac :
=========
Ticket sur les traceurs mis à jour (Ehouarn)
(inchangé)
Ouvrir un ticket sur le fait de mettre des tendances en humidité relative.

Tour de table :
===========
Ionela :
--------
Sur le document de correction T2m, figures finies, s'attaque au texte.

Jean-Yves :
--------------
S'acharne sur la conservation de l'énergie dans la convection profonde.
Commence un travail d'archéologie pour resortir le modèle de brise de vallée de Jingmei.

Abderrahmane :
---------------------
A lancé les simulations pour les articles.
Essaye de réparer les multi-atlas pour ces simulations-là.

Jean-Baptiste :
---------------
Rédige la partie description du modèle pour l'article nuage.

Ehouarn :
---------
Rev 3523 OK sur Ada (sauf avce XIOS, c.f. plus haut)

28/1/2019

Compte rendu du poihl du 28/1/2019

Durée: 1h20

Prochaine formation LMDZ :
==========================
Mettre au propre les échange les échanges de mails / debrief.
Faire un google doc.
Demander à Marie-Pierre d'ajouter les informations pratiques sur l'organisation (HOWTO)
Marie-Pierre va faire la synthèse du sondage. => Fait par MPL (mail du 23/01/19)


Consolidation LMDZ6 :
=====================

(inchangé)
Basculer sur les compilo 2017.2 sur ada.
   * Déjà fait sur libigcm.
   * Frédéric va essayer de faire le passage sur ada
   * L'option d'intialisation à Nan marche en 2017.2


Vérifier si les problèmes de reproductibilité sur ada avec install_lmdz.sh sont résolus. (F&F) Qui semblaient être là même sans orchidee.

Ionela a un problème de divergence de résultats quand elle ajoute un diagnostic pour T2m.

Lionel a un problème en séquentiel sur ada. Tourne en debug mais pas en prod.
    A faire : à tester sur irene.


Problème de diagnostics pour T2m :
----------------------------------
Frédérique et Ionela sont dessus...
Méthode fixée : quand on détecte des humidités négatives,
on interpolle dans le temps T2mmax et rh2min/rh2m, depuis le jour précédent et suivant, puis en corrigeant T2m en remplacant 1/96eme.
Code fortran passé à Yann, interfacé avec XIOS.
1min30 pour traiter T2max sur une simulation AMIP.

Frédérique a avancé sur la compréhension des qsurf < 0 ; qsurf donné par Orchidee faux pour plusieurs raisons :

rho CD V ( q - qsurf ) = Flux orchidee = rho CD V beta ( q - qsat )
donne des qsurf=(1-beta) q + beta qsat
alors que le qsurf renvoyé par orchidee est beta qsat.

D'autre part orchidee peut renvoyer une valeur très forte de beta et qsurf peut devenir subitement très grand en l'absence de turbulence et même pour un sol non saturé. Est-ce normal ?

Haute résolution + dynamico :
-----------------------------

Branche icoshèdre mergée avec trunk la svn 3412. C'est commis et validé:
convergence numérique assurée avec les anciennes versions!
Le moratoire sur les commissions est donc levé.

Attention:  pour ORCHIDEE, par défaut il faudrait utiliser la version 2.1, si on veut la version 2.0 il faut ajouter la clé CPP_NOUNSTRUCT.
C'est géré dans install_lmdz.sh, mais pas dans modipsl.
Réunion HighresMIP vendredi 08/02 à 10h.


Contrôle Qualité / trunk / scripts
==================================

(inchangé)
Passer au nouvel orchidee par défaut.
       Fait en option.
La compilation avec XIOS n'est pas à jour pour Orchidee.


Version 6B
==========
(inchangé)
Projet PRACE/QUEST déposé pour porter entre autre un modèle MR025 : grille MR dans l'atmosphère et résolution 1/4° océan.
Début de l'allocation avril 2019.
* Définition d'une version nouvelle de la nouvelle physique.
Fred a envoyé un mail au Poihl la dessus (à 11h ce matin)...
- correction du calcul de T2m, q2m
- enlever le "truc stratocu d'Arnaud" dans l'entrainement (pour initiés)
- Distribution volumique/surfacique de l'eau sous maille (thèse Jean) ?
- Densités de poches interactives (ce serait bien même si il y a peut-être
   un peu trop de boulot encore...)


Articulation convection profonde / convection peu profonde
==========================================================
(inchangé)
* Jean-Yves travaille sur le transport des précipitations dans les
    ascendances convective.
* Modèle pronostic de densité de poches : a commencé à faire tourner
    les 1D. Des pauses apparaissent dans TWPICE.
    ID : activer la création des poches par les pluies grande échelle.
* Jean-Yves : toutes les équations sont simples et claires en cours de
publi.
* Splitting des poches : en test
* Entrainement convectif / nouvel épluchage (à tester)
* Tube dentifrice (à tester)

Evolution physique/versions futures : (LMDZ7 ou LMDZ6C?)
=====================================
(inchangés ci-dessous)
* Eau avec source méthane
* sur-saturation

Tuning automatique :
====================
Qui présente quoi aux AMA?
(inchangés ci-dessous)
Frédéric a retravaillé sur les scripts csv avec Fleur et Najda
Relance des ateliers les mardi après-midi.


Convergence 1D std / Dephy :
============================


Publications / documentation :
==============================
Fred a lancé les demandes de contributions nominatives au papier général
LMDZ6A
(inchangé)
Papier stratocumulus bouclé (Jam)
Papier bords Est (Fredho), presque bouclé
Papier général LMDZ6A, bien avancé (Fredho)
Frédérique confirme qu'elle va écrire une publi sur le forçage à la surface
Gusts/z0 (Traore, figures en cours).
Nuages : Jean-Baptiste s'y remet
Splitting (Nicolas et Jean-Yves)
Convection/poches (Catherine)



tickets trac :
==============
(inchangé)
#9     Modifications pour une dynamique commune (terre – planete)
#11     Menage sur les prints
#21     "day_ini" dans "create_etat0_limit" et "gcm"
#28     Initialisation problems in cloudth ?
#30     Pb valeurs nulles/non définies sur configs linux
#32     Concervation de la masse des traceurs dans la dynamique
#34     Calving faux en zoome
#44     getin_dump et name
#52     readchlorophyll en OpenMP?
#54     Erreur sur la vorticité en mode zoomé
#55     Constantes non uniformes dans le modèle
#56     Vérifier le calcul des nombres de jours de pluie
#61     Calendrier
#66     Sensibilité au pas de temps de la fermeture stochastique
#67     Traceurs et isotopes.
#70     Conservation de l'énergie avec l'eau
#71     Filtrage de la vorticité
#75     ppm3d non fonctionnel
#76     Sortie epmax
#82     Nouveau calcul de wind10m
#84     Use getin_p instead of getin
#85     Rayonnement dans le 1D
#86     Get rid of "stop" comands in phylmd
#88     routines cldrag
#89     Problèmes grille zoomée :
#90     Nbre d'appel à cdrag buggé?
#91     iflag_con et restartabilité du modèle
#92     Incohérence paramètres d'overlap des nuages
#93     Plantage à la ligne de changement de date en aquaplanete RCE
#94     Problème de reproductibilité
#95     Problème de reproductibilité
le #94 doit pouvoir être fermé
Le #91 peut être fermé, le #95 aussi (car pb était sur Curie)

Tour de table :
===============

Jean-Yves:
-------------
- Se bat avec svn. A dû réinstaller un svn plus récent sur sa machine.
- Se bat aussi avec les équations pour éliminer les précipitations
liquides des ascendances.

Lidia:
------
- Sur Irene, les simus sont OK sur le projet de Laurent Li. Pb de post-traitements (à refaire à la main). Exécutions CMIP6 en berne. 3 premier membres faits. Les AMIP du dec de Fred sont aussi en berne
(toujours le pb de post-traitement).
- Les noeuds xlarge sont rétablis et donc les post-traitements devraient devenir plus fluides.
- Avec Laurent LI, a regardé les intermonitoring et AMIP-TYP. NB:  Laurent trouve les multi-atlas très bien :-)
- A fait des AMIP standard sur Irene, et tests AMIP controle guidage.
Pas de soucis, sauf pour post-traitements.
- A fait une configuration pour Yanfeng avec des tendances 3D mensuelles supplémentaires de forçage. Les post-traitements sont là. Un prolongement 2015-2016 reste à faire avec les forçages de CMIP6 et
tendances 3D en HF.

