Compte-rendus PoiHL 2019

1/7/2019

Compte rendu du poihl du 1/7/2019

55min

Informations diverses :
=======================
Réunion Pedalons positives.
Actions :
travail sur la réécriture de l'interface traceurs (traceur.def et tr_seri).
travail spécifique sur la pérénisation de la physique avec isotopes.

Problème T2m :
==============
En cours de traitement

Contrôle Qualité / trunk / scripts
==================================

Frédéric a vérifié que les problèmes de reproductibilité sur ada avec install_lmdz.sh sont résolus. (F&F)
Fermer le ticket

Ouvrir des tickets pour :
* XIOS ne marche plus depuis la 3509 sur ada.
Malgré les corrections sur les définitions de variables,
Ehouarn a une erreur NetCDF/HDF.
Marche chez Laurent sur ada.
* Corriger (les _auto_ et _reset_) les scripts install_lmdz (Abderrahmane)
* install_lmdz.sh ne marche pas sur irene
* l'état initial zoomé ne se crée pas sur irene avec libigcm.
* Ionela a un problème de divergence de résultats quand elle ajoute un
   diagnostic pour T2m.

(Inchangé)
Quand la prochaines version du couplé aura été finalisée
sur libigcm (IPSL-CM6.2), faire les modifications suivantes dans
install_lmdz.sh :
Passer au nouvel orchidee (svn 5004) par défaut. Fait en option.
La compilation avec XIOS n'est pas à jour pour Orchidee.

Evolution physique/versions futures :
=====================================
(inchangé)
* Jean-Yves travaille sur la supression de l'eau liquide   dans les ascendances adiabatiques d'Emanuel.
  Modifications commises
  Plantages rapides en 3D.
* Jean-Yves a commencé à regarder la conservation de l'énergie.
* Modèle pronostic de densité de poches :
   Débugé dans le intercité
   Les pluies grande échelle sont revenues à la normale.
   C'est prêt à l'emploie 6B.
* Splitting des poches :
   Jean-Yves : toutes les équations sont simples et claires en cours de publi.en test
* Entrainement convectif / nouvel épluchage (à tester)
* Tube dentifrice (à tester)
* Eau avec source méthane
* sur-saturation

Tuning automatique :
====================

Version 6B
==========
(Inchangé)
* Reformulation des flux de masse dans le modèle du thermique (en cours d'ajustement)
* Abderrahmane a intégré les routines de Jean dans une version récente.
Ca tourne. Prêt à être commis.
* Frédéric a défini une nouvelle version 95 niveaux.
Projet PRACE/QUEST déposé pour porter entre autre un modèle
MR025 : grille MR dans l'atmosphère et résolution 1/4° océan.
Début de l'allocation avril 2019.
Définir d'ici là, et tuner, une version nouvelle de la nouvelle physique.
* Correction T2m
* entrainement modifié des thermiques.!!
* densité de poches interactive : il faut rerégler la mousson.
* schéma vertical des nuages ? Le code n'est pas encore commis.

Convergence 1D std / Dephy :
============================
Frédéric a fait les commissions du 1D standard.
Le cas arm_cu marche en format standard. Il s'appelle alors ARMCU/REF
Mais le premier test sur SANDU/REF ne marche pas du premier coup.
Marie-Pierre, Ehouarn et Laurent on finalisé le calendrier vrai dans le 1D.

Publications / documentation :
==============================
Simulations 5A, 5B, 6A sur SSTs climatiques pour alimenter les articles en cours d'analyse.
Frédéric a renvoyé le papier stratocumulus.
         s'apprête à envoyer le papier bords Est.
(inchangé)
Frédérique a démarré sur le papier sur le couplage continental.
  * regarde ce qui vient du couplage comme différence entre CMIP5 et CMIP6.
  * L'intermitence des pluies joue beaucoup sur les moyennes latitudes.
  * Couplage plus fort dans LMDZ6
  * Biais froid l'hivers dans les hautes latitudes.
Jean-Baptiste a commencé à regarder la partie phase mixte et le lien avec la dynamique.
Réfléchir à refaire des simulations 5A/5B climatiques propres.
Papier stratocumulus bouclé (Jam) : major revisions en cours.
La dernière version de la documentation ES-DOC :
https://explore.es-doc.org/cmip6/models
apier bords Est (Fredho), presque bouclé
Papier général LMDZ6A, bien avancé (Fredho)
Gusts/z0 (Traore, figures en cours).
Nuages : Jean-Baptiste s'y remet
Splitting (Nicolas et Jean-Yves)
Convection/poches (Catherine)


tickets trac :
=========

Tour de table :
===========

Ehouarn :
---------
RAS

Adriana :
---------
Essaient de se voir avec le codutil avant les vacances.
La prochaine réunion sera sans doute le 14 octobre.

Jean-Yves :
-----------
A travaillé sur les aérosols pour la réunion Pedalons.

Laurent :
---------
Fait du contrôle qualité. Essaie notamment de finaliser un trusting sur ada. Précise que cela ne concerne que la trunk depuis la convergence avec DYNAMICO. La branche IPSLCM6.0.15 n'a pas le problème
A trouvé un souci dans la définition de la strato.
   En cours d'analyse.
Aide Patricia à débugger les traceurs CO2.

Frédéric :
----------
A créé un nouveau tutorial_ada.tar avec davantage de commentaires et permettant de démarrer une simulation à partir d'une autre automatiquement.
S'est rendu compte que les fichiers de base de relief lus pour LMDZ avaient une résolution verticale de 30m, qui faisait qu'1/3 de Sumatra était
sous le seuil de 1m utilisé pour décider continent ou océan.

10/6/2019

Pas de poihl !

11/2/2019

Compte rendu du poihl du 11/2/2019

Durée: 1h25

Dernière formation LMDZ :
=========================
Décision sur la responsabilité des formations à la réunion LMDZ.

Informations diverses :
=======================
Bizot ada / JeanZay entre été et automne

Consolidation LMDZ6 :
=====================
Bascule compilo 2017.2 sur ada.
    * Fait pour tutorial_ada.tar
      Ancien tutorial stocké sur
~lmdz/WWW/Distrib/tutorial_ada_intel2013.tar
    * Pas prévu de passer à 2017.2 dans libigcm vue la fin de duréee de
vie de ada
      Du coup pas possible de passer l'option d'intialisation à Nan (qui marche en 2017.2) dans les arch.
    * Etape suivante : gérer les jobs multi machines.

Vérifier si les problèmes de reproductibilité sur ada avec
install_lmdz.sh sont résolus. (F&F) Qui semblaient être là même sans orchidee.

(inchangé)
Ionela a un problème de divergence de résultats quand elle ajoute un diagnostic pour T2m.
Lionel a un problème en séquentiel sur ada. Tourne en debug mais pas
     en prod.
     A faire : à tester sur irene.


Problème de diagnostics pour T2m :
----------------------------------

Principe :
Méthode fixée : quand on détecte des humidités négatives,
on interpolle dans le temps T2mmax et rh2min/rh2m, depuis le jour
précédent et suivant, puis en corrigeant T2m en remplacant 1/96eme.

Ionela a envoyé un mail avec un plan de route.
A testé le code de Yann et ça marche. Adapté pour hrsmin.
Reste des questions pour q2m

Frédérique A code une version simplifiée de l'interpolation a 2m. Plante en 3d tourne
sur dice. A aussi essayé d accroître le nbr de niveaux verticaux sur dice
avc l aide de Marie Pierre.. plante a cause de rrtm tourne sinon (?).
Voudrais reproduire en 1d le bug de q2m mais le cas dice standard tourne actuellement en beta-fixe et pas en couple avc orchidée.


Haute résolution + dynamico :
-----------------------------
Branche icoshèdre mergée avec trunk la svn 3412.
Moratoire sur les commissions pour régler les petits détails.
Laurent a testé que la perte de convergence était bien due à la modif
(volontaire) d'Olivier (3459).
La 3460 plante en couplé lon-lat. Peut-être des problème de synchronisiation des initialisations.
Quelques détails à régler pour tourner dans toutes les configurations.
Cosp plante à partir de la 3452 alors que la 3451 tourne.
    1/ vérifier qu'on tourne en local / ada / irene
    2/ vérifier qu'on tourne IOIPSL/XIOS et Cosp


Contrôle Qualité / trunk / scripts
==================================
(inchangé)
Passer au nouvel orchidee par défaut.
        Fait en option.
La compilation avec XIOS n'est pas à jour pour Orchidee.


Evolution physique/versions futures :
=====================================
* Jean-Yves travaille sur le transport des précipitations dans les
     ascendances convective. Tout est prêt sauf un IMPREVU.
     La façon dont on traite la conversion en précipitation n'est pas
     adapté à ce qu'on veut.
     La conversion en précipitation dépendra de la vitesse verticale.
     Compte introduire 2 paramètres qui disent quelle fraction de
     pluie liquide et glace on élimine à chaque niveau.
     En ce moment : 0, 0
     On vise : ~1 , ~0
(inchangé)
* Modèle pronostic de densité de poches :
     Débugé dans le intercité
     Les pluies grande échelle sont revenues à la normale.
     C'est prêt à l'emploie 6B.
* Splitting des poches :
     Jean-Yves : toutes les équations sont simples et claires en cours
de publi.en test
* Entrainement convectif / nouvel épluchage (à tester)
* Tube dentifrice (à tester)
* Eau avec source méthane
* sur-saturation

Tuning automatique :
====================
Frédéric a corrigé la métrique MJO en enlevant les îles.
Se remet sur le tuning 3D.
(inchangés ci-dessous)
Frédéric a retravaillé sur les scripts csv avec Fleur et Najda
Relance des ateliers les mardi après-midi.



Version 6B
==========
(inchangé)
Projet PRACE/QUEST déposé pour porter entre autre un modèle
MR025 : grille MR dans l'atmosphère et résolution 1/4° océan.
Début de l'allocation avril 2019.
Définir d'ici là, et tuner, une version nouvelle de la nouvelle physique.
* Correction T2m
* entrainement modifié des thermiques
* densité de poches interactive : il faut rerégler la mousson.
* schéma vertical des nuages ? Le code n'est pas encore commis.
A compléter ...
Frédéric a commencé des tests à 119 niveaux.
Mais tombe sur le problème que RRTM ne tourne avec plus de 100 niveaux.

Convergence 1D std / Dephy :
============================
(inchangé)
Frédéric a identifié un problème de setup sur bomex.


Publications / documentation :
==============================
Papier stratocumulus bouclé (Jam). Prêt à envoyer.
Papier bords Est (Fredho), presque bouclé
Papier général LMDZ6A, bien avancé (Fredho). Etienne Vignon a écrit sa
partie
     et Nicolas s'en occupe cet après-midi.
Frédérique confirme qu'elle va écrire une publi sur le forçage à la surface
Gusts/z0 (Traore, figures en cours).
Nuages : Jean-Baptiste s'y remet
Splitting (Nicolas et Jean-Yves)
Convection/poches (Catherine)



tickets trac :
==============
#9         Modifications pour une dynamique commune (terre – planete)
#11         Menage sur les prints
#21         "day_ini" dans "create_etat0_limit" et "gcm"
#28         Initialisation problems in cloudth ?
#30         Pb valeurs nulles/non définies sur configs linux
#32         Concervation de la masse des traceurs dans la dynamique
#34         Calving faux en zoome
#44         getin_dump et name
#52         readchlorophyll en OpenMP?
#54         Erreur sur la vorticité en mode zoomé
#55         Constantes non uniformes dans le modèle
#56         Vérifier le calcul des nombres de jours de pluie
#61         Calendrier
#66         Sensibilité au pas de temps de la fermeture stochastique
#67         Traceurs et isotopes.
#70         Conservation de l'énergie avec l'eau
#71         Filtrage de la vorticité
#75         ppm3d non fonctionnel
#76         Sortie epmax
#82         Nouveau calcul de wind10m
#84         Use getin_p instead of getin
#85         Rayonnement dans le 1D
#86         Get rid of "stop" comands in phylmd
#88         routines cldrag
#89         Problèmes grille zoomée :
#90         Nbre d'appel à cdrag buggé?
#92         Incohérence paramètres d'overlap des nuages
#93         Plantage à la ligne de changement de date
#96         Plantage séquentiel Ada



Tour de table :
===============
Ehouarn :
---------
RAS

Jean-Yves :
-----------
déjà dit

Laurent :
---------
déjà dit

Abderrahmane :
--------------
Tests cosp.
Réponse de Jean-Jouhaud sur les schémas verticaux.

Ionela :
--------
atoodee

Lidia :
-------
atoodee

Frédéric :
----------
A fait des simulations auto-enchainée pour les étudiants de M2 avec le script_SIMU du totrial_ada.tar

11/3/2019

Pas de POIHL pour cause d'AMAs

13/5/2019

Réunion du poihl du 13/5/2019

Durée: 1h05

Informations diverses :
==================
Discussion valorisation chez Aria demain mardi.

Codutil :
======
Myriam a rejoint le codutil.
Marion Marchand est partante aussi.

Consolidation LMDZ6 :
=====================
Mettre une page contrôle qualité dans la partie développeurs où on explicite les 5 tests au moins.
(inchangé)
Vérifier si les problèmes de reproductibilité sur ada avec install_lmdz.sh sont résolus. (F&F) Qui semblaient être là même sans orchidee.
Ionela a un problème de divergence de résultats quand elle ajoute un  diagnostic pour T2m.
Lionel a un problème en séquentiel sur ada. Tourne en debug mais pas en prod (testé sur irene : pas de problème. Laurent)

Problème T2m :
--------------------
Ionela finalise son document.
A refait tous les graphes en prenant les mailles affectées seulement.
A passé les scripts à Guillaume pour la mise  en production.
Version du bornage dans les sources.

Version physique : en cours d'analyse.
vérifier si c'est un problème que q2m ne soit pas entre qsurf et q1

Contrôle Qualité / trunk / scripts
========================
(inchangé)
* install_lmdz.sh ne marche pas sur irene
* l'état initial zoomé ne se crée pas sur irene avec libigcm.
Quand la prochaines version du couplé aura été finalisée sur libigcm (IPSL-CM6.2), faire les modifications suivantes dans install_lmdz.sh :
Passer au nouvel orchidee (svn 5004) par défaut. Fait en option.
La compilation avec XIOS n'est pas à jour pour Orchidee.


Evolution physique/versions futures :
=============================
* Jean-Yves travaille sur la supression de l'eau liquide dans les ascendances adiabatiques d'Emanuel.
  A commis une version où on fait précipiter l'eau liquide.
  La plus grande partie des précipitations se crée en phase chaude.
  L'atmosphère est systématiquement plus sèche en 1D.
  Sur cindy dynamo : augmente la différence entre active et supressed.

(inchangé)
* Modèle pronostic de densité de poches :
   Débugé dans le intercité
   Les pluies grande échelle sont revenues à la normale.
   C'est prêt à l'emploie 6B.
* Splitting des poches :
   Jean-Yves : toutes les équations sont simples et claires en cours de publi.en test
* Entrainement convectif / nouvel épluchage (à tester)
* Tube dentifrice (à tester)
* Eau avec source méthane
* sur-saturation

Tuning automatique :
=================
RAS

Version 6B
==========
(Inchangé)
* Reformulation des flux de masse dans le modèle du thermique (en cours d'ajustement)
* Abderrahmane a intégré les routines de Jean dans une version récente.
Ca tourne. Prêt à être commis.
* Frédéric a défini une nouvelle version 95 niveaux.
Projet PRACE/QUEST déposé pour porter entre autre un modèle
MR025 : grille MR dans l'atmosphère et résolution 1/4° océan.
Début de l'allocation avril 2019.
Définir d'ici là, et tuner, une version nouvelle de la nouvelle physique.
* Correction T2m
* entrainement modifié des thermiques.!!
* densité de poches interactive : il faut rerégler la mousson.
* schéma vertical des nuages ? Le code n'est pas encore commis.

Convergence 1D std / Dephy :
========================
Ehouarn a vu avec Marie-Pierre pour mettre le calendrier sur 365 jours.
Le travail était fait sur une version de novembre.
En cours.

Publications / documentation :
========================
Frédérique a démarré sur le papier sur le couplage continental.
  * regarde ce qui vient du couplage comme différence entre CMIP5 et CMIP6.
  * est tombé sur des nombres de jours par mois supérieur à 30.
  * L'intermitence des pluies joue beaucoup sur les moyennes latitudes.
  * Couplage plus fort dans LMDZ6
  * Biais froid l'hivers dans les hautes latitudes.
Jean-Baptiste a commencé à regarder la partie phase mixte et le lien avec la dynamique.
Réfléchir à refaire des simulations 5A/5B climatiques propres.
Papier stratocumulus bouclé (Jam) : major revisions en cours.

(Inchangé)
La dernière version de la documentation ES-DOC :
https://docs.google.com/spreadsheets/d/1eSpROQVPsYLCh97RNZbeapbVSkaypeeVWYGjZpXDF5Y/edit#gid=766710776
apier bords Est (Fredho), presque bouclé
Papier général LMDZ6A, bien avancé (Fredho)
Gusts/z0 (Traore, figures en cours).
Nuages : Jean-Baptiste s'y remet
Splitting (Nicolas et Jean-Yves)
Convection/poches (Catherine)

tickets trac :
=========
(inchangé)

Tour de table :
===========

Jean-Yves :
-----------
Utilise l'instruction tiny pour connaître la plus petite valeur représentable.
a=tiny(a) ! l'argument est utilisé pour regarder le type.
Fait des svn checkout http......phylmd phylmd1 qui crée un répetoire .svn dans le phylmd1 (alors que pour le moment il n'est qu'à la racine).
C'est normal.

Jean-Baptiste :
---------------
Riendotre

Ionela :
--------
Rien d'autre.

Laurent :
---------
Rienadire

Abderrahmane :
--------------------
Travaille sur Cosp2.
Commis. Compile.
Problème au lancement. Sans doute un problème d'intéraction avec XIOS lié à la convergence
avec dynamico.

Frédérique :
---------------
Retraite Orchidee planifiée à la fin du mois.
Idée de passer le schéma temporel en explicite.

Adriana :
-----------
Continue à travailler sur RFMIP.

Ehouarn :
------------
Test 3499 OK

Frédéric :
------------
RAS

14/1/2019

Compte rendu du Poihl du 14/1/2019

(après re-épilation de quelques poihls)

Durée: 1h30

Prochaine formation LMDZ :
==========================
Mettre au propre les échange les échanges de mails / debrief.
Faire un google doc.
Demander à Marie-Pierre d'ajouter les informations pratiques sur l'organisation
(HOWTO)
Marie-Pierre va faire la synthèse du sondage.


Consolidation LMDZ6 :
=====================

Vérifier si les problèmes de reproductibilité sur ada avec
install_lmdz.sh sont résolus. (F&F) Qui semblaient être là même
sans orchidee.

Ionela a un problème de divergence de résultats quand elle ajoute un
    diagnostic pour T2m.

Lionel a un problème en séquentiel sur ada. Tourne en debug mais pas
    en prod.
    A faire : à tester sur irene.

Basculer sur les compilo récents sur ada.
    Déjà fait sur libigcm.
    Frédéric va essayer de faire le passage.


Problème de diagnostics pour T2m :
----------------------------------
éthode fixée : quand on détecte des humidités négatives,
on interpolle dans le temps T2mmax et rh2min/rh2m, depuis le jour
précédent et suivant, puis en corrigeant T2m en remplacant 1/96eme.
Code fortran passé à Yann, interfacé avec XIOS.
1min30 pour traiter T2max sur une simulation AMIP.


Haute résolution + dynamico :
-----------------------------

Branche icoshèdre mergée avec trunk la svn 3412.
7 modifs depuis.
Différents tests de validation.
Avec certaines version de la physique, il y a convergence.
Mais la trunk plante avec RRTM ou avec la lecture des aérosols.
Tests d'interface avec Orchidee (changé pour Dynamico).
Etape ultime : faire tourner cette option avec XIOS.



Contrôle Qualité / trunk / scripts
==================================

install_lmdz.sh marche en local et sur ciclad avec ifort (ancien ~ 2013).
       Il faudrait tourner avec 2018 pour pouvoir initialiser à NaN
       Mais toute la chaine pour lancer est différente.
       Ehouarn regarde si ca marche déjà avec le compilo 2017 utilisé par libigcm.
bascule du lancement parallèle par libigcm de poe vers mpirun.

(inchangé)
Passer au nouvel orchidee par défaut.
       Fait en option.
La compilation avec XIOS n'est pas à jour pour Orchidee.


Version 6B
==========
Projet PRACE déposé pour porter entre autre un modèle
MR025 : grille MR dans l'atmosphère et résolution 1/4° océan.
Début de l'allocation avril 2019.
Définir d'ici là, et tuner, une version nouvelle de la nouvelle physique.
* Correction T2m
A compléter ...

Articulation convection profonde / convection peu profonde
==========================================================
* Modèle pronostic de densité de poches : tests 3D montrent que
    ce ne sont pas les valeurs des densités qui posent probème.
    Jean-Yves va tester en 1D.
    ID : activer la création des poches par les pluies grande échelle.
* Jean-Yves travaille sur le transport des paramétrisations dans les
    ascendances convective. A commencé par changer la fraction de glace et
    d'eau liquide dans les ascendances. Vise à faire moins de précipitations
    glacées (pour faire plaisir à Jean-Philippe L, Kerry E et Françoise G).
    A identifié des accidents dans la conservation de l'eau.
(inchangé)
* Jean-Yves : toutes les équations sont simples et claires en cours de publi.
* Splitting des poches : en test
* Entrainement convectif / nouvel épluchage (à tester)
* Tube dentifrice (à tester)

Evolution physique/versions futures :
=====================================
(inchangés ci-dessous)
* Eau avec source méthane
* sur-saturation

Tuning automatique :
====================
(inchangés ci-dessous)
Frédéric a retravaillé sur les scripts csv avec Fleur et Najda
Relance des ateliers les mardi après-midi.


Convergence 1D std / Dephy :
============================


Publications :
==============
Papier stratocumulus bouclé (Jam)
Papier bords Est (Fredho), presque bouclé
Papier général LMDZ6A, bien avancé (Fredho)
Frédérique confirme qu'elle va écrire une publi sur le forçage à la surface
Gusts/z0 (Traore, figures en cours).
Nuages : Jean-Baptiste s'y remet
Splitting (Nicolas et Jean-Yves)
Convection/poches (Catherine)


Prospective LMDZ :
==================
(inchangé)
Organiser une prospective LMDZ en janvier/février.
Une grosse réunion ?
Des réunions régulières avec visio ?


tickets trac :
==============
#9     Modifications pour une dynamique commune (terre – planete)
#11     Menage sur les prints
#21     "day_ini" dans "create_etat0_limit" et "gcm"
#28     Initialisation problems in cloudth ?
#30     Pb valeurs nulles/non définies sur configs linux
#32     Concervation de la masse des traceurs dans la dynamique
#34     Calving faux en zoome
#44     getin_dump et name
#52     readchlorophyll en OpenMP?
#54     Erreur sur la vorticité en mode zoomé
#55     Constantes non uniformes dans le modèle
#56     Vérifier le calcul des nombres de jours de pluie
#61     Calendrier
#66     Sensibilité au pas de temps de la fermeture stochastique
#67     Traceurs et isotopes.
#70     Conservation de l'énergie avec l'eau
#71     Filtrage de la vorticité
#75     ppm3d non fonctionnel
#76     Sortie epmax
#82     Nouveau calcul de wind10m
#84     Use getin_p instead of getin
#85     Rayonnement dans le 1D
#86     Get rid of "stop" comands in phylmd
#88     routines cldrag
#89     Problèmes grille zoomée :
#90     Nbre d'appel à cdrag buggé?
#91     iflag_con et restartabilité du modèle
#92     Incohérence paramètres d'overlap des nuages
#93     Plantage à la ligne de changement de date
#94     Problème de reproductibilité
#95     Problème de reproductibilité

le #94 doit pouvoir être fermé

14/10/2019

Pas de poihl cause Pedalon

15/4/2019

Compte rendu du poihl du 15/4/2019

Durée: 1h20

Informations diverses :
=======================

Labellisation :
===============
Premier draft disponible et envoyé à Loïc Ségalen
https://docs.google.com/document/d/1vnUFsls8-RV-oK6RjB8Kkqt1fFw4z4beCeod8JfDbm0/edit#
Lidia a récupéré la liste des publications relatives au développement :
www.lmd.jussieu.fr/~lmellul/lmdz_bib.pdf

Coup d'aspirateur en cours sur  le site.
Faire l'inventaire des publications (facile via ADS)
Lettres de soutien : Laurent s'en occupe
Sénégal : Frédéric

Date butoir 30 avril.
Date de finalisation du document 20 avril.
Google doc en cours :
https://docs.google.com/document/d/1vnUFsls8-RV-oK6RjB8Kkqt1fFw4z4beCeod8JfDbm0/edit#


Consolidation LMDZ6 :
=====================
Convergence de LMDZ branche trunk et ico : on y est!

5 tests à passer
* automatique compte LMDZ : OK
* 1D : OK (à intégrer dans les tests automatiques)
* Couplé IPSL-CM6 OK
* tests Ehouarn ada : à vérifier
* test dynamico-physique LMDZ6 : OK

Laurent fait durer un peu le moratoire pour intégrer des modifications venant de la prod CMIP6.


Peut être l'occasion de vérifier les points ci dessous :
(inchangé)
Vérifier si les problèmes de reproductibilité sur ada avec install_lmdz.sh sont résolus. (F&F) Qui semblaient être là même sans orchidee.
Ionela a un problème de divergence de résultats quand elle ajoute un    diagnostic pour T2m.
Lionel a un problème en séquentiel sur ada. Tourne en debug mais pas en prod (testé sur irene : pas de problème. (Laurent)


Problème de diagnostics pour T2m :
----------------------------------

Rappel du principe de correction : quand on détecte des humidités négatives, on interpolle dans le temps T2mmax et rh2min/rh2m, depuis le jour précédent et suivant, puis on corrige T2m moyen journalier en corrigeant
1/96eme de T2m par la correction sur T2mmax.
Pour les mailles mixtes, on ajoute un plus un critère sur l'amplitude diurne max.

Ionela finalise le document.
Il faudra en extraire un digest pour une annexe du papier de Frédérique.

Haute résolution + dynamico :
-----------------------------
Présentation des simulations à 50km à l'EGU.

Contrôle Qualité / trunk / scripts
==================================
* install_lmdz.sh ne marche pas sur irene
* l'état initial zoomé ne se crée pas sur irene avec libigcm.
* Frédéric va passer une option -SCM dans le install_lmdz.sh des tests
    automatiques.

Quand la prochaines version du couplé aura été finalisée sur libigcm (IPSL-CM6.2), faire les modifications suivantes dans install_lmdz.sh :
Passer au nouvel orchidee (svn 5004) par défaut. Fait en option.
La compilation avec XIOS n'est pas à jour pour Orchidee.

Evolution physique/versions futures :
=====================================
* Jean-Yves travaille sur la supression de l'eau liquide dans les ascendances adiabatiques d'Emanuel.
    Coincé sur un problème de compilateur.
    Ne comprends plus rien à la conservation de la masse.
(inchangé)
* Modèle pronostic de densité de poches :
   Débugé dans le intercité
   Les pluies grande échelle sont revenues à la normale.
   C'est prêt à l'emploie 6B.
* Splitting des poches :
   Jean-Yves : toutes les équations sont simples et claires en cours de publi.en test
* Entrainement convectif / nouvel épluchage (à tester)
* Tube dentifrice (à tester)
* Eau avec source méthane
* sur-saturation

Tuning automatique :
====================
Simulation MR issue d'un tuning automatique: a fait 30 ans.

Version 6B
==========
(Inchangé)
* Reformulation des flux de masse dans le modèle du thermique (en cours d'ajustement)
* Abderrahmane a intégré les routines de Jean dans une version récente.
Ca tourne. Prêt à être commis.
* Frédéric a défini une nouvelle version 95 niveaux.
Projet PRACE/QUEST déposé pour porter entre autre un modèle
MR025 : grille MR dans l'atmosphère et résolution 1/4° océan.
Début de l'allocation avril 2019.
Définir d'ici là, et tuner, une version nouvelle de la nouvelle physique.
* Correction T2m
* entrainement modifié des thermiques.!!
* densité de poches interactive : il faut rerégler la mousson.
* schéma vertical des nuages ? Le code n'est pas encore commis.

Convergence 1D std / Dephy :
============================
(inchangé)
Coding sprint sur la standardisation des format au CNRM jeudi dernier.
Etape 1 : s'assurer d'une chaîne complète côté LMD et CNRM à partir
du même fichier arm_cu

Publications / documentation :
==============================
(Inchangé)
La dernière version de la documentation ES-DOC :
https://docs.google.com/spreadsheets/d/1eSpROQVPsYLCh97RNZbeapbVSkaypeeVWYGjZpXDF5Y/edit#gid=766710776
Papier stratocumulus bouclé (Jam) soumis !
Papier bords Est (Fredho), presque bouclé
Papier général LMDZ6A, bien avancé (Fredho)
Frédérique a démarré sur le papier sur le couplage continental.
Gusts/z0 (Traore, figures en cours).
Nuages : Jean-Baptiste s'y remet
Splitting (Nicolas et Jean-Yves)
Convection/poches (Catherine)

tickets trac :
==============
(inchangé)

Tour de table :
===============
Ehouarn :
---------
Renouvellement idris. Plus de places que de candidats.
CT1 OK

Frédérique, Jean-Yves, Adriana, Abderrahmane, Ionela, Laurent, Frédéric :
-------------------------------------------------------------------------
Riendotre

15/7/2019

Compte rendu du poihl du 15/7/2019

1h25

Informations diverses :
=======================


Problème T2m :
==============
Les T2m et T2m_max daily sont publiés.
Si on n'a pas RHmin, on ne publie pas.
Les moyennes mensuelles ne seront pas corrigées.
Reste à traiter les instantannés.


Contrôle Qualité / trunk / scripts
=========================
Ouvrir des tickets pour :
* XIOS ne marche plus depuis la 3509 sur ada.
Malgré les corrections sur les définitions de variables, Ehouarn a une erreur NetCDF/HDF.
Marche chez Laurent sur ada.
* Corriger (les _auto_ et _reset_) les scripts install_lmdz (Abderrahmane)
* install_lmdz.sh ne marche pas sur irene
* l'état initial zoomé ne se crée pas sur irene avec libigcm.
* Ionela a un problème de divergence de résultats quand elle ajoute un diagnostic pour T2m.

(Inchangé)
Quand la prochaines version du couplé aura été finalisée sur libigcm (IPSL-CM6.2), faire les modifications suivantes dans install_lmdz.sh :
Passer au nouvel orchidee (svn 5004) par défaut. Fait en option.
La compilation avec XIOS n'est pas à jour pour Orchidee.

Evolution physique/versions futures :
=============================
Plantages avec la population dynamique de poches.
   Plantage robuste au bout de 50ans pouvant expliquer les problèmes dans le tuning automatique.

(inchangé)
* Jean-Yves travaille sur la supression de l'eau liquide dans les ascendances adiabatiques d'Emanuel.
  Modifications commises
  Plantages rapides en 3D.
* Jean-Yves a commencé à regarder la conservation de l'énergie.
* Modèle pronostic de densité de poches :
   Débugé dans le intercité
   Les pluies grande échelle sont revenues à la normale.
   C'est prêt à l'emploie 6B.
* Splitting des poches :
   Jean-Yves : toutes les équations sont simples et claires en cours de publi.en test
* Entrainement convectif / nouvel épluchage (à tester)
* Tube dentifrice (à tester)
* Eau avec source méthane
* sur-saturation

Tuning automatique :
================

Version 6B
==========
(Inchangé)
* Reformulation des flux de masse dans le modèle du thermique (en cours d'ajustement)
* Abderrahmane a intégré les routines de Jean dans une version récente.
Ca tourne. Prêt à être commis.
* Frédéric a défini une nouvelle version 95 niveaux.
Projet PRACE/QUEST déposé pour porter entre autre un modèle
MR025 : grille MR dans l'atmosphère et résolution 1/4° océan.
Début de l'allocation avril 2019.
Définir d'ici là, et tuner, une version nouvelle de la nouvelle physique.
* Correction T2m
* entrainement modifié des thermiques.!!
* densité de poches interactive : il faut rerégler la mousson.
* schéma vertical des nuages ? Le code n'est pas encore commis.

Convergence 1D std / Dephy :
========================
(inchangé)
Frédéric a fait les commissions du 1D standard.
Le cas arm_cu marche en format standard. Il s'appelle alors ARMCU/REF
Mais le premier test sur SANDU/REF ne marche pas du premier coup.
Marie-Pierre, Ehouarn et Laurent on finalisé le calendrier vrai dans le 1D.

Publications / documentation :
========================
Simulations de sensibilité :
----------------------------
Simulations 5A, 5B, 6A sur SSTs climatiques pour alimenter les articles
en cours d'analyse.
Frédérique à ce qu'il lui faut avec les simulations d'Abderrahmane.
Jean-Baptiste a besoin de simulations longues climates longues de sensibilité.
   va laisser des instructions à Abderrahmane pour lancer.

Papiers :
---------
Frédéric a envoyé une version complète du papier pour relecture :
http://www.lmd.jussieu.fr/~hourdin/TMP/ARTICLES_LMDZ_ENCOURS/LMDZ6A_v3.pdf

Frédérique va envoyer un plan à un certain nombre d'auteurs clé.
   Un résultat pour le tuning : les flux au sommet sont très peu sensible aux choix en surface.
   Le réglage choisi dans l'atmosphère n'est pas forcément idéal pour la surface.
   A refait une simu sans les bosquets qui ne change rien.
   A relancé une simulation sans oroTKE.
   Intérêt d'orchidee : sol plus réaliste.
   Biais chaud l'été dans les latitudes moyennes. Lié à un biais humide.
   Tibet : le modèle de sol seul est mieux. Rétroaction qui crée un biais froid en couplé.
   Discuter des changement de fonctionement des zones semi arides.

Contacter Etienne pour voir comment on gère sa contribution entre le papier de Frédérique 

Jean-Baptiste a fait une première introduction pour décrire tout ce qui a changé
   A regardé la biblio sur les nuages dans les papiers CMIP5
   Pense mettre des cas 1D. Typiquement arm_cu et toga en amont des résultats 3D.
   Va montrer les CRE en régimes dynamique
   Coupes zonales pour montrer les changements de phase.
        Regarder l'impact de la phase en guidée et en pas guidé.
   Va sans doute inclure les diagnostics de Dimitra. En rejouant 5A/5B
   A rajouté une partie polaire.

(inchangé)
Frédéric a renvoyé le papier stratocumulus et envoyé le papier Bords Est.
Frédérique a démarré sur le papier sur le couplage continental.
  * regarde ce qui vient du couplage comme différence entre CMIP5 et CMIP6.
  * L'intermitence des pluies joue beaucoup sur les moyennes latitudes.
  * Couplage plus fort dans LMDZ6
  * Biais froid l'hivers dans les hautes latitudes.
Jean-Baptiste a commencé à regarder la partie phase mixte et le lien avec la dynamique.
Réfléchir à refaire des simulations 5A/5B climatiques propres.
Papier stratocumulus bouclé (Jam) : major revisions en cours.
La dernière version de la documentation ES-DOC :
https://explore.es-doc.org/cmip6/models
apier bords Est (Fredho), presque bouclé
Papier général LMDZ6A, bien avancé (Fredho)
Gusts/z0 (Traore, figures en cours).
Nuages : Jean-Baptiste s'y remet
Splitting (Nicolas et Jean-Yves)
Convection/poches (Catherine)


tickets trac :
=========


Tour de table :
===========

Jean-Baptiste :
-------------------
Un doctorant non pris avec Jean-Louis.
ANR Artique avec le Latmos qui a échoué.
Fin de thèse de Florentin.
    A fait émergé l'importance de la dissipation horizontale sur la pluie sur le pourtour Antartique.

Ehouarn :
---------
3540 OK
Clôture de heat, ANR menée par Thomas Dubos autour de Dynamic.
Haute résolution, physique planétaire au 1/8e de degré.
Volet paléo qui s'est perdu en cours de route.
Finalisation de Dynamico terrestre.
Dynamico tourne sur GPU avec des performances très bonnes.
Sébastien Fromang avait identifié qu'il fallait diminuer le pas de temps de la physique à haute résolution.
Distiller la tendance physique à l'échelle du pas de temps dynamique fonctionne..
Papier Saturne accepté https://arxiv.org/abs/1811.01250
Simon Cabane a finaliser ses diagnostics en spectre d'énergie qui vont donner lieu à publication.

Frédérique :
----------------
A essayé de s'occuper des simulations en temps réel sur le Sirta.
   Simulations faites sur climserv avec workflow géré par le Sirta.
   On va reprendre les observations ici.
   Artem va reprendre ça et inclure un simulateur Lidar vu du bas.
Laurent Fairhead va tout reprendre pour faire un outil clé en main pour la régionalisation et le temps réel.

Frédéric :
----------
Bosse sur les articles et le tuning.

17/12/2019

Compte rendu du poihl du 17/12/2019

Points saillants à discuter pouvant donner lieu à travail collectif.
--------------------------------------------------------------------

Jean-zay :
   Problèmes avec netcdf/ferret.
   Changement d'environnement : la commande "module" a changé; changement d'environnement par défaut.
   Frédéric va tester une installation pour lancer un test pour Jean-Yves.

   En direct : modification des commandes module dans tutorial_prod.tar et install_lmdz.sh
       Modification des modules dans le arch.env de LMDZ (Ehouarn)
   Action :
   * Laurent : ouverture d'un tiket pour se modifier install_lmdz.sh sur la question de la gestion des arch.env

Articles :
   Frédéric a renvoyé le papier Bords Est.
   Renvoie le papier LMDZ6A cette semaine
   A refait les figures du papier IPSL-CM6A-LR

Formation :
   Debrief
   5 réponses au sondage de satisfaction :
      pas assez de temps sur les tutorials.
      Equipe pas assez dispo pendant les TD
      Planetos très contents des sessions parallèles.
   Une demande pour que ce soit plus interactif le 2eme et le 3eme jour.
   6 personnes sont intéressées par une seconde session.
      On viserait une seconde session en mai-juin.
      Laurent relance les 6 personnes concernées en priorité.
   Regret d'Ehouarn : pas avancé sur la documentation.
   Frédéric et Jean-Baptiste vont faire une mini formation à Toulouse les 20-21 janvier.
      Parmi les buts : échanger sur l'enseignement avec les modèles (edu_earth, edu_planet) et l'informatique (développement, doc,programmation lettrée).

install_lmdz.sh
   Ehouarn a mis à jour l'utilisation de -xios.
   Marche bien.
   Relancer la question des "_AUTO" des .xml

Prochaine réunion pedalons :
   Discussion sur la proposition du CODUTIL.
   Guidé par des questions et des choses à faire avancer plutôt que par une liste de présentations.
   On peut éventuellement rester dans cet esprit jusqu'à la réunion elle même.
   Pour l'information de LMDZ vis-à-vis du reste, on n'a pas d'idée précise.
   On peut prendre 15 min pour parler de cette question : savoir ce que Pedalons attend comme info. Lors de ces réunions ou sous une autre forme.

17/6/2019

Compte rendu du poihl du 17/6/2019
1h30

Informations diverses :
=======================
Colloque RFMIP la semaine dernière à Princeton, JLD y était, a présenté des résultats du modèle 
Colloque CFMIP: 30/09 - 04/10

Prochaine réunion Pedalons :
============================
Le 24 juin, salle de réunion du LMD, le thème principal sera la remise à plat du traitement des traceurs et l’implémentation "durable" des 
isotopes de l'eau dans LMDZ.
Des courtes présentations, pour lancer les discussions, sont annoncées pour l'instant par Camille Risi (LMD), Slimane Bekki (LATMOS), Thibaut 
Lurton (IPSL), David Cugnet (LMD/LATMOS), Cécile Agosta (LSCE).
JYG s'inquiète de la paramétrisation séparée du transport et lessivage des aérosols. Prévoir présentation?

octobre sur la convection: une préférence exprimée pour le 7 octobre ?
Pour l'instant 1 personne a exprimé sa préférence pour 7 oct. On parlera du choix de la date (et peut-être même tranchera) le 24 juin.

en réserve : configurations zoomées

Problème T2m :
==============
Traité par Guillaume. Reste la question sur la publication de tasmax dans les simulations où il manque rhmin (DCPP et RFMIP). Ne pas les 
publier du tout ou utiliser une autre méthode? Ionela a des différences de 5 degrés entre les deux méthodes possibles quand elle regarde sur un historical.

Contrôle Qualité / trunk / scripts
==================================

* l'état initial zoomé ne se crée pas sur irene avec libigcm: serait un problème mémoire/machine plutôt qu'un pb LMDZ, en relançant le 
même job ça marche

Mise en place du trusting sur ada. Incohérences entre l'environnement 2018 et libIGCM, nécessite de petis ajustements.
Mise en place d'un bench automatique à chaque comission: lancement d'un install_lmdz.sh et envoi d'un message à lmdz-commit. Pour l'instant 
teste seulement l'ancienne physique


(inchangé)
XIOS ne marche plus depuis la 3509 sur ada.
Malgré les corrections sur les définitions de variables, Ehouarn a une erreur NetCDF/HDF.
Marche chez Laurent sur ada.

Corriger (les _auto_ et _reset_) les scripts install_lmdz (Abderrahmane).

* install_lmdz.sh ne marche pas sur irene
Quand la prochaines version du couplé aura été finalisée sur libigcm (IPSL-CM6.2), faire les modifications suivantes dans install_lmdz.sh :
Passer au nouvel orchidee (svn 5004) par défaut. Fait en option.
La compilation avec XIOS n'est pas à jour pour Orchidee.

Vérifier si les problèmes de reproductibilité sur ada avec install_lmdz.sh sont résolus. (F&F) Qui semblaient être là même sans orchidee.
Ionela a un problème de divergence de résultats quand elle ajoute un diagnostic pour T2m.
Lionel a un problème en séquentiel sur ada. Tourne en debug mais pas en prod (testé sur irene : pas de problème. Laurent)


Evolution physique/versions futures :
=====================================
* Jean-Yves a continué à regarder la conservation de l'énergie.

(inchangé)
* Jean-Yves travaille sur la supression de l'eau liquide dans les ascendances adiabatiques d'Emanuel.
   Modifications commises
   Plantages rapides en 3D.
* Modèle pronostic de densité de poches :
    Débugé dans le intercité
    Les pluies grande échelle sont revenues à la normale.
    C'est prêt à l'emploie 6B.
* Splitting des poches :
    Jean-Yves : toutes les équations sont simples et claires en cours de 
publi.en test
* Entrainement convectif / nouvel épluchage (à tester)
* Tube dentifrice (à tester)
* Eau avec source méthane
* sur-saturation

Tuning automatique :
====================


Version 6B
==========
(Inchangé)
* Reformulation des flux de masse dans le modèle du thermique (en cours 
d'ajustement)
* Abderrahmane a intégré les routines de Jean dans une version récente.
Ca tourne. Prêt à être commis.
* Frédéric a défini une nouvelle version 95 niveaux.
Projet PRACE/QUEST déposé pour porter entre autre un modèle
MR025 : grille MR dans l'atmosphère et résolution 1/4° océan.
Début de l'allocation avril 2019.
Définir d'ici là, et tuner, une version nouvelle de la nouvelle physique.
* Correction T2m
* entrainement modifié des thermiques.!!
* densité de poches interactive : il faut rerégler la mousson.
* schéma vertical des nuages ? Le code n'est pas encore commis.

Convergence 1D std / Dephy :
============================
(inchangé)
Calendrier 365 jour OK mais corriger le jour du départ dans les run.def

Publications / documentation :
==============================
JB regarde l'évolution des nuages sur 5A/5B/6A pour demander des avis. Content quand il regarde la phase des nuages en moyennes zonales. 
Prévoir tests de sensibilité en guidé

(inchangé)

Frédérique a démarré sur le papier sur le couplage continental.
   * regarde ce qui vient du couplage comme différence entre CMIP5 et CMIP6.
   * L'intermitence des pluies joue beaucoup sur les moyennes latitudes.
   * Couplage plus fort dans LMDZ6
   * Biais froid l'hivers dans les hautes latitudes.
Jean-Baptiste a commencé à regarder la partie phase mixte et le lien 
avec la dynamique.
Réfléchir à refaire des simulations 5A/5B climatiques propres.
Papier stratocumulus bouclé (Jam) : major revisions en cours.
La dernière version de la documentation ES-DOC :
https://explore.es-doc.org/cmip6/models
apier bords Est (Fredho), presque bouclé
Papier général LMDZ6A, bien avancé (Fredho)
Gusts/z0 (Traore, figures en cours).
Nuages : Jean-Baptiste s'y remet
Splitting (Nicolas et Jean-Yves)
Convection/poches (Catherine)


Tickets trac :
==============

On a séparé les tickets à examiner en plusieurs catégories:

Tickets généraux (ou éternels) :
--------------------------------
#9 	Modifications pour une dynamique commune (terre – planete)
#11 	Ménage sur les prints
         (en cours + rajouter un test sur omp_master pour diminuer le
         volume d'impression)
#32 	Conservation de la masse des traceurs dans la dynamique
         (Ehouarn dessus)
#52 	readchlorophyll en OpenMP?
         (à fermer)
#55 	Constantes non uniformes dans le modèle
#84 	Use getin_p instead of getin
         (Laurent prend)
#86 	Get rid of "stop" comands in phylmd
         (fait pour phylmd, reste les sous-répertoires)
#88 	routines cldrag (2 routines existent, cdrag.F90/clcdrag.F90,
         appels à clcdrag commentés)
         (clcdrag dans obsolete et fermeture ticket)
#61 	Calendrier
#66 	Sensibilité au pas de temps de la fermeture stochastique
#67 	Traceurs et isotopes.
         (sujet du prochain PEDALONS)

Tickets plantages :
-------------------
#76 	Sortie epmax (« L'écriture de la variable epmax_diag rajoutée dans 
la révision r2481 fait planter le modèle dans les routines d'écriture. 
Les valeurs du champ ne sont pas représentables par un real4 dans 
netcdf. L'initialisation à 0 de la variable ne résoud pas le problème. 
On soupçonne un débordement de tableau quelque part. »)
         Ionela regarde?
#89 	Problèmes grille zoomée (« Positions des zooms qui font planter le 
modèle Plantages de grilles Centre du zoom pas là où on veut. Et venant 
du ticket #74 si on passe de 1. à 1.+epsilon, on décale d'un quart de 
point de grille. »)
#90 	Nbre d'appel à cdrag buggé?
         (Ionela pense qu'il s'agit du double appel pour la calcul de t2m
         sur continents)
#93 	Plantage à la ligne de changement de date
#96 	Plantage séquentiel en prod sur Ada
         (pas de plantage sur irene)

Tickets « erreurs/incohérences » :
----------------------------------
#21 	"day_ini" dans "create_etat0_limit" et "gcm"
#34 	Calving faux en zoomé
#44 	getin_dump et name
#54 	Erreur sur la vorticité en mode zoomé
#70 	Conservation de l'énergie avec l'eau (comments)
#71 	Filtrage de la vorticité ( « Choses bizarres dans le calcul » )
#75 	ppm3d non fonctionnel
#82 	Nouveau calcul de wind10m
#85 	Rayonnement dans le 1D
#92 	Incohérence paramètres d'overlap des nuages

Tickets « Initialisations » :
-----------------------------
#28 	Initialisation problems in cloudth ?(The new cloud parametrisation, 
cloudth, crashes on line 262
qsatbef= R2ES * FOEEW(Tbef,zdelta)/paprs(ind1,ind2)
with a
DEXP -> ARG > 709.78271 : ARG=7.8007506527415148D+02 PROG=cloudth 
message, temporary fix r1428)
#30 	Pb valeurs nulles/non définies sur configs linux

Tickets « vérifications » :
---------------------------
#56 	Vérifier le calcul des nombres de jours de pluie
         Ionela a vérifié, elle fait le commit et ferme le ticket

Les tickets "erreurs et incohérences" et "initialisations" seront 
traités la prochaine fois par manque de temps (on demande des précisions 
aux personnes concernées)

18/11/2019

Compte rendu du poihl du 18/11/2019

Points saillants à discuter pouvant donner lieu à travail collectif.

Jean-zay : Semble résolu (y compris aquaplanètes de Max)
   Jupyter notebook disponible

Articles :
   Frédérique soumet le papier surface avant fin décembre
   Article LMDZ6A :
      Besoin d'un paragraphe micro-physique (aérosols)
      Diagnostics MJO ESMvaltool
      -> Abderrahmane regarde si il peut les activer

PC formation :
   Tenter de mettre les fichiers nécessaires dans l'image modnumOA
   -> Fait pendant le poihl
   Test des TP
   Attention au zoom qui plante !
   10 Français + 4 anglais + 14 qui ne savent pas. Les 2/3 n'utilisent pas LMDZ
   Inscriptions supplémentaires : Antony et Najda
   Remarque sur les TP trop bien ficelés.

Vérifier que l'update de la version d'orchidee dans install_lmdz.sh marche toujours: A FAIRE

Laurent: (26/11/2019) Dans l'état actuel, et l'update vers la version 5004 d'ORCHIDEE, ça fait ce qu'on pense que ça doit faire: la version d'ORCHIDEE distribuée dans notre modipsl.tar est "logée" sur la trunk d'ORCHIDEE, la version 5004 aussi, donc l'update se fait bien comme il faut sur la trunk.
Fréderique: OK. Mais il reste la question de la compilation avec les clés CPP, non ?
Laurent: Oui mais faut réfléchir à ce qu'on veut automatiser ...

Programmation de la formation et intervenants
   Qui remplace Nicolas Rochetin ?
   -> Frédéric si personne d'autre. En attente de la réponse de Marine.

Le paysage des choses à faire en tuning 3D
    projets : QUEST (Prace, calcule européen)
                 * Pratiquer le tuning
                     VLR/LR, forcé/couplé, climat/guidé
                 * ECS
                 * Version MR025 (256x256 Orca 0.25) : quelle resolution verticale/ physique ?
              ERC Myriam Khodri
                 Basse résolution. Amélioration de la convection.

    configurations : VLR (96x95), LR, MR
                     L56, L79, L95
                     6A, 6Acv = (popdyn, elimination des precip, correction des bugs)
    Objectifs : * ECS
                * précipitations tropicales
                * Tuning surfaces continentales (sujet M2).

    Convection : tuning de la version actuelle
                 Les améliorations récentes
                    * population dynamique de poches
                    * élimination des précipitations
                    * splitting
                 Tests de Catherine pour comprendre les changements / 5B
    -> Mise en place de réunion convection/tuning en visio avec Catherine.
           la première jeudi.

Plantage LMDZOR guidé en température de surface tous les pas de temps.
       Tourne par période de 1 mois mais plante en annuel. (Adriana)

18/3/2019

Compte rendu du Poihl du 18/3/2019

Durée: 1h35

Informations diverses :
=======================


Prospective LMDZ :
==================
Mettre les slides de notes en google doc (Frédéric).
Prochaine réunion PEDALONS 1er Avril à 9:30 en salle Gobi.
PEDALONS pour Point Etendus des Développeurs et Amis de LMDZ  (Outils, Numérique, Science)
Faire une relance au poihl prochain.

Labellisation :
===============
Date butoir 30 avril.
Date de finalisation du document 20 avril.
Google doc en cours :
https://docs.google.com/document/d/1Gmi3pJiuf4g-jHL3sB1HW-blzJnVycg__J_6nxSSNqk/edit#heading=h.lrghqtrqxdxn


Sondage :
---------
Presque tout le monde a répondu. Manque la planéto. 96 utilisateurs (manque une dizaine du Locean).
Frédéric doit relancer le Sénégal.
Laurent a récupéré les adresses mails de tous ceux qui on suivi la formation.
171 adresses mail dont 36 n'étaient plus valides.


Remise à plat des listes mails :
================================
Laurent a mis à jour la page des listes sur le site web http://lmdz.lmd.jussieu.fr/communication/listes-de-diffusion
et a commencé à mettre à jour les listes.


Consolidation LMDZ6 :
=====================
(inchangé)
Vérifier si les problèmes de reproductibilité sur ada avec install_lmdz.sh sont résolus. (F&F) Qui semblaient être là même sans orchidee.
Ionela a un problème de divergence de résultats quand elle ajoute un    diagnostic pour T2m.
Lionel a un problème en séquentiel sur ada. Tourne en debug mais pas    en prod (testé sur irene : pas de problème. Laurent)


Problème de diagnostics pour T2m :
----------------------------------

Rappel du principe de correction : quand on détecte des humidités négatives,
on interpolle dans le temps T2mmax et rh2min/rh2m, depuis le jour précédent et suivant, puis on corrige T2m moyen journalier en corrigeant 1/96eme de T2m par la correction sur T2mmax.

Ionela a appliqué les corrections sur amip, historical et pi-control.
A identifié qu'il restait des points aberrants en température quand on ne sélectionne que sur les humidités négatives, du fait de la pondération des mailles océan/continent sur les mailles mixte.
Du coup, on va utiliser les deux critères : températures et extrêmes OU humidité négative.
Le point le plus touché par les humidités négatives est touché presque une fois par mois.
Attention : il faut tourner en batch pour ne pas planter.
Finalise une première version de la note pour mercredi.


Haute résolution + dynamico :
-----------------------------
Laurent a commis des modifications de Yanna :
1/ une version 3467 qui converge avec les anciennes versions
2/ la 3468 ne converge pas (volontairement)
Tests de la nuit + test Ehouarn + bucket irene OK
Encore un problème en couple.
Moratoire sur les sources maintenu.


Contrôle Qualité / trunk / scripts
==================================
(inchangé)
Passer au nouvel orchidee par défaut. Fait en option.
La compilation avec XIOS n'est pas à jour pour Orchidee.


Evolution physique/versions futures :
=====================================

* Jean-Yves a présenté aux AMAs la supression de l'eau liquide dans les ascendances adiabatiques d'Emanuel. Jolis résultats. Toujours un problème de conservation de l'eau.

(inchangé)
* Modèle pronostic de densité de poches :
   Débugé dans le intercité
   Les pluies grande échelle sont revenues à la normale.
   C'est prêt à l'emploie 6B.
* Splitting des poches :
   Jean-Yves : toutes les équations sont simples et claires en cours de publi.en test
* Entrainement convectif / nouvel épluchage (à tester)
* Tube dentifrice (à tester)
* Eau avec source méthane
* sur-saturation

Tuning automatique :
====================
Beaucoup de résultats présentés aux AMAs.
Troisièmes vagues de simulations GCM en cour (Frédéric).

Version 6B
==========
- Abderrahmane a intégré les routines de Jean dans une version récente.
Ca tourne. Prêt à être commis.
- Frédéric a défini une nouvelle version 95 niveaux.
(Inchangé)
Projet PRACE/QUEST déposé pour porter entre autre un modèle
MR025 : grille MR dans l'atmosphère et résolution 1/4° océan.
Début de l'allocation avril 2019.
Définir d'ici là, et tuner, une version nouvelle de la nouvelle physique.
* Correction T2m
* entrainement modifié des thermiques.
* densité de poches interactive : il faut rerégler la mousson.
* schéma vertical des nuages ? Le code n'est pas encore commis.

Convergence 1D std / Dephy :
============================
Coding sprint sur la standardisation des format au CNRM Jeudi prochain.

Publications / documentation :
==============================
ES-DOC.
Papier stratocumulus bouclé (Jam) soumis !
Papier bords Est (Fredho), presque bouclé
Papier général LMDZ6A, bien avancé (Fredho)
Frédérique a démarré sur le papier sur le couplage continental.
Gusts/z0 (Traore, figures en cours).
Nuages : Jean-Baptiste s'y remet
Splitting (Nicolas et Jean-Yves)
Convection/poches (Catherine)



tickets trac :
==============
(inchangé)


Tour de table :
===============

Abderrahmane :
--------------
A travaillé sur les diagnostics sur le patchwork.
   - sécurisation de certains diagnostics
   - ajouter d'autres. Notamment nuages pour Jean-Baptiste
   - finaliser l'interface avec la version C-ESM-EP des atlas (avec Frédéric).
Se pose la question de faire une svn dans la partie BOL.
Commissions en attente :
1/ nouvelle version Cosp
2/ modifications de Jean-Jouhaud

Laurent, Ioneal, Frédéric, Adriana :
------------------------------------
Ondejatoudi

2/12/2019

Compte rendu du poihl du 2/12/2019

Points saillants à discuter pouvant donner lieu à travail collectif.
--------------------------------------------------------------------

Jean-zay :
   Jean-Yves voudrais mener au bout l'utilisation de tutorial_prod.tar sur jean-zay.
   Lidia est en train de transmettre des données de ada sur jean-zay.

Articles :
   Frédéric a renvoyé le papier Bords Est.
   Travaille sur les corrections du papier LMDZ6A.
     Fusioner les contributions Oliver et Jean-Baptiste sur les nuages
     Diags à reprendre
   A refait les figures du papier IPSL-CM6A-LR
     Va essayer dans sortir une version Antarctique pour la thèse de Florentin

Formation :
   Ionela a regardé le fonctionnement de install_lmdz.sh en lien avec l'ennoncé. Ca marche.
   Abderrahmane fait des tests sur son PC
   Lidia va faire le test de la partie "physique" et la partie "nudging"
   10 Français + 4 anglais + 14 qui ne savent pas. Les 2/3 n'utilisent pas LMDZ
   Remarque sur les TP trop bien ficelés.
Vérifier que l'update de la version d'orchidee dans install_lmdz.sh marche. En cours

Le paysage des choses à faire en tuning 3D
   A lancé une nouvelle vague.
   Tout a tourné. 240 simulations de 2 ans. A calculé les métriques.

2/9/2019

Compte rendu du poihl du 2/9/2019

1h40

Informations diverses :
=================
C'est la rentrée.
Les neurones apaisés essaient de se rappeler ce qu'on avait dit en termes de modification du poihl.
Ehouarn et Ionela on évoqué l'idée d'avoir 1 poihl sur 2 où on avance sur des choses techniques.
Avoir de temps en temps un sujet pour le poihl ?
Avec l'idée de faire venir des intervenants pertinents.

Problème T2m :
==============
Tous les daily ont été modifiés.
Se faire une philo sur la haute fréquence.
    * On pourrait ne pas publier du tout les q2m/T2m.
    * Pour T2m, prendre le min avec le T2max du daily.
    * Ou bien appliquer le même filtre.
    * Ou bien mettre des NaN.
Pour le papier, Ionela a écrit une annexe.
Reste des questions sur les corrections définitives à reprendre et réactiver.
    Comparer à une correction "propre" ?
Mail de Masa suggérant  des valeurs abérrantes mais pas négatives de q2m.

Contrôle Qualité / trunk / scripts
==================================
Ouvrir des tickets pour :
* XIOS remarche sur ada (Ehouarn). Ca ne marchait pas à cause des xml
   parce que le niveau de sorties 1 était trop élevés.
* Corriger (les _auto_ et _reset_) les scripts install_lmdz (Abderrahmane)
* install_lmdz.sh ne marche pas sur irene
* l'état initial zoomé ne se crée pas sur irene avec libigcm.7

Il faudrait s'attaquer au problème des AUTO dans DefList/*xml.
    libigcm vient chercher les xml là pour éviter des problèmes de compatibilité.
    Mais on voudrait des valeurs par défaut dans DefList ...

(Inchangé)
Quand la prochaines version du couplé aura été finalisée
sur libigcm (IPSL-CM6.2), faire les modifications suivantes dans
install_lmdz.sh :
Passer au nouvel orchidee (svn 5004) par défaut. Fait en option.
La compilation avec XIOS n'est pas à jour pour Orchidee.

Evolution physique/versions futures :
============================
(inchangé)
* Plantages avec la population dynamique de poches.
   Plantage robuste au bout de 50ans pouvant expliquer les problèmes
   dans le tuning automatique.
* Jean-Yves travaille sur la supression de l'eau liquide
  dans les ascendances adiabatiques d'Emanuel.
  Modifications commises
  Plantages rapides en 3D.
* Jean-Yves a commencé à regarder la conservation de l'énergie.
* Modèle pronostic de densité de poches :
   Débugé dans le intercité
   Les pluies grande échelle sont revenues à la normale.
   C'est prêt à l'emploi 6B.
* Splitting des poches :
   Jean-Yves : toutes les équations sont simples et claires en cours de publi.en test
* Entrainement convectif / nouvel épluchage (à tester)
* Tube dentifrice (à tester)
* Eau avec source méthane
* sur-saturation

Tuning automatique :
================

Version 6B
==========
(Inchangé)
* Reformulation des flux de masse dans le modèle du thermique (en cours d'ajustement)
* Abderrahmane a intégré les routines de Jean dans une version récente.
Ca tourne. Prêt à être commis.
* Frédéric a défini une nouvelle version 95 niveaux.
Projet PRACE/QUEST déposé pour porter entre autre un modèle
MR025 : grille MR dans l'atmosphère et résolution 1/4° océan.
Début de l'allocation avril 2019.
Définir d'ici là, et tuner, une version nouvelle de la nouvelle physique.
* Correction T2m
* entrainement modifié des thermiques.!!
* densité de poches interactive : il faut rerégler la mousson.
* schéma vertical des nuages ? Le code n'est pas encore commis.

Convergence 1D std / Dephy :
=======================
(inchangé)
Frédéric a fait les commissions du 1D standard.
Le cas arm_cu marche en format standard. Il s'appelle alors ARMCU/REF
Mais le premier test sur SANDU/REF ne marche pas du premier coup.
Marie-Pierre, Ehouarn et Laurent on finalisé le calendrier vrai dans le 1D.

Publications / documentation :
=======================
Simulations de sensibilité :
------------------------------------
Simulations 5A, 5B, 6A sur SSTs climatiques pour alimenter les articles en cours d'analyse.
Frédérique a ce qu'il lui faut avec les simulations d'Abderrahmane.
Jean-Baptiste a besoin de simulations longues climates longues de sensibilité.
Va laisser des instructions à Abderrahmane pour lancer.

Papiers :
---------
Papier LMDZ6A refusé à GMD pour raisons éditoriales.
   Frédéric va resoumettre à James.

Papier stratocumulus : accepté. Proofs en relecture.

Papier Bords Est soumis.

Frédérique va envoyer un draft à un certain nombre d'auteurs clé en fin de semaine.

Jean-Baptiste a fait une première introduction pour décrire tout ce qui a changé.
  * Travaille sur la partie résultats.
  * Amélioration Bords Est, couche limite.
  * Phase mixte.
  * Propriétés optiques des nuages, diags "à la Dimitra"
  * Impact des hypothèses de recouvrement.

(inchangé)
La dernière version de la documentation ES-DOC : https://explore.es-doc.org/cmip6/models
Papier bords Est (Fredho), presque bouclé
Papier général LMDZ6A, bien avancé (Fredho)
Gusts/z0 (Traore, figures en cours).
Nuages : Jean-Baptiste s'y remet
Splitting (Nicolas et Jean-Yves)
Convection/poches (Catherine)

tickets trac :
=========

Tour de table :
===========

Jean-Baptiste :
---------------
Mardi : réunion sur les besoins informatiques autour de la formation en modélisation à l'IPSL, dans le cadre notamment de l'EUR.
JB a obtenu un cluster pour les étudiants dans ce cadre pour faire tourner LMDZ.

Laurent :
-----------
Path

Ehouarn :
------------
Dernière version testée passe bien sur ada.
Mise en place de "Poulp" les mecredi : Point Organisés et Utiles LMDZ Planéto autour de Mars.
    S'intéresse à des outils comme slack.
Est-ce qu'on sépare les docs planéto et terrestre ?

Abdarrahmane :
---------------------
Passe

Ionela :
--------
- Question sur l'utilisation de COSP en instantannée. Devrait marcher (Abderrahmane)
- ECDYN et ECPHY ne sont pas le même fichier. Ne pointe pas sur le même fichier.
- Question sur les comptes idris : on n'aura plus qu'un seul compte.
     Il n'y aura pas ou quasi pas de recouvrement entre ada et Jeanzey.
- A relayé un message d'Olivier sur la SLP qui disait que c'était beaucoup mieux.
- se remet au nouveau calcul de T2m.

Frédérique :
----------------
- essaie de mettre à jour la chaîne Sirta. Va tourner sur climserv.
- essaie de tourner avec la version d'Agnès pour les nappes.

Frédéric :
----------
Riendotre.

23/9/2019

Compte rendu du poihl du 23/9/2019

1h40

Formation :
===========
Du 9 au 11 décembre.

Evolution du poihl :
====================
Début du poihl (12:00 - 12:30)
* Questions diverses (Formation, ...)
* tour de table des sujets à discuter.
* et revue du track.
Définition de deux ou trois sujets séparés à travailler en sous-groupes.

Deuxième partie (12:30 ...) :
* travail en sous groupe.
* Accompagnement par un outil de suivi de projets ?

e-contributions :
=============

Abderrahmane :
---------------------
1. Multi-Atlas :
  - a branché les atlas C-ESM-EP aux diagnos multi-atlas
  - a rajouté les diagnostiques des nuages (stratocumulus et coupes
verticales Calipso) mis en place pour les articles CMIP6 :
  - a commencé à remettre à jour  d’autres diagnos (ESM val Tool, PCMDI
Metrics)
https://vesg.ipsl.upmc.fr/thredds/fileServer/IPSLFS/fabric/lmdz/MultiSimu/LmdzOr11et2couches/ACCUEIL.html#
https://vesg.ipsl.upmc.fr/thredds/fileServer/IPSLFS/fabric/lmdz/MultiSimu/LmdzOr11et2couches/AXE3/LmdzOr11et2couches/StratosCalipso/index.html
https://vesg.ipsl.upmc.fr/thredds/fileServer/IPSLFS/fabric/lmdz/MultiSimu/LmdzOr11et2couches/AXE3.html
https://vesg.ipsl.upmc.fr/thredds/fileServer/IPSLFS/fabric/lmdz/MultiSimu/LmdzOr11et2couches/ESMVal_CVDP/index.html
https://vesg.ipsl.upmc.fr/thredds/fileServer/IPSLFS/fabric/lmdz/MultiSimu/LmdzOr11et2couches/PCMDI.html

2. Configurations zoomées :
  - a travaillé avec Abdoulaye suite à la réunion sur les configurations zoomées  en installant le modèle sur son compte ciclad : le tutorial (TP2 formation LMDZ sur le Zoom) a marché du 1er coup (version séquentielle) et a été testé avec un zoom sur le Sénégal allant jusqu’à 80km. Je l’ai testé également pour le Maroc en séquentiel et en parallèle sur ciclad.
- a commencé à réfléchir sur comment adapter sur d’autres machines (ciclad dans un 1er temps) le script tutorial_ada de Frédéric (qui permet de créer
l’état initial et les conditions aux limites pour un zoom donné et d’enchainer des simulation zoomées et/ou guidées)
- avec la résolution 144x142x79 : les tests  ont tourné sur ada (en utilisant le script tutorial_ada) et irene (en utilisant libIGCM) avec le même zoom
que celui du tutoral (grossism*=3) et sans aerosols pour LMDZ et sans routage pour Orchidee.
Je continue mes tests sur Irene avec libIGCM pour avoir une configuration zoomée (à partir de la résolution LR avec un zoom permettant d’atteindre 30km)
qui marche !

3. Cospv2 :
J'avais implémenté la version Cospv2 dans le modèle. Dans la suite, je commencerais un travail de validation pour que cette version soit opérationnel :
  - compiler et faire tourner en debug en local (sur carey) en suite sur Irene
  - comparaison des résultats aux obs et aux résultats de Cospv1,
  - exploiter les nouvelles sorties, comme les précips Cloudsat et autres (scripts pour diagnos avec comparaison aux obs)

Frédrique :
-----------
Papier:
Envoyé premier draft papier land-surface/atmosphere CMIP6 pour iteration et discussion.
Simulation temps réel
Discussion avec Ionela et Laurent. Wiki mis en place par laurent avec questions.
La version CMIP6 avec orchidee, lmdz et xios a tourné sur climserv t2m encore des choses a finaliser avec Ionela (mais pas pour les corrections a posteriori).

20/5/2019

Compte rendu du poihl du 20/5/2019

1h30

Informations diverses :
==================
CU idris le 6 juin
Ils veulent en profiter pour faire des comptes utilisateurs consommant sur plusieurs projets.
Ca compliquer la bascule des comptes.
Mise à jour des multi-modèles CMIP6 :
https://vesg.ipsl.upmc.fr/thredds/fileServer/IPSLFS/hourdin/C-ESM-EP/MIPsst_hourdin/C-ESM-EP_MIPsst.html

Discuter des tickets au prochain poihl

Codutil :
======
Composition du Codutil : Sébastien Fromang, Adriana Sima, Marion Marchand, Myriam Khodri . Prochaine réunion Pedalons le 24 juin.
Elle portera principalement sur les traceurs et les isotopes. Le thème de la réunion suivante sera la variabilité de la convection tropicale
Lundi matin, 7 ou 14 octobre.


Problème T2m :
============
Guillaume a commencé à passer les filtres sur les champs CMIP6.
Malheureusement, les DCPP n'ont pas l'humidité minimale en sortie.

Contrôle Qualité / trunk / scripts:
========================
ndayrain est faux pour un problème d'initialisation.
   Vérifier si c'est sorti pour CMIP6 (Ionela). Apres (re)verification, Ionela confirme que ndayrain n'est pas une variable CMIP6.
   Ionela va commettre une correction

XIOS ne marche plus depuis la 3509 sur ada, notamment parce qu'il y a de nouveaux "auto" dans les .xml
Ajout également d'un _reset_
Corriger les scripts install_lmdz (Abderrahmane) et tests ada (Ehouarn) en fonction.

(inchangé)
* Mettre une page contrôle qualité dans la partie développeurs où on explicite les 5 tests au moins.
* install_lmdz.sh ne marche pas sur irene
* l'état initial zoomé ne se crée pas sur irene avec libigcm.
Quand la prochaines version du couplé aura été finalisée sur libigcm (IPSL-CM6.2), faire les modifications suivantes dans install_lmdz.sh :
Passer au nouvel orchidee (svn 5004) par défaut. Fait en option.
La compilation avec XIOS n'est pas à jour pour Orchidee.

Vérifier si les problèmes de reproductibilité sur ada avec install_lmdz.sh sont résolus. (F&F) Qui semblaient être là même sans orchidee.
Ionela a un problème de divergence de résultats quand elle ajoute un diagnostic pour T2m.
Lionel a un problème en séquentiel sur ada. Tourne en debug mais pas en prod (testé sur irene : pas de problème. Laurent)

Evolution physique/versions futures :
============================
* Jean-Yves travaille sur la supression de l'eau liquide dans les ascendances adiabatiques d'Emanuel. Modifications commises
* Jean-Yves a commencé à regarder la conservation de l'énergie.
(inchangé)
* Modèle pronostic de densité de poches :
   Débugé dans le intercité
   Les pluies grande échelle sont revenues à la normale.
   C'est prêt à l'emploie 6B.
* Splitting des poches :
   Jean-Yves : toutes les équations sont simples et claires en cours de publi.en test
* Entrainement convectif / nouvel épluchage (à tester)
* Tube dentifrice (à tester)
* Eau avec source méthane
* sur-saturation

Tuning automatique :
================
RAS

Version 6B:
=========
(Inchangé)
* Reformulation des flux de masse dans le modèle du thermique (en cours d'ajustement)
* Abderrahmane a intégré les routines de Jean dans une version récente. Ca tourne. Prêt à être commis.
* Frédéric a défini une nouvelle version 95 niveaux.
Projet PRACE/QUEST déposé pour porter entre autre un modèle
MR025 : grille MR dans l'atmosphère et résolution 1/4° océan.
Début de l'allocation avril 2019.
Définir d'ici là, et tuner, une version nouvelle de la nouvelle physique.
* Correction T2m
* entrainement modifié des thermiques.!!
* densité de poches interactive : il faut rerégler la mousson.
* schéma vertical des nuages ? Le code n'est pas encore commis.

Convergence 1D std / Dephy :
=======================
Ehouarn a vu avec Marie-Pierre pour mettre le calendrier.
N'a pas marché à cause des problèmes du 1D.

Publications / documentation :
=======================
Décision concernant le fait de rejouer des simulations 5A, 5B, 6A sur SSTs climatiques pour alimenter les articles.
Avec les derniers sources.
Frédéric documente dans son article ces simulations pour le côté "rétrocompatibilité"

Pour la 5B, faire des simuklations avec l'ancien découpage nsplit_phys=2 sur des pas de temps physique de 15min
(pour la NPv3.1. Pour la NPv3.2 tourner avec des pas de temps de 15min)
Jean-Baptiste sur celui des nuages.

(inchangé)
Frédérique a démarré sur le papier sur le couplage continental.
  * regarde ce qui vient du couplage comme différence entre CMIP5 et CMIP6.
  * L'intermitence des pluies joue beaucoup sur les moyennes latitudes.
  * Couplage plus fort dans LMDZ6
  * Biais froid l'hivers dans les hautes latitudes.
Jean-Baptiste a commencé à regarder la partie phase mixte et le lien avec la dynamique.
Réfléchir à refaire des simulations 5A/5B climatiques propres.
Papier stratocumulus bouclé (Jam) : major revisions en cours.
La dernière version de la documentation ES-DOC :
https://docs.google.com/spreadsheets/d/1eSpROQVPsYLCh97RNZbeapbVSkaypeeVWYGjZpXDF5Y/edit#gid=766710776
Papier bords Est (Fredho), presque bouclé
Papier général LMDZ6A, bien avancé (Fredho)
Gusts/z0 (Traore, figures en cours).
Nuages : Jean-Baptiste s'y remet
Splitting (Nicolas et Jean-Yves)
Convection/poches (Catherine)


tickets trac :
=========
Ouvrir un ticket sur le fait de mettre des tendances en humidité relative.

Tour de table :
===========

Jean-Yves :
---------------
A fait des tests avec la précipitation de l'eau liquide sur Cindy.
Change le contraste d'humidité entre les deux périodes.
Ecart d'humidité relative : 30% sans précipité, 50% en précipitant
Suggère de sortir des tendances d'humidité relative (= faire un calcul simple au pas de temps du modèle et cumuler)

Ehouarn :
-------------
Déjatroparlé

Jean-Baptiste :
-------------------
Riendotre

Ionela :
---------
Rien d'autre.

Adriana :
------------
Prépare une présentation RFMIP pour Bordeaux

Abderrahmane :
--------------------
Travaille sur Cosp2.
Commissions
Problèmes sur irene : bloqué par XIOS qui n'arrive pas à écrire des variables.
En revanche ca marche sur carey (gfortran).
Ce qui montre au passage que le install_lmdz.sh marche avec XIOS et Cosp.
Arnaud suggère de forcer la double précision.
Permet de passer sur irene. Va regarder aussi en debug.

Problème avec les .xml
Les fichiers cosp ont changé.
Va créé deux séries de xml pour Cosp. (cospv2)

A commencé à préparer les simulations pour les articles.
A lancé une version à 39 niveaux.

Lidia:
-------

Les Multi-Atlas de l'ensemble des amip historiques Irène de CMIP6/GMMIP :
https://vesg.ipsl.upmc.fr/thredds/fileServer/IPSLFS/fabric/lmdz/MultiSimu/AmipHistCMIP6.2/ACCUEIL.html

Les observations utilisées dans les Multi-Atlas, sont précisées dans les fichiers des variables résultats, merci à Jerôme Servonnat pour ces précisions :
pr :    pr:long_name = "Long Term Mean: Monthly Rate of Precipitation" ;
        pr:dataset = "GPCP Version 2x79 Experimental Combined
Precipitation" ;
        :title = "Long Term Mean GPCP Version 2x79 Experimental Combined Precipitation" ;

tas :   tas:long_name = "2 metre temperature" ;
        :title = "ERA-Interim" ;
        :description = "Data are from ECMWF ERA Interim archive (Monthly means of daily means)" ;

rlut :  rlut:long_name = "TOA Outgoing Longwave Radiation" ;
        rlut:units = "W m-2" ;
        rlut:associated_files = "baseURL: http://cmip-pcmdi.llnl.gov/CMIP5/dataLocation gridspecFile: gridspec_atmos_fx_Obs-CERES
EBAF_obs_r0i0p0.nc areacella: areacella_fx_Obs-CERES-EBAF_obs_r0i0p0.nc"
;

prw :   prw:standard_name = "atmosphere_mass_content_of_water_vapor" ;
        prw:long_name = "NVAP-M Climate Total Column Water Vapor" ;
        :title = "Obs-CERES-EBAF model output prepared for obs4MIPs OBSERVATIONS" ;
        :institution = "NASA Langley Research Center, Hampton, Va, USA";

ta :    ta:long_name = "Temperature" ;
    :title = "ERA-Interim" ;
    :data_type = "Monthly mean fields" ;
    :generic_parameter_name = "Temperature" ;
    :category_name = "Atmospheric Temperature" ;
        :description = "Data are from ECMWF ERA Interim archive (Monthly means of daily means)" ;

ua :    :title = "ERA-Interim" ;
        :data_type = "4xdaily fields in analysis" ;
    :generic_parameter_name = "Eastward wind component" ;
    :category_name = "Atmospheric Winds" ;
    :description = "Data are from ECMWF ERA-Interim reanalysis" ;

hur :   hur:long_name = "Relative humidity" ;
    hur:units = "%" ;
    :data_type = "4xdaily fields in analysis" ;
        :category_name = "Atmospheric Water Vapor" ;
        :description = "Data are from ECMWF ERA-Interim reanalysis" ;

psl :   psl:long_name = "Mean sea level pressure" ;
        psl:units = "Pascal" ;
        psl:history = "From msl.199901.ashei.GLOBAL_075" ;


Frédéric :
------------
RAS

21/1/2019

Compte rendu du Poihl du 21/1/2019

Durée: 1h20

Prochaine formation LMDZ :
==========================
Mettre au propre les échange les échanges de mails / debrief.
Faire un google doc.
Demander à Marie-Pierre d'ajouter les informations pratiques sur
l'organisation
(HOWTO)
Marie-Pierre va faire la synthèse du sondage.


Consolidation LMDZ6 :
=====================

Basculer sur les compilo 2017.2 sur ada.
   * Déjà fait sur libigcm.
   * Frédéric va essayer de faire le passage sur ada
   * L'option d'intialisation à Nan marche en 2017.2

(inchangé)

Vérifier si les problèmes de reproductibilité sur ada avec
install_lmdz.sh sont résolus. (F&F) Qui semblaient être là même
sans orchidee.

Ionela a un problème de divergence de résultats quand elle ajoute un
    diagnostic pour T2m.

Lionel a un problème en séquentiel sur ada. Tourne en debug mais pas
    en prod.
    A faire : à tester sur irene.


Problème de diagnostics pour T2m :
----------------------------------
Méthode fixée : quand on détecte des humidités négatives,
on interpolle dans le temps T2mmax et rh2min/rh2m, depuis le jour
précédent et suivant, puis en corrigeant T2m en remplacant 1/96eme.
Code fortran passé à Yann, interfacé avec XIOS.
1min30 pour traiter T2max sur une simulation AMIP.

Frédérique a avancé sur la compréhension des qsurf < 0
qsurf donné par Orchidee faux pour plusieurs raisons :

rho CD V ( q - qsurf ) = Flux orchidee = rho CD V beta ( q - qsat )
donne des qsurf=(1-beta) q + beta qsat
alors que le qsurf renvoyé par orchidee est beta qsat.

D'autre part orchidee peut renvoyer une valeur très forte de beta
et qsurf peut devenir subitement très grand en l'absence de turbulence
et même pour un sol non saturé. Est-ce normal ?

Ionela a lancé de nouveaux tests pour servir de contrôle pour
les corrections a posteriori en ajoutant des sorties.


Haute résolution + dynamico :
-----------------------------

Branche icoshèdre mergée avec trunk la svn 3412.

Laurent
avait des problèmes pour faire tourner la vrai trunk en mode debug.
Dû a des variables non initialisées dans les aérosols.
Convergence entre la vraie trunk et la version mergée dynamico
   en version 6.1 avec RRTM et aérosols.
A fait un update avec les 7 modifs faites depuis sur la trunk
   et ca marche toujours.
A toujours des problèmes XIOS avec la version dynmico.

Il y a une interaction avec Orchidee.
On a changé des choses dans surf_land_orchidee pour pouvoir passer
des information sur la grille dans le cas où la grille est non structurée.
Yann a prévu un surf_land_orchidee_nounstruct.
Deux branches d'orchidee 2.0 ou 2.1
Si on utilise surf_land_orchidee_nounstruct on peut tourner avec les
deux branches.
Avec surf_land_orchidee on est obligé de passer sur orchidee 2.1
A gérer par une nouvelle clé CPP gérée dans makelmdz et makelmdz_fcm.

Dans read_limit, il y a un test pour savoir quand lire les nouvelles
conditions.
A cause d'XIOS, Yann a été obligé de changer ce test.
Ca donne un décalage d'un pas de temps de la physique.
Faire une commission spécifique.



Contrôle Qualité / trunk / scripts
==================================

(inchangé)
Passer au nouvel orchidee par défaut.
       Fait en option.
La compilation avec XIOS n'est pas à jour pour Orchidee.


Version 6B
==========
Projet PRACE/QUEST déposé pour porter entre autre un modèle
MR025 : grille MR dans l'atmosphère et résolution 1/4° océan.
Début de l'allocation avril 2019.
Définir d'ici là, et tuner, une version nouvelle de la nouvelle physique.
* Correction T2m
A compléter ...

Articulation convection profonde / convection peu profonde
==========================================================

* Jean-Yves travaille sur le transport des précipitations dans les
    ascendances convective.
* Modèle pronostic de densité de poches : a commencé à faire tourner
    les 1D. Des pauses apparaissent dans TWPICE.
    ID : activer la création des poches par les pluies grande échelle.
(inchangé)
* Jean-Yves : toutes les équations sont simples et claires en cours de
publi.
* Splitting des poches : en test
* Entrainement convectif / nouvel épluchage (à tester)
* Tube dentifrice (à tester)

Evolution physique/versions futures :
=====================================
(inchangés ci-dessous)
* Eau avec source méthane
* sur-saturation

Tuning automatique :
====================
(inchangés ci-dessous)
Frédéric a retravaillé sur les scripts csv avec Fleur et Najda
Relance des ateliers les mardi après-midi.


Convergence 1D std / Dephy :
============================


Publications / documentation :
==============================
Papier stratocumulus bouclé (Jam)
Papier bords Est (Fredho), presque bouclé
Papier général LMDZ6A, bien avancé (Fredho)
Frédérique confirme qu'elle va écrire une publi sur le forçage à la
surface
Gusts/z0 (Traore, figures en cours).
Nuages : Jean-Baptiste s'y remet
Splitting (Nicolas et Jean-Yves)
Convection/poches (Catherine)



tickets trac :
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(inchangé)
#9     Modifications pour une dynamique commune (terre – planete)
#11     Menage sur les prints
#21     "day_ini" dans "create_etat0_limit" et "gcm"
#28     Initialisation problems in cloudth ?
#30     Pb valeurs nulles/non définies sur configs linux
#32     Concervation de la masse des traceurs dans la dynamique
#34     Calving faux en zoome
#44     getin_dump et name
#52     readchlorophyll en OpenMP?
#54     Erreur sur la vorticité en mode zoomé
#55     Constantes non uniformes dans le modèle
#56     Vérifier le calcul des nombres de jours de pluie
#61     Calendrier
#66     Sensibilité au pas de temps de la fermeture stochastique
#67     Traceurs et isotopes.
#70     Conservation de l'énergie avec l'eau
#71     Filtrage de la vorticité
#75     ppm3d non fonctionnel
#76     Sortie epmax
#82     Nouveau calcul de wind10m
#84     Use getin_p instead of getin
#85     Rayonnement dans le 1D
#86     Get rid of "stop" comands in phylmd
#88     routines cldrag
#89     Problèmes grille zoomée :
#90     Nbre d'appel à cdrag buggé?
#91     iflag_con et restartabilité du modèle
#92     Incohérence paramètres d'overlap des nuages
#93     Plantage à la ligne de changement de date
#94     Problème de reproductibilité
#95     Problème de reproductibilité
le #94 doit pouvoir être fermé


Tour de table :
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Ehouarn :
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Demandes genci A6 pour très bientôt.
Remplir LMDZpedia. Jean-Yves se pose la question du titre.
Ehouarn propose qu'on mette une date de ponte (dixit Adriana)
Un responsable ?

Adriana :
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Travaille sur les analyses RFMIP
Publications demain sur ESGF

Frédérique :
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q2m, T2m, q2m, T2m, q2m, T2m, q2m, T2m, q2m ...
Demande de simulations à 50km pour la polution pour les
entrées dans les urgences.

Laurent :
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Ico n'co.

Jean-Yves :
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qv n'est pas = qsat en atmosphère saturée !

Abderrahmane :
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Passe

Ionela :
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T2m, q2m, T2m, q2m, T2m, q2m, T2m, q2m, T2m ...


Frédéric :
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Travaille sur l'automatisation des scripts avec zoom et guidage sur ada.
Travaille sur l'automatisation des scripts csv pour high-tune.

21/10/2019

Compte rendu du poihl du 21/10/2019

durée 37 minutes

Discussions
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Jean-Zay:
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- Ehouarn: a créé un script de test 3D (quelques subtilités avec XIOS: http://web.lmd.jussieu.fr/trac/wiki/PortageJeanZay)
- Ionela: pbs avec XIOS justement => à regarder durant la 2ème partie du POIHL
- Fred: problèmes avec ORCHIDEE

Edu-planet/Edu-Earth:
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- Ca marche avec fcm sur les machines de l'université.
- Prochaine étape: passer au parallèle.

Formation
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- on aura une pause café

Pédalon
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- les présentations sont sur le site et le slack
- liste de communication : les annonces passent par la liste lmdz, qui va être modérée (Laurent, Ehouarn, Adriana)
- prochaine date: le 13 ou le 20 janvier; plus probablement le 20. Thème: les études régionales avec le zoom.
- nouveau format: Matinée présentations/discussions et après-midi ateliers.
- Journée utilisateurs en juin prochain.

Trac
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- pas le temps (ni Laurent) aujourd'hui pour faire le point.

22/4/2019

Pas de poihl pour cause de Lundi de Paques