04/02/2013
Compte Rendu du Point Hebdomadaire LMDZ étendu du 04/02/2013
Martin Menegoz:
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+ nouveau postdoc LGGE/LMD jusqu'à ~fin 2013 qui va travailler à
intégrer le modèle MAR dans l'architecture IPSL afin d'échanger les
dynamiques et les physiques des deux modèles. Travaille avec Fred,
Laurent, H.Gallée, G.Krinner.
+ va d'abord installer SISVAT (le schéma de sol de MAR) dans LMDZ.
Puis installera la physique de MAR dans LMDZ
>>>>> Marie-Alice suggère qu'une réunion soit organisée pour que les
choix informatiques soient présentés et discutés et que ce soit l'occasion
de finaliser et diffuser les coding rules par exemple.
Jean-Yves:
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+ Transport et lessivage du Beryllium: le modèle est maintenant
conservatif. Bons résultats en 1D sur les cas Toga et TWPICE. A
commettre dans le 3D.
+ Avec Robin Locatelli, a travaillé sur la conservation des
traceurs. Ca fonctionne maintenant et cela a permis de découvrir deux bugs
+ travaille sur des scripts "automatiques" pour tester la
conservation de l'eau. L'eau n'est pas conservée dans le schéma de
convection. Camille signale qu'il faut aussi surveiller l'eau négative.
+ variable ftsoil déclarée PRIVATE: que faut-il faire pour y
accéder dans lmdz1d.F, pour faire du nudging sur la température du sol à
une certaine profondeur ? Yann: "déprivatiser" ou bien faire remonter
par l'interface. S'inspirer de ce qui est fait sur le guidage en albedo
dans ORCHIDEE.
Adriana:
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+ a assisté à une formation "débogage" organisée (pour la première
fois) à la Maison de la Simulation par M.Mancip et R. David
(Strasbourg). Des présentations et TDs ont donné un aperçu sur plusieurs
logiciels de débogage de code séquentiel ou parallèle : gdb, ddd,
Valgrind, Eclipse, DDT. Les plus intéressants pour utilisation avec le
modèle de l'IPSL sont vraisemblablement DDT et TotalView (non présenté
cette fois-ci), disponibles au TGCC et IDRIS. La formation n'ayant pas
la vocation de traiter de cas particulier de code ou centre de calcul,
pour commencer à travailler avec ces logiciels, il faudrait consulter la
documentation disponible aux centres de calcul.
>>>>> A sa demande, Anne dit être disponible en mars pour faire une initiation informelle.
Intéressant : la dernière version de DDT, que le représentant de Allinea nous a présentée, est plus
performante que celle disponible sur les machines du TGCC. Elle peut être liée au "VisIt visualisation tool",
donnant la possibilité de visualiser des données directement à partir du code, pendant que la
simulation tourne. (ma question : pourrait-on demander une MAJ? )
+ simulations LMDZORINCA MR prévues initialement sur Titane pourraient être lancées sur Curie
--> Anne va rajouter la possibilité d'utiliser LMDZORINCA_v5 en 19 niveaux ;
--> Marie-Alice attire l'attention sur les rebuilds très longs en MR ; Yann : ce
problème pourrait être résolu par l'utilisation de XIOS, probablement possible avec LMDZORINCA dans 1-2 mois
Marie-Pierre:
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+ cas AMMA organisé dans le cadre d'Embrace. Deux jeux de données
ont été fournis à F.Couvreux: en juin 2012 et janvier 2012. Les
résultats sont différents en particulier concernant l'heure de
déclenchement de la convection. Recherche si les différences viennent
des versions utilisées du modèle (qui sont différentes) ou bien des
forçages légèrement différents eux aussi.
Marie-Alice:
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+ L'actualité est le passage sur la nouvelle machine ADA en faisant
par exemple tourner une config du modèle bien connue. Les post
traitements sont faits maintenant sur ADA directement. Il est recommandé
de demander des quota importants en workdir par groupe. Besoin d'être
nombreux sur ces essais sinon, on ne verra pas tous les problèmes.
Laurent s'y met. Camille propose de mettre les isotopes en standard dans
le modèle quand il tournera sur ADA.
+ Réponse à l'ANR "méthodes numériques" portée par S.Denvil et JLD.
A rendre pour le 12/2. Il s'agit de préparer la future infrastructure de
CMIP6 pour lancer en masse des runs et faire de l'analyse en masse.
Implique, outre l'IPSL: Idris, TGCC, maison de la simulation, CNRM, Cerfacs.
Yann:
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+ XIOS qui va maintenant gérer les sorties du modèle à la place de
ioipsl. Nemo l'utilise déjà en standard. XIOS fonctionne avec Orchidee
et Inca. Supprimera l'étape "rebuild". Il est necessaire d'avoir MPI
pour faire tourner XIOS.
>>>>> Prévoit de faire un exposé à Jussieu sur le sujet.
Camille:
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+ a tourné "jusqu'au dernier moment" sur Vargas en particulier avec
LMDZ nouvelle physique et les isotopes.
+ a aussi fait une simulation 1871-2008 en guidé basse résolution
(96x71) sur Vargas
+ simulation en mode "strato" à 39 niveaux avec modifications de
Marine sur la sursaturation.
+ premiers résultats du simulateur AIRS développé par Marine.
Anne:
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+ modifié pres2lev pour qu'il puisse tourner sur Curie
+ vers le mois de mars, veut bien faire un formation "informelle" à
TotalView et DDT sur les machines du TGCC
+ demande une nouvelle version de LMDZ qui inclue la modif pres2lev
afin qu'elle puisse la distribuer. Laurent suggère de prendre la
dernière testing avec sa modif.
+ souci quand on fait tourner LMDZ en mode OMP sur Curie et en
changeant le nombre de processeurs: il y a des différences
significatives au bout d'un mois. Va refaire un test sur Titane. A creuser.
+ Va relancer des bouts de simulations CMIP avec INCA online et non
pas offline.
+ à tester la suggestion de Ionela sur le traitement des SSTs dans la création des fichiers *limit.nc <http://limit.nc> : "remplacer les missing value à zéro des continents par
des tsol de erai par exemple .... Par contre, il faut vérifier ce que ça fait sur les cotes".
Abderrahmane:
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+ Mise à disposition d'une nouvelle simulation dans la série des
réglages avec le déclenchement stokastique de la convection
+ A fait des commits en 1D demandés par Fred
+ A fait des commits sur les aérosols demandés par Olivier
Laurent:
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+ Pensait finir les runs AMIP sur la MJO (Vargas) mais plantage
dans hgardfou. Relancé avec des valeurs perturbées de Tsol (méthode
F.Cheruy et A.Campoy) et ca passe. Va commettre la modification et
passera ensuite sur ADA.