Adriana:
-------
- RFMIP: Une première phase de publi faite.
- Regarde avec Laurent pour ranger les fichiers limit sur l'espace commun.
- Demandes d'heures DARI A6 pour GenCMIP6


Abderrahmane
---------------------
- A mis en place un état des lieux des outils d'évaluation du modèle,
sur la page LMDZ: http://lmdz.lmd.jussieu.fr/Members/aidelkadi/diagnostiques-autour-du-modele-lmdz
- Travail avec Rodrigo et Artem sur COSP, pour intégrer la toute dernière version: nouvelle interface avec des diagnostiques supplémentaires (nuages, précip.). Reste à être validé puis intégrer en standard.
- Les simulations RCEMPI de Max Popp ont besoin d'être CMORisé. Max va refaire tourner ses modifs dans la dernière version de LMDZ.
- Cosp ne marche plus depuis le merge Dynamico... en cours d'investigation.

Laurent
----------
- Merge dynamico/LMDZ !!

Ehouarn
-----------
- Tests sur Ada maintenant avec ifort 2017.2. RAS sur la dernière version (r3451)
- Faut se remettre à LMDZPedia...

Fred (e-contribution)
------
Modification du thermcell_plume.F90.
Sauvegarde des versions 5B et 6A dans thermcell_plume_5B et 6A
Nouvelle version thermcell_plume.F90 nettoyé de plein d'options et commentaires obsolètes.

Modification du 1D :
lmdz2std.sh ne marchait plus. Généralisé.
Remise à plat du multi cas ayotte.


Frédérique (e-contribution)
--------------
De mon coté: q2m t2m dans l ordre que vous preferez
j ai discuté avec Ionela, qui va faire des tests avec une version
améliorée de stdlevvar.
Je vais en preparer serieursement une qui n utilise pas les ustar,
tetastar et qstar dans la phase de diagnositque
pour q2m, discuté avec Jean-Yves, P. Peylin, Agnes,  je me pose encore
des questions sur comment concilier  qsurf qui passe d'une valeur tres
faible à une valeur voisine de la saturation en 15mn (parce qu il y a
dans l'eau dans le sol d'une part et parce que la resistance
aerodynamique est infinie), j espere avoir une image claire tres vite et
décider de quoi faire à qsurf ou à cd_r_min

28/10/2019

Compte rendu du poihl du 28/10/2019

Prochaine réunion pedalons le 13 janvier 2020.

Formation LMDZ :
   Nicolas Rochetin ne participera pas.
   Trouver quelqu'un pour faire la présentation physique.
   Problème avec la salle qui est réservée pour des travaux.


Points divers pouvant donner lieu à travail parallèle :
========================================

install n'co suite portage jean-zay
---------------------------------------------
install_lmdz.sh fonctionne. Y compris en parallèle et en 1D.
tutorial_ada a été porté sur jean-zay et tourne aussi en local
     A généraliser et nettoyer.
     Convergence avec les scripts temps rééel et edu-earth/planet
Faire marcher l'aquaplanete. Eventuellement sous tutorial

Format standard 1D et ITUNE
----------------------------------------
Tiket 1D #85
   Comportement différent en 1D pour des cas sans rayonnement avec ou sans RRTM

splitting de la couche limite
-----------------------------
   A besoin du facteur d'aridité et de l'inertie du sol.

29/4/2019

Compte rendu du poihl du 29/4/2019

Durée: 1h30

Labellisation :
===============
Dernière relecture aujourd'hui.
Lettres de recommandations complètes.
Date butoir 30 avril.
Site web en cours de réaménagement (Laurent)

Consolidation LMDZ6 :
=====================
Convergence de LMDZ branche trunk et ico : moratoire levé.

5 tests à passer.
* automatique compte LMDZ : OK
* 1D : OK. Lancement intégré dans les tests automatiques.
    Finaliser la différence avec les versions précédentes
    En profiter pour ajouter l'explication des OK dans le mail (Frédéric)
* Couplé IPSL-CM6 OK (lancé à la main par Laurent).
* tests Ehouarn ada : OK (lancé à la main)
* test dynamico-physique LMDZ6 : OK (lancé à la main, avec la config highresmip)
     Ajouter un test de convergence

Peut être l'occasion de vérifier les points ci dessous :
(inchangé)
Vérifier si les problèmes de reproductibilité sur ada avec install_lmdz.sh sont résolus. (F&F) Qui semblaient être là même sans orchidee.
Ionela a un problème de divergence de résultats quand elle ajoute un diagnostic pour T2m.
Lionel a un problème en séquentiel sur ada. Tourne en debug mais pas en prod (testé sur irene : pas de problème. Laurent)

Problème de diagnostics pour T2m :
-------------------------------------------------
Ionela a finalisé une première version du document.
En cours de correction.
Il faudra en extraire un digest pour une annexe du papier de Frédérique.
Denière modification en date à fournir pour la production :
  critère de détection du problème différent suivant les sous surfaces :
  sur continents : hurmin < 0
  mailles mixtes : hurmin < 0 ou DAJmax > 1.2 DAJmax_climatologique
  sur océan : rien

Contrôle Qualité / trunk / scripts
========================
(inchangé)
* install_lmdz.sh ne marche pas sur irene
* l'état initial zoomé ne se crée pas sur irene avec libigcm.
Quand la prochaines version du couplé aura été finalisée sur libigcm (IPSL-CM6.2), faire les modifications suivantes dans install_lmdz.sh :
Passer au nouvel orchidee (svn 5004) par défaut. Fait en option.
La compilation avec XIOS n'est pas à jour pour Orchidee.

Evolution physique/versions futures :
=====================================
(inchangé)
* Jean-Yves travaille sur la supression de l'eau liquide dans les ascendances adiabatiques d'Emanuel.
* Modèle pronostic de densité de poches :
   Débugé dans le intercité
   Les pluies grande échelle sont revenues à la normale.
   C'est prêt à l'emploie 6B.
* Splitting des poches :
   Jean-Yves : toutes les équations sont simples et claires en cours de publi.en test
* Entrainement convectif / nouvel épluchage (à tester)
* Tube dentifrice (à tester)
* Eau avec source méthane
* sur-saturation

Tuning automatique :
====================
Simulation MR issue d'un tuning automatique: a fait 50 ans.
1ere ébauche de multi-atlas avec d'autres modèles CMIP6 :
https://vesg.ipsl.upmc.fr/thredds/fileServer/IPSLFS/jservon/C-ESM-EP/MR_jservon/AtlasExplorer/atlas_AtlasExplorer_MR.html

Version 6B
==========
Premier tuning en 1D de la version à 95 niveaux.
Lancement d'une série de 210 simulations 3D en 144x142x95 avec ce nouveau réglage et la dynamique de population de poches avec deux paramètres libres
(rayon initial des poches et temps de vie de la convection dans les poches).
Presque un plantage sur deux.

On vient de resoumettre un projet Prace, très centré sur le tuning automatique.

(Inchangé)
* Reformulation des flux de masse dans le modèle du thermique (en cours d'ajustement)
* Abderrahmane a intégré les routines de Jean dans une version récente.
Ca tourne. Prêt à être commis.
* Frédéric a défini une nouvelle version 95 niveaux.
Projet PRACE/QUEST déposé pour porter entre autre un modèle
MR025 : grille MR dans l'atmosphère et résolution 1/4° océan.
Début de l'allocation avril 2019.
Définir d'ici là, et tuner, une version nouvelle de la nouvelle physique.
* Correction T2m
* entrainement modifié des thermiques.!!
* densité de poches interactive : il faut rerégler la mousson.
* schéma vertical des nuages ? Le code n'est pas encore commis.

Convergence 1D std / Dephy :
=======================
(inchangé)
Coding sprint sur la standardisation des format au CNRM jeudi dernier.
Etape 1 : s'assurer d'une chaîne complète côté LMD et CNRM à partir
du même fichier arm_cu

Publications / documentation :
=======================
(Inchangé)
La dernière version de la documentation ES-DOC :
https://docs.google.com/spreadsheets/d/1eSpROQVPsYLCh97RNZbeapbVSkaypeeVWYGjZpXDF5Y/edit#gid=766710776
Papier stratocumulus bouclé (Jam) soumis !
Papier bords Est (Fredho), presque bouclé
Papier général LMDZ6A, bien avancé (Fredho)
Frédérique a démarré sur le papier sur le couplage continental.
Gusts/z0 (Traore, figures en cours).
Nuages : Jean-Baptiste s'y remet
Splitting (Nicolas et Jean-Yves)
Convection/poches (Catherine)


tickets trac :
==============
(inchangé)


Tour de table :
===============

Jean-Yves :
-----------
Quiberon

Lidia :
-------
A travaillé sur les publications
A terminé l'ensemble CMIP6 Amip-historique + multi atlas + intermonitoring
A trouvé des anomalies dans les inter-monitoring sur les flux latents.
Il a fallu refaire tous les monitorings à la main. Du coup OK.
Simulation Amip-forcing (forçage constant à l'année 1870) de Jean-Louis a eu du mal à partir. Problème de dr2xml. A fait 150 depuis.
Ensemble amip du Deck sur irene : 2 plantages modèles.
   Il y en a eu un sur l'historique long.
Contrôle-guidage fait sur irene. Va relancer le mail.
   Avec des sorties supplémentaires pour Yanfeng
Va mettre à jour une page avec les simulations de mise au point de la configuration CMIP6 (LMDZ6A).

Ehouarn :
-------------
Test sur la 3489 OK sur ada
idris : ont mis en place le compilo intel 2019.
   Ce sera cette version sur Jean Zay.
   Il va falloir pas mal changer les options.
S'est replongé dans les traceurs. A discuter avec Frédéric.

Ionela :
----------
A commis le bornage des T2m sur la 3489 avec des flag.
   Mettre par défaut la version sans bornage.
A testé la proposition de correction de Frédérique.
   Corrige les q2m < 0, mais q2m est au dessous des deux autres.
   Regarder si ce n'est pas une question du moment où on sort les variables.
A fait des simulations zoomées initialisées en pseudo temps réel.

Laurent :
------------
Prochaine version du couplé IPSL-CM6.2
   Josefine va utiliser un arch.env
   La compilation ne se fera plus par un makefile mais par un script qui lancera la compilation des différents modèles.
   Faire remonter l'idée de tester ca sur ada.
Fait du ménage sur les xml.

Frédéric :
----------
Florence

3/6/2019

Compte rendu du poihl du 2/6/2019

1h25

Informations diverses :
=======================

Prochaine réunion Pedalons :
============================
le 24 juin : sur les traceurs et isotopes
octobre sur la convection
en réserve : configurations zoomées

Problème T2m :
==============
En cours de traitement

Contrôle Qualité / trunk / scripts
========================

XIOS ne marche plus depuis la 3509 sur ada.
Malgré les corrections sur les définitions de variables,
Ehouarn a une erreur NetCDF/HDF.
Marche chez Laurent sur ada.

Corriger (les _auto_ et _reset_) les scripts install_lmdz (Abderrahmane).

Laurent a mis en place une page contrôle qualité :
http://lmdz.lmd.jussieu.fr/le-coin-des-developpeurs/controle-qualite

(inchangé)
* install_lmdz.sh ne marche pas sur irene
* l'état initial zoomé ne se crée pas sur irene avec libigcm.
Quand la prochaines version du couplé aura été finalisée
sur libigcm (IPSL-CM6.2), faire les modifications suivantes dans
install_lmdz.sh :
Passer au nouvel orchidee (svn 5004) par défaut. Fait en option.
La compilation avec XIOS n'est pas à jour pour Orchidee.

Vérifier si les problèmes de reproductibilité sur ada avec install_lmdz.sh sont résolus. (F&F) Qui semblaient être là même sans orchidee.
Ionela a un problème de divergence de résultats quand elle ajoute un diagnostic pour T2m.
Lionel a un problème en séquentiel sur ada. Tourne en debug mais pas en prod (testé sur irene : pas de problème. Laurent)


Evolution physique/versions futures :
=====================================
* Jean-Yves travaille sur la supression de l'eau liquide
  dans les ascendances adiabatiques d'Emanuel.
  Modifications commises
  Plantages rapides en 3D.
* Jean-Yves a commencé à regarder la conservation de l'énergie.
(inchangé)
* Modèle pronostic de densité de poches :
   Débugé dans le intercité
   Les pluies grande échelle sont revenues à la normale.
   C'est prêt à l'emploie 6B.
* Splitting des poches :
   Jean-Yves : toutes les équations sont simples et claires en cours de publi.en test
* Entrainement convectif / nouvel épluchage (à tester)
* Tube dentifrice (à tester)
* Eau avec source méthane
* sur-saturation

Tuning automatique :
================
Frédéric s'est relancé sur les simulations 1D pour l'article de Fleur.

Version 6B
==========
(Inchangé)
* Reformulation des flux de masse dans le modèle du thermique (en cours d'ajustement)
* Abderrahmane a intégré les routines de Jean dans une version récente.
Ca tourne. Prêt à être commis.
* Frédéric a défini une nouvelle version 95 niveaux.
Projet PRACE/QUEST déposé pour porter entre autre un modèle
MR025 : grille MR dans l'atmosphère et résolution 1/4° océan.
Début de l'allocation avril 2019.
Définir d'ici là, et tuner, une version nouvelle de la nouvelle physique.
* Correction T2m
* entrainement modifié des thermiques.!!
* densité de poches interactive : il faut rerégler la mousson.
* schéma vertical des nuages ? Le code n'est pas encore commis.

Convergence 1D std / Dephy :
=======================
Calendrier 365 jour OK mais corriger le jour du départ dans les run.def

Publications / documentation :
=======================
Décision concernant le fait de rejouer des simulations 5A, 5B, 6A
sur SSTs climatiques pour alimenter les articles.

Mise en place d'une page web :

http://lmdz.lmd.jussieu.fr/Members/aidelkadi/simulations-de-sensibilites-pour-les-articles-cmip6

Comparaison 5A/6A avec OR2 ou OR11
https://vesg.ipsl.upmc.fr/thredds/fileServer/IPSLFS/fabric/lmdz/MultiSimu/LmdzOr11et2cAP/ZON/YEAR/index.html
Pour les flux radiatifs, c'est la physique qui joue :
https://vesg.ipsl.upmc.fr/thredds/fileServer/IPSLFS/fabric/lmdz/MultiSimu/LmdzOr11et2cAP/ZON/YEAR/index.html
Pour la pluie Ouest Africaine les deux jouent
https://vesg.ipsl.upmc.fr/thredds/fileServer/IPSLFS/fabric/lmdz/MultiSimu/LmdzOr11et2cAP/AMMACROSS/JJAS/przon.png

Multi atlas en construction avec 5A/NPv3.2/5B
https://vesg.ipsl.upmc.fr/thredds/fileServer/IPSLFS/fabric/lmdz/MultiSimu/LmdzOr5AB_6A/ACCUEIL.html

Définir les simulations de sensibilité pour les nuages (Jean-Baptiste et Abderrahmane).

(inchangé)
Frédérique a démarré sur le papier sur le couplage continental.
  * regarde ce qui vient du couplage comme différence entre CMIP5 et CMIP6.
  * L'intermitence des pluies joue beaucoup sur les moyennes latitudes.
  * Couplage plus fort dans LMDZ6
  * Biais froid l'hivers dans les hautes latitudes.
Jean-Baptiste a commencé à regarder la partie phase mixte et le lien avec la dynamique.
Réfléchir à refaire des simulations 5A/5B climatiques propres.
Papier stratocumulus bouclé (Jam) : major revisions en cours.
La dernière version de la documentation ES-DOC :
https://explore.es-doc.org/cmip6/models
apier bords Est (Fredho), presque bouclé
Papier général LMDZ6A, bien avancé (Fredho)
Gusts/z0 (Traore, figures en cours).
Nuages : Jean-Baptiste s'y remet
Splitting (Nicolas et Jean-Yves)
Convection/poches (Catherine)


tickets trac :
==============
Ouvrir un ticket sur le fait de mettre des tendances en humidité relative.
Laurent est en train de fermer des tickets.
Point au prochain poihl.


Tour de table :
===============

Jean-Yves :
-----------
Fait beaucoup de méca flu pour la manip du tourbillon

Laurent :
---------
Remet en place le contrôle qualité sur ada.
   - sequentiel mpi openMP hygride nouvelle physique
   - 1+1=2 et reproductibilité avec LMDZOR, installation libigcm.
Tourne en 48x36 mais pas en 96x95.

Abderrahmane :
--------------
Termine le travail sur Cosp en plus des simulations et atlas pour les articles.

Jean-Baptiste :
---------------
Travaille à l'écriture de l'article nuages.
Est reparti des physiq.def de def_list

Frédéric :
----------
S'est mis aux figures python pour les révisions du papier stratocumulus.
Grâce à ses révisions, comprend comment marche le modèle du thermique.

30/9/2019

Compte rendu du poihl du 30/9/2019: NOUVELLE FORMULE

Durée 37 min (partie commune) + 1h (travail en parallèle)


Inauguration des poihls nouvelle formule.
Une demi-heure d'échange d'information diverses et de sujets à travailler ensemble.
Puis une heure de travail en parallèle.
Finalement, tous dans la même salle ce qui permet d'échanger entre les différents sujets.


Points divers pouvant donner lieu à travail parallèle :
=========================================

1/ On a perdu la convergence numérique une ou deux fois.
     Vérification faite pendant le poihl (Laurent et Ehouarn), il s'agissait d'une fausse alerte liée aux tests pour la bascule
     des outils de test automatique sur une nouvelle machine.

2/ Essayer de faire une réunion avec David sur l'interface traceurs.
     (mail envoyé par Ehouarn pendant le poihl. Rdv au bocal jeudi)

3/ Passage à jean-zay
     La machine n'étant pas accessible pendant le poihl, on n'a pas pu avancer.

4/ Avancer la chute des pluies liquides dans les ascendances.
     Lancement de simulations 3D pendant le poihl (Jean-Yves et Frédéric).
     Ca a tourné plusieurs années sans planter sur ada !
     Les populations dynamiques de poches en sont quant à elle à 120 ans en 144x142x79 (ca plantait plus souvent en L95).
     Multi atlas en cours de réalisation.

5/ Tour d'horizon des nouveaux diagnostics d'Abderrahmane.
     Validation des nouvelles pages de coupes verticales nuageuses (Abderrahmane et Frédéric).

Trac :
====
Demander à Ionela si on peut fermer le tiket sur le nombre de jour de pluie.

Formation :
===========
Du 9 au 11 décembre.
Questionaire lancé.
15 inscrits (6 thésards, 5 post-doc et 4 chercheurs) dont 3 planeto.
    On va donc formaliser une offre parallèle pour les planeto sur certaines sessions.

Pedalons :
==========
1ere partie :
ouverture d'une boite à idée + fil de discussion par réunion.
Dire deux mots sur l'évolution du modèle. A afiner au prochain poihl.
    1/ labellisation
    2/ papier LMDZ soumis + en cours de rédaction.
    3/ les avancées sur le multi atlas
    4/ bug report
Pedalons de janvier, le 13 ou le 20.
    Utilisation du zoom pour l'étude des climats régionaux.

4/2/2019

Compte rendu du poihl du 4/2/2019

Durée: 1h40

Dernière formation LMDZ :
=========================
Marie-Pierre a envoyé la synthèse des sondages
Marie-Pierre a préparé un doc rappelant les choses pratiques.
Echange avec Adriana sur la passation avec Marie-Pierre pour la formation.
Suggère une équipe de 3 tournant.
Frédéric suggère qu'il faut un responsable de la formation.
Qui s'occupe entre autres de vérifier qu'il y a un financement OSU
Avis aux candidats : réponse souhaitée pour le 11 février.

Consolidation LMDZ6 :
=====================

Basculer sur les compilo 2017.2 sur ada.
   * Fait pour tutorial_ada.tar
     Ancien tutorial stocké sur
~lmdz/WWW/Distrib/tutorial_ada_intel2013.tar
   * L'option d'intialisation à Nan marche en 2017.2.
     A ajouter dans le debug du arch ada
   * Etape suivante : gérer les jobs multi machines.

(inchangé)

Vérifier si les problèmes de reproductibilité sur ada avec install_lmdz.sh sont résolus. (F&F) Qui semblaient être là même sans orchidee.

Ionela a un problème de divergence de résultats quand elle ajoute un diagnostic pour T2m.

Lionel a un problème en séquentiel sur ada. Tourne en debug mais pas en prod.
    A faire : à tester sur irene.


Problème de diagnostics pour T2m :
----------------------------------

Principe :
Méthode fixée : quand on détecte des humidités négatives, on interpolle dans le temps T2mmax et rh2min/rh2m, depuis le jour précédent et suivant, puis en corrigeant T2m en remplacant 1/96eme.

Ionela a itéré avec Yann. Il y avait un souci. Sous contrôle 4 runs amip ont tourné (10 ans prolongés à 36):
* un buggé
* un borné avec  T2m dans [Ts,T1]
* idem mais borné dans les cas stables seulement
* idem mais bornées si (stable et q2m<0)
La dernière est la plus proche de la buggée par construction.


Haute résolution + dynamico :
-----------------------------

Branche icoshèdre mergée avec trunk la svn 3412.
Quelques détails à régler pour tourner dans toutes les configurations.
cosp marche dans certaines versions mais pas dans toutes.
Refaire un moratoire pour régler tous les détails
   1/ Vérifier que c'est la modifs d'Olivier qui a fait
      perdre (volontairement) la convergence.
   2/ vérifier qu'on tourne en local / ada / irene
   3/ vérifier qu'on tourne IOIPSL/XIOS et Cosp


Contrôle Qualité / trunk / scripts
==================================
(inchangé)
Passer au nouvel orchidee par défaut.
       Fait en option.
La compilation avec XIOS n'est pas à jour pour Orchidee.

Articulation convection profonde / convection peu profonde
==========================================================
* Jean-Yves travaille sur le transport des précipitations dans les
    ascendances convective. Tout est prêt.
    Compte introduire 2 paramètres qui disent quelle fraction de
    pluie liquide et glace on élimine à chaque niveau.
    En ce moment : 0, 0
    On vise : ~1 , ~0
* Modèle pronostic de densité de poches :
    Débugé dans le intercité
    Les pluies grande échelle sont revenues à la normale.
    C'est prêt à l'emploie 6B.
* Splitting des poches :
    Jean-Yves : toutes les équations sont simples et claires en cours de
publi.en test
* Entrainement convectif / nouvel épluchage (à tester)
* Tube dentifrice (à tester)

Evolution physique/versions futures :
=====================================
* Modification de l'entrainement latéral dans les thermiques
   (on ne prend plus en compte la correction d'Arnaud qui
    n'est plus active que dans le détrainement)
   A fait une nouvelle version de thermcell_plume nettoyée.
(inchangés ci-dessous)
* Eau avec source méthane
* sur-saturation

Tuning automatique :
====================
Frédéric a corrigé la métrique MJO en enlevant les îles.
Se remet sur le tuning 3D.
(inchangés ci-dessous)
Frédéric a retravaillé sur les scripts csv avec Fleur et Najda
Relance des ateliers les mardi après-midi.

Version 6B
==========
Projet PRACE/QUEST déposé pour porter entre autre un modèle
MR025 : grille MR dans l'atmosphère et résolution 1/4° océan.
Début de l'allocation avril 2019.
Définir d'ici là, et tuner, une version nouvelle de la nouvelle physique.
* Correction T2m
* entrainement modifié des thermiques
* densité de poches interactive : il faut rerégler la mousson.
* schéma vertical des nuages ? Le code n'est pas encore commis.
A compléter ...
Frédéric a commencé des tests à 119 niveaux.
Mais tombe sur le problème que RRTM ne tourne avec plus de 100 niveaux.

Convergence 1D std / Dephy :
============================
Frédéric a identifié un problème de setup sur bomex.

Publications / documentation :
==============================
Papier stratocumulus bouclé (Jam). Prêt à envoyer.
Papier bords Est (Fredho), presque bouclé
Papier général LMDZ6A, bien avancé (Fredho). Etienne Vignon a écrit sa
partie et Nicolas s'en occupe cet après-midi.
Frédérique confirme qu'elle va écrire une publi sur le forçage à la surface
Gusts/z0 (Traore, figures en cours).
Nuages : Jean-Baptiste s'y remet
Splitting (Nicolas et Jean-Yves)
Convection/poches (Catherine)



tickets trac :
==============
(inchangé)
#9     Modifications pour une dynamique commune (terre – planete)
#11     Menage sur les prints
#21     "day_ini" dans "create_etat0_limit" et "gcm"
#28     Initialisation problems in cloudth ?
#30     Pb valeurs nulles/non définies sur configs linux
#32     Concervation de la masse des traceurs dans la dynamique
#34     Calving faux en zoome
#44     getin_dump et name
#52     readchlorophyll en OpenMP?
#54     Erreur sur la vorticité en mode zoomé
#55     Constantes non uniformes dans le modèle
#56     Vérifier le calcul des nombres de jours de pluie
#61     Calendrier
#66     Sensibilité au pas de temps de la fermeture stochastique
#67     Traceurs et isotopes.
#70     Conservation de l'énergie avec l'eau
#71     Filtrage de la vorticité
#75     ppm3d non fonctionnel
#76     Sortie epmax
#82     Nouveau calcul de wind10m
#84     Use getin_p instead of getin
#85     Rayonnement dans le 1D
#86     Get rid of "stop" comands in phylmd
#88     routines cldrag
#89     Problèmes grille zoomée :
#90     Nbre d'appel à cdrag buggé?
#91     iflag_con et restartabilité du modèle
#92     Incohérence paramètres d'overlap des nuages
#93     Plantage à la ligne de changement de date
#94     Problème de reproductibilité
#95     Problème de reproductibilité
le #94 doit pouvoir être fermé


Tour de table :
===============

Jean-Yves :
-----------
A écrit les formules pour élminer les précips et a commencé à coder.
A l'impression qu'avec le 1D actuel on ne compile qu'avec phylmd.

Jean-Baptiste :
---------------
Travaille sur les figures de l'article nuages.
Veut revenir sur les coupes zonales de phases de nuages.
Nécessite d'utiliser Cosp

Abderrahmane :
--------------
Pour résoudre le problème de Cosp, a testé plusieurs versions
345+1/6/7 marche avec cosp
    +9     plante
teste la +8
A récupéré une nouvelle interface de Rodrigo avec pas mal de diagnostics en plus.
A récupéré des scripts de Rodrigo pour tracer sous python.
    Va essayer de les automatiser

Laurent :
---------
Continue à régler les différents points sur la nouvelle trunk
Discussion avec le TGCC sur l'optimisation;
    Retravaille sur le cas test. Les chiffres sont incompréhensibles.

Ionela :
--------
Questions :
T2m : que fait-on sur les hautes fréquences ?
Métrique de tuning à la surface bugguée.

Frédéric :
----------
A interfacté les multi atlas à la LMDZ en utilisant C-ESM-MEP

4/3/2019

Compte rendu du poihl du 4/3/2019

Durée: 1h35

Informations diverses :
=======================
2 pages dans Le Monde daté de mercredi sur l'intelligence artificielle (Jean-Yves)

Prospective LMDZ :
==================
Mettre les slides de notes en google doc (Frédéric).

Mise en place de réunions des développeurs/utilisateurs tous les 2/3 mois.
Proposition de Sébastsien Fromang à la réunion de prospective.
Réunions PEDALONS (?) pour
  Point Etdendu des Développeurs et Amis de Lmdz :   aspects Outil informatique, Numérique, Science)
Pour qui :
   * Réunion des développeurs/utilisateurs.
   * Aspects physiques et techniques.

Forme de la réunion :
---------------------
Faire le point sur les développements depuis la dernière réunion.
Discuter des décisions pour les suivantes.
Ehouarn : Avoir recueilli des demandes des utilisateurs; Besoin d'un correspondant (Sébastien F. + 1 ou 2 autres)
Petits exposés et discussions en réponse à ces demandes.
Appel à autres petits exposé (identification de problème, proposition de développement, partage d'expertise).

Questions :
Comment faire en sorte que ces exposés alimentent une stratégie de suivi d'avancement de projets ?
Quid de l'implication de la planéto ?
En faire un point de rencontre de dynamiques de travail parallèle ?
   sur des questions informatiques, physiques ... ?

Première réunion le 1er avril matin : salle Gobbi.
--------------------------------------------------
(Déreserver la salle Oasis pour le poihl normal - fait)
Mail en préparation (Sébastien, Frédéric, Adriana, Jean-Baptiste)
Exceptionnelement, la première moitié de la réunion sera consacrée à la synthèse de la réunion de prospective et à la préparation du dossier de labélisation.

Sondage :
---------
Envoyé il y a 10 jours.
Pas mal de réponses.
Laurent va relancer.
Laurent va récupérer la liste des participants aux formations.

Remise à plat des listes mails :
================================
lmdz-commit : on décide d'utiliser cette liste pour discuter des commissions et de l'évolution du code.
poihl       : On ne change pas les contours sauf ce qu'on bascule sur lmdz-commit
lmdz-users  : échanger de l'info entre utilisateurs et demander de l'aide.
lmdz        : info générales.

Consolidation LMDZ6 :
=====================
(inchangé)
Vérifier si les problèmes de reproductibilité sur ada avec install_lmdz.sh sont résolus. (F&F) Qui semblaient être là même sans orchidee.
Ionela a un problème de divergence de résultats quand elle ajoute un diagnostic pour T2m.
Lionel a un problème en séquentiel sur ada. Tourne en debug mais pas en prod.
   A faire : à tester sur irene.


Problème de diagnostics pour T2m :
----------------------------------

Rappel du principe de correction : quand on détecte des humidités négatives, on interpolle dans le temps T2mmax et rh2min/rh2m, depuis le jour précédent et suivant, puis on corrige T2m moyen journalier en corrigeant
1/96eme de T2m par la correction sur T2mmax.

Ionela a refait des simulations sur ada pour avoir un run buggé et un run corrigé (ne corrigeant que les points abbhérants : seulement les cas stables avec des q2m <0) sur ada.
Info : si on met les sorties à tous les pas de temps de la physique, avec 2 champs 3D -> 1 heure par mois.
A partir de ces runs, on applique la corrcetion sur le run buggé.
   Corrige bien tous les points.
   La distribution cumulée des erreurs est bien améliorée comme on l'attend.
   Sur la moyenne mensuelle de tasmax, on a une erreur max de 8 degré sur quelques points.
A automatisé les scripts sur irene et va les passer sur irene.

Haute résolution + dynamico :
-----------------------------
Yann a récupéré la version mergée de Laurent.
A renvoyé quelques modifs à Laurent.
Laurent est en cours de test.
On lève le moratoire si
   * OK^n sur le test automatique
   * IPSL CM6.1.8 en libigcm
   * tests en debug sur ada (Ehouarn)
   * 1D (à automatiser)
   * couplage dynamico
Faire à la main un lien logique d'une telle version vers LMDZ.trunk.tar.gz
Créer un test automatique dynamico/ancienne physique.
On ne lève le moratoire sur les commissions qu'après.


Contrôle Qualité / trunk / scripts
==================================
(inchangé)
Passer au nouvel orchidee par défaut.
      Fait en option.
La compilation avec XIOS n'est pas à jour pour Orchidee.


Evolution physique/versions futures :
=====================================
* Ludovic est en train de faire des poches sous les thermiques.
* Jean-Yves travaille sur le transport des précipitations dans les ascendances convectives.
   IMPREVU : pour le moment la répartition glace / liquide est
      gérée en fonction de la température. Mais ne marche plus quand on jette la pluie liquide.
(inchangé)
* Modèle pronostic de densité de poches :
   Débugé dans le intercité
   Les pluies grande échelle sont revenues à la normale.
   C'est prêt à l'emploie 6B.
* Splitting des poches :
   Jean-Yves : toutes les équations sont simples et claires en cours de publi.en test
* Entrainement convectif / nouvel épluchage (à tester)
* Tube dentifrice (à tester)
* Eau avec source méthane
* sur-saturation

Tuning automatique :
====================

Version 6B
==========
(inchangé)
Projet PRACE/QUEST déposé pour porter entre autre un modèle
MR025 : grille MR dans l'atmosphère et résolution 1/4° océan.
Début de l'allocation avril 2019.
Définir d'ici là, et tuner, une version nouvelle de la nouvelle physique.
* Correction T2m
* entrainement modifié des thermiques
* densité de poches interactive : il faut rerégler la mousson.
* schéma vertical des nuages ? Le code n'est pas encore commis.
A compléter ...
Frédéric a commencé des tests à 119 niveaux.
Mais tombe sur le problème que RRTM ne tourne avec plus de 100 niveaux.

Convergence 1D std / Dephy :
============================
(inchangé)
Frédéric a identifié un problème de setup sur bomex.

Publications / documentation :
==============================
Papier stratocumulus bouclé (Jam) soumis !
Papier bords Est (Fredho), presque bouclé
Papier général LMDZ6A, bien avancé (Fredho)
Frédérique a démarré sur le papier sur le couplage continental.
Gusts/z0 (Traore, figures en cours).
Nuages : Jean-Baptiste s'y remet
Splitting (Nicolas et Jean-Yves)
Convection/poches (Catherine)

tickets trac :
==============
(inchangé)
#9      Modifications pour une dynamique commune (terre – planete)
#11     Menage sur les prints
#21     "day_ini" dans "create_etat0_limit" et "gcm"
#28     Initialisation problems in cloudth ?
#30     Pb valeurs nulles/non définies sur configs linux
#32     Concervation de la masse des traceurs dans la dynamique
#34     Calving faux en zoome
#44     getin_dump et name
#52     readchlorophyll en OpenMP?
#54     Erreur sur la vorticité en mode zoomé
#55     Constantes non uniformes dans le modèle
#56     Vérifier le calcul des nombres de jours de pluie
#61     Calendrier
#66     Sensibilité au pas de temps de la fermeture stochastique
#67     Traceurs et isotopes.
#70     Conservation de l'énergie avec l'eau
#71     Filtrage de la vorticité
#75     ppm3d non fonctionnel
#76     Sortie epmax
#82     Nouveau calcul de wind10m
#84     Use getin_p instead of getin
#85     Rayonnement dans le 1D
#86     Get rid of "stop" comands in phylmd
#88     routines cldrag
#89     Problèmes grille zoomée :
#90     Nbre d'appel à cdrag buggé?
#91     iflag_con et restartabilité du modèle
#92     Incohérence paramètres d'overlap des nuages
#93     Plantage à la ligne de changement de date
#94     Problème de reproductibilité
#95     Problème de reproductibilité
le #94 doit pouvoir être fermé


Tour de table :
===============

Marie-Alice :
-------------
A des problèmes pour extraire le point de plantage du couplé MR.
Injures quand elle sort un point de grille.
Ehouarn : mettre le "print level" de XIOS à 100.
Jean-Yves est dans les starting block pour regarder ce point ensuite.

Ionela, Ehouarn, Laurent, Jean-Yves, Adriana :
---------------------------------------------
Rien à rajouter.

6/5/2019

Réunion du poihl du 6/5/2019

Durée: 1h25

Informations diverses :
=======================
1ere ébauche de multi-atlas avec d'autres modèles CMIP6 :
https://vesg.ipsl.upmc.fr/thredds/fileServer/IPSLFS/hourdin/C-ESM-EP/MR_hourdin/C-ESM-EP_MR.html


Un point sur les traceurs :
===========================
Proposition de nouveaux traceurs.def

Buts :
pouvoir panacher des traceurs de Inca, Reprobus, ...
Thibaut propose une organisation en sections avec une ne ligne de 4 caractères en début d'entête.

On pourait avoir en plus :
* les filliations.
* le contrôle du transport par les paramétrisations
* des valeurs min/max

Ca donnerait :
Nom_du_traceur(C)  advect_x(I)  advect_y(I)  physique(I)  Père  min max
Quel est la meilleure façon de lire  ? :
 - Avec tout sur la même ligne (y compris le nom du réacteur chimique ?)
 - En xml pour avoir des arguments globaux
 - Par section en ascii de base.

Faire une réunion spécifique sur le sujet dans les semaines qui viennent.


Labellisation :
===========
                    !!!!!  Soumis  !!!!!


Consolidation LMDZ6 :
==================
(Inchangé)
5 tests à passer.
* automatique compte LMDZ : OK
* 1D : Lancement intégré dans les tests automatiques
* Couplé IPSL-CM6 OK (lancé à la main par Laurent).
* tests Ehouarn ada : OK (lancé à la main)
* test dynamico-physique LMDZ6 : OK (lancé à la main, avec la config highresmip)
     Ajouter un test de convergence

Peut être l'occasion de vérifier les points ci dessous :
(inchangé)
Vérifier si les problèmes de reproductibilité sur ada avec install_lmdz.sh sont résolus. (F&F) Qui semblaient être là même sans orchidee.
Ionela a un problème de divergence de résultats quand elle ajoute un diagnostic pour T2m.
Lionel a un problème en séquentiel sur ada. Tourne en debug mais pas en prod (testé sur irene : pas de problème. Laurent)

Problème de diagnostics pour T2m :
------------------------------------------------
Ionela finalise son document.
Caclule les stats sur les nombres de jours qui se suivent.
Va passer les scripts à Guillaume pour la mise  en production.

Contrôle Qualité / trunk / scripts
========================
(inchangé)
* install_lmdz.sh ne marche pas sur irene
* l'état initial zoomé ne se crée pas sur irene avec libigcm.
Quand la prochaines version du couplé aura été finalisée sur libigcm (IPSL-CM6.2), faire les modifications suivantes dans install_lmdz.sh :
Passer au nouvel orchidee (svn 5004) par défaut. Fait en option.
La compilation avec XIOS n'est pas à jour pour Orchidee.

Evolution physique/versions futures :
============================
* Jean-Yves travaille sur la supression de l'eau liquide dans les ascendances adiabatiques d'Emanuel.
  A résolu le problème de conservation de l'eau mais sans comprendre pourquoi.
  Donne des tendances à mieux que le % près.
  A commencer à commettre (modification de la façon de calculer la température dans l'ascendance : un flag avec 3 possibilités).

(inchangé)
* Modèle pronostic de densité de poches :
   Débugé dans le intercité
   Les pluies grande échelle sont revenues à la normale.
   C'est prêt à l'emploie 6B.
* Splitting des poches :
   Jean-Yves : toutes les équations sont simples et claires en cours de publi.en test
* Entrainement convectif / nouvel épluchage (à tester)
* Tube dentifrice (à tester)
* Eau avec source méthane
* sur-saturation

Tuning automatique :
================
RAS

Version 6B
==========
(Inchangé)
* Reformulation des flux de masse dans le modèle du thermique (en cours d'ajustement)
* Abderrahmane a intégré les routines de Jean dans une version récente.
Ca tourne. Prêt à être commis.
* Frédéric a défini une nouvelle version 95 niveaux.
Projet PRACE/QUEST déposé pour porter entre autre un modèle MR025 : grille MR dans l'atmosphère et résolution 1/4° océan.
Début de l'allocation avril 2019.
Définir d'ici là, et tuner, une version nouvelle de la nouvelle physique.
* Correction T2m
* entrainement modifié des thermiques.!!
* densité de poches interactive : il faut rerégler la mousson.
* schéma vertical des nuages ? Le code n'est pas encore commis.

Convergence 1D std / Dephy :
=======================
(inchangé)
Coding sprint sur la standardisation des format au CNRM jeudi dernier.
Etape 1 : s'assurer d'une chaîne complète côté LMD et CNRM à partir
du même fichier arm_cu

Publications / documentation :
=======================
(Inchangé)
La dernière version de la documentation ES-DOC :
https://docs.google.com/spreadsheets/d/1eSpROQVPsYLCh97RNZbeapbVSkaypeeVWYGjZpXDF5Y/edit#gid=766710776
Papier stratocumulus bouclé (Jam) soumis !
Papier bords Est (Fredho), presque bouclé
Papier général LMDZ6A, bien avancé (Fredho)
Frédérique a démarré sur le papier sur le couplage continental.
Gusts/z0 (Traore, figures en cours).
Nuages : Jean-Baptiste s'y remet
Splitting (Nicolas et Jean-Yves)
Convection/poches (Catherine)

tickets trac :
=========
(inchangé)

Tour de table :
===========

Ehouarn :
-------------
Rev 3492 OK
Mettre le calendrier 1D.
N'a pas avancé sur les traceurs. Va faire une minidoc en attendant de reprendre ca.

Jean-Baptiste :
-------------------
Continue à comparer les nuages dans 5A/5B/6A pour l'article.

Jean-Yves :
---------------
Atoodee

Ionela :
----------
Est en train de refaire la amip avec des sorties à la fréquence de la physique pour vérifier le nobmre d'instabilité.

Adriana :
------------
Travaille sur Rfmip.
Commence à réfléchir avec Sébastien pour le contenu de la prochaine réunion Pédalons.
Colloque Cmip6 à Bordeaux.

Abderrahmane :
----------------------
A commis la nouvelle version de Cosp mais elle n'est pas encore opérationnelle.

Question sur les diagnostics :
   On ne sort plus les variables sur niveaux standard avec les xml de base parce que la routine d'interpollation en ligne avait été désactivée.

A côté de la logique CMIP avec DR2xml qui génère des xml de 30000  lignes très peu organisés, il faut des xml à nous, mieux organisés, avec des groupes
   de variables (testé en ce moment par Adriana).

Frédéric :
-------------
Travaille sur les articles et le tuning;

7/10/2019

Compte rendu du poihl du 7/10/2019

Durée 37 min (partie commune) + 1h (travail en parallèle)

Conséquences des discussions de la fois précédente :
==========================================
Point avec David Cugnet. Convergence sur la définition du traceur.def

Points divers pouvant donner lieu à travail parallèle :
=========================================

Jean-Zay :
----------
install_lmdz.sh fonctionne. Y compris en parallèle et en 1D.
* des plantages découverts par jean-zay.
plantage pbl_surface_mod (debug, 3D, ancienne physique)
Problème à la compilation en 1D.
qsat2m_cor pas initialisé
l_mix plante dans phys_output
forc_u,forc_v n'étaient pas passés en common en 1D
* Nemo a découvert des problème avec -fp-model fast

Pendant l'extension du poihl, les problèmes de pbl_surface ont été résolus mais d'autres sont apparus dans cv30_routines. Résolus eux aussi.
Du coup, à a fin du poihl, le 1D tourne sur jean-zay en mode debug et ancienne physiques (les plantages pbl_surface et cv30_routines étaient spécifiques de l'ancienne physique).

Test de edu-planet / edu-earth :
------------------------------------------
Y travailler avec Laurent lors d'un prochain poihl.
Tourne avec des vieilles versions de LMDZ.

Fermeture d'un ticket sur ada :
----------------------------------------
Les simulations où on fait tomber la pluie dans les ascendances ont
tourné.
---------------------------------------------------------------------------
Trac :
======
Demander à Ionela si on peut fermer le tiket sur le nombre de jour de pluie.

Formation :
=========
Du 9 au 11 décembre.
Ehouarn va monter une offre planéto. Prévoir une salle.
Voir qui fait la partie paramétrisations.
Mettre au place les pauses café et repas.
Résoudre l'ambiguité sur la réservation des salles. Vérifier qu'Orchidee laissera la salle.


Pedalons :
========
La semaine prochaine.
On a 10 min pour faire le point
    1/ labellisation
    2/ papier LMDZ soumis + en cours de rédaction.
    3/ les avancées sur le multi atlas
    4/ pub haute résolution, simulations amip/guidé
    5/ bug report : topographie fausse
    6/ changement de mode de fonctionnement des poihl

8/4/2019

Compte rendu du poihl du 8/4/2019

Durée: 1h35

Informations diverses :
=======================
Première simulations HighResMip à 50 km de résolution avec Dynamico et la physique 6A.

Labellisation :
===============
Premier draft disponible et envoyé à Loïc Ségalen
https://docs.google.com/document/d/1vnUFsls8-RV-oK6RjB8Kkqt1fFw4z4beCeod8JfDbm0/edit#
Passer un coup d'aspirateur sur le site WEB
Faire l'inventaire des publications (facile via ADS)
Lettres de soutien : Laurent s'en occupe
Sénégal : Frédéric

Date butoir 30 avril.
Date de finalisation du document 20 avril.
Google doc en cours :
https://docs.google.com/document/d/1vnUFsls8-RV-oK6RjB8Kkqt1fFw4z4beCeod8JfDbm0/edit#

Consolidation LMDZ6 :
=====================
(inchangé)
Vérifier si les problèmes de reproductibilité sur ada avec install_lmdz.sh sont résolus. (F&F) Qui semblaient être là même sans orchidee.
Ionela a un problème de divergence de résultats quand elle ajoute un    diagnostic pour T2m.
Lionel a un problème en séquentiel sur ada. Tourne en debug mais pas en prod (testé sur irene : pas de problème. Laurent)

Problème de diagnostics pour T2m :
----------------------------------
Rappel du principe de correction : quand on détecte des humidités négatives, on interpolle dans le temps T2mmax et rh2min/rh2m, depuis le jour précédent et suivant, puis on corrige T2m moyen journalier en corrigeant
1/96eme de T2m par la correction sur T2mmax.
Pour les mailles mixtes, on ajoute un plus un critère sur l'amplitude diurne max.

Haute résolution + dynamico :
-----------------------------
Dernière chose à régler pour la convergence LMDZ/ico : le couplé lat-lon ne marche pas.
Laurent s'est (ré)installé sur ada.

Contrôle Qualité / trunk / scripts
==================================
(inchangé)
Passer au nouvel orchidee par défaut. Fait en option.
La compilation avec XIOS n'est pas à jour pour Orchidee.

Evolution physique/versions futures :
=====================================
* Jean-Yves travaille sur la supression de l'eau liquide dans les ascendances adiabatiques d'Emanuel.
    Suite aux problèmes identifiés sur la conservation de l'eau, a repris les équations de l'introduction du changement
    liquide-> glace dans l'ascendance adiabatique.
  A une version plus propre avec la nouvelle formulation mais sans élimination de l'eau.
(inchangé)
* Modèle pronostic de densité de poches :
   Débugé dans le intercité
   Les pluies grande échelle sont revenues à la normale.
   C'est prêt à l'emploie 6B.
* Splitting des poches :
   Jean-Yves : toutes les équations sont simples et claires en cours de publi.en test
* Entrainement convectif / nouvel épluchage (à tester)
* Tube dentifrice (à tester)
* Eau avec source méthane
* sur-saturation

Tuning automatique :
====================
Troisièmes vagues de simulations GCM analysée (Frédéric).

Version 6B
==========
(Inchangé)
* Reformulation des flux de masse dans le modèle du thermique (en cours d'ajustement)
* Abderrahmane a intégré les routines de Jean dans une version récente.
Ca tourne. Prêt à être commis.
* Frédéric a défini une nouvelle version 95 niveaux.
Projet PRACE/QUEST déposé pour porter entre autre un modèle MR025 : grille MR dans l'atmosphère et résolution 1/4° océan.
Début de l'allocation avril 2019.
Définir d'ici là, et tuner, une version nouvelle de la nouvelle physique.
* Correction T2m
* entrainement modifié des thermiques.!!
* densité de poches interactive : il faut rerégler la mousson.
* schéma vertical des nuages ? Le code n'est pas encore commis.

Convergence 1D std / Dephy :
============================
(inchangé)
Coding sprint sur la standardisation des format au CNRM jeudi dernier.
Etape 1 : s'assurer d'une chaîne complète côté LMD et CNRM à partir du même fichier arm_cu

Publications / documentation :
==============================
(Inchangé)
La dernière version de la documentation ES-DOC :
https://docs.google.com/spreadsheets/d/1eSpROQVPsYLCh97RNZbeapbVSkaypeeVWYGjZpXDF5Y/edit#gid=766710776
Papier stratocumulus bouclé (Jam) soumis !
Papier bords Est (Fredho), presque bouclé
Papier général LMDZ6A, bien avancé (Fredho)
Frédérique a démarré sur le papier sur le couplage continental.
Gusts/z0 (Traore, figures en cours).
Nuages : Jean-Baptiste s'y remet
Splitting (Nicolas et Jean-Yves)
Convection/poches (Catherine)

tickets trac :
==============
(inchangé)

Tour de table :
===============

Jean-Yves :
-----------
A découvert des commentaires de Yann suggérant des bugs dans
la convection. Va faire le tour.

Laurent :
---------
Riendotre

Abderrahmane :
--------------
Travaille sur les outils de diagnostics.
Ecrit un document openoffice.
A expérimenté le tutorial_ada.tar pour mettre en place une simulation zoomée sur le Maroc.

Adriana :
---------
Travaille sur le document de labellisation.

Ionela :
--------

Frédéric :
----------
Ryen2+

9/9/2019

Compte rendu du poihl du 9/9/2019

Durée: 1h35

Informations diverses :
=======================
Dates de formation LMDZ : du 18 au 22 novembre
                                                 du 9 au 13 décembre.

Retour très positif de la CSOA sur la labellisation de LMDZ . En attente d'une officialisation.

Problème T2m :
==============
Frédérique :
En reprennant t2m, q2m avec Ionela, nous nous sommes rendu compte que les routines que j avais envoyées à Ionela et Laurent fin Mars pour corriger le
bug (nouvelles simulations) n'etaient pas les bonnes.
Il reste un soucis pour des q2m tres legerement negatifs (que je peux regler en mettant mettant à zero ), mais je vais reprendre mes calculs pour essayer
de faire mieux.  Cela en parallele avec le papier.
Ionela :
trouve des T2m non compris entre Ts et T1 dans les cas instables uniquement. vérifier que c'est possible théoriquement.

(inchangé)
Tous les daily ont été modifiés.
Se faire une philo sur la haute fréquence.
    * On pourrait ne pas publier du tout les q2m/T2m.
    * Pour T2m, prendre le min avec le T2max du daily.
    * Ou bien appliquer le même filtre.
    * Ou bien mettre des NaN.
Pour le papier, Ionela a écrit une annexe.
Reste des questions sur les corrections définitives à reprendre et réactiver.
    Comparer à une correction "propre" ?
Mail de Masa suggérant  des valeurs abérrantes mais pas négatives de q2m.

Contrôle Qualité / trunk / scripts
==================================
1+1=2 :
* Laurent a un problème avec la version 3493 (les 3492 et 3494 font 1+1=2 dans
      les tests automatiques).
      Avec LMDZOR sur irene : la 3491 semble OK. Mais choses bizares sur la 3492.
  Frédéric a des problèmes : 2eme mois différent en mensuel et annuel avec les scripts
      automatiques de ada. Version 3522.
      Va faire des tests avec la 3480, 3491 ou branche 6.0.15

* Abderrahmane a corrigé les scripts install_lmdz pour le remplacement des _AUTO_ dans les .xml
    Action Laurent : proposition de gestion des xml dans deflist
* Gestion du install_lmdz.sh
    Celui de Distrib est maintenant un lien logique vers pub
    Celui de BOL va être un lien hard vers pub.
    Prendre l'habitude de faire un svn commit depuis lmdz@machine:WWW/BOL
           (le commit se fait sans mot de passe, en fait sur le compte hourdin).

(inchangé)
* install_lmdz.sh ne marche pas sur irene
* l'état initial zoomé ne se crée pas sur irene avec libigcm.7
* Quand la prochaines version du couplé aura été finalisée sur libigcm (IPSL-CM6.2), faire les modifications suivantes dans install_lmdz.sh :
Passer au nouvel orchidee (svn 5004) par défaut. Fait en option.
La compilation avec XIOS n'est pas à jour pour Orchidee.

Evolution physique/versions futures :
=====================================
(inchangé)
* Plantages avec la population dynamique de poches.
   Plantage robuste au bout de 50ans pouvant expliquer les problèmes
   dans le tuning automatique.
* Jean-Yves travaille sur la supression de l'eau liquide
  dans les ascendances adiabatiques d'Emanuel.
  Modifications commises
  Plantages rapides en 3D.
* Jean-Yves a commencé à regarder la conservation de l'énergie.
* Modèle pronostic de densité de poches :
   Débugé dans le intercité
   Les pluies grande échelle sont revenues à la normale.
   C'est prêt à l'emploie 6B.
* Splitting des poches :
   Jean-Yves : toutes les équations sont simples et claires en cours de publi.en test
* Entrainement convectif / nouvel épluchage (à tester)
* Tube dentifrice (à tester)
* Eau avec source méthane
* sur-saturation

Tuning automatique :
================

Version 6B
==========
(Inchangé)
* Reformulation des flux de masse dans le modèle du thermique (en cours d'ajustement)
* Abderrahmane a intégré les routines de Jean dans une version récente.
Ca tourne. Prêt à être commis.
* Frédéric a défini une nouvelle version 95 niveaux.
Projet PRACE/QUEST déposé pour porter entre autre un modèle
MR025 : grille MR dans l'atmosphère et résolution 1/4° océan.
Début de l'allocation avril 2019.
Définir d'ici là, et tuner, une version nouvelle de la nouvelle physique.
* Correction T2m
* entrainement modifié des thermiques.!!
* densité de poches interactive : il faut rerégler la mousson.
* schéma vertical des nuages ? Le code n'est pas encore commis.

Portage jean-zay par Laurent :
=======================
Portage de install_lmdz.sh.
Ca marche en séquentiel. Fichiers de sorties OK.
Compilation en parallèle OK avec libigcm. Mais plantage avec MPI. Sans doute pas lié à LMDZ. Christian Ethé parle d'un problème de placement des tâches sur les processus.

Convergence 1D std / Dephy :
=======================
(inchangé)
Frédéric a fait les commissions du 1D standard.
Le cas arm_cu marche en format standard. Il s'appelle alors ARMCU/REF
Mais le premier test sur SANDU/REF ne marche pas du premier coup.
Marie-Pierre, Ehouarn et Laurent on finalisé le calendrier vrai dans le 1D.

Publications / documentation :
=======================
Simulations de sensibilité :
----------------------------
Simulations 5A, 5B, 6A sur SSTs climatiques pour alimenter les articles
en cours d'analyse.
Frédérique à ce qu'il lui faut avec les simulations d'Abderrahmane.
Jean-Baptiste a besoin de simulations longues climates longues de sensibilité.
   va laisser des instructions à Abderrahmane pour lancer.

Papiers :
-----------
Papier LMDZ6A resoumis à James.


tickets trac :
=========

Tour de table :
===========

Laurent :
------------
Voir plus haut (jean-zay et 1+1=2)

Abdarrahmane :
----------------------
A essayé de démarrer une simulations avec Zoom. Plantages inexpliqués.
Frédérique voulait un atlas sur la dernière dizaine d'années.

Ionela :
--------
Avait un souci pour sortir les Cosp à haute fréquence.
    On a des fréquence dans les fields au lieu des files
A commencé à refaire les tests de T2m avec les routines de Frédérique.
    Avait des résultats différents. Entre autres parce qu'il y avait deux routines
    identiques dans des fichiers avec des noms différents.
    Pas de gardefou pour ça pour le moment.
A travaillé sur faire des ECDYN et ECPHY.
    En partant de scripts de Lionel. Disponibles dans Boite à Outils LMDZ.
    Va réfléchir à comment rendre ca plus transparent et automatique.
    Notamment sur le choix des analyses ou réanalyses.

Adriana :
------------
Pedalons le 14
Travaille sur RFMIP. Doit faire des analyses sur les runs paleo pour le papier
    de Thibaudt sur les forçages.
    Adriana a réalisé toutes les simulations Paleo RFMIP (simulations de 30 ans)

Jean-Baptiste :
--------------------
Travail sur le papier nuages

Enhouarn :
-------------
3560 OK

Frédéric :
----------
Travaille sur une nouvelle configuration à 95 niveaux :
    * Grille verticale rafinée près de la surface.
    * population dynamique de poches.
    Plante même sans population dynamique de poches.
    Relancé avec des constantes de temps de dissipations plus courtes.
    Plante encore plus souvent avec la population dynamique.
        Est tombé sur une violation de 1+1=2 en essayant de se rapprocher du plantage (cf. plus haut).
    Va relancer des tests avec des configurations plus anciennes pour s'assurer qu'on n'a pas dégradé quelque chose